WikiDer > ARHGEF1

ARHGEF1
ARHGEF1
Белок ARHGEF1 PDB 1iap.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыARHGEF1, GEF1, LBCL2, LSC, P115-RHOGEF, SUB1.5, фактор обмена нуклеотидов гуанина 1, IMD62
Внешние идентификаторыOMIM: 601855 MGI: 1353510 ГомолоГен: 3454 Генные карты: ARHGEF1
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение ARHGEF1
Геномное расположение ARHGEF1
Группа19q13.2Начните41,883,161 бп[1]
Конец41,930,150 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ARHGEF1 203055 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004706
NM_198977
NM_199002

NM_001130150
NM_001130151
NM_001130152
NM_001130153
NM_008488

RefSeq (белок)

NP_004697
NP_945328
NP_945353

NP_001123622
NP_001123623
NP_001123624
NP_001123625
NP_032514

Расположение (UCSC)Chr 19: 41,88 - 41,93 МбChr 7: 24.9 - 24.93 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор обмена нуклеотидов гуанина 1 это белок что у людей кодируется ARHGEF1 ген.[5][6][7] Этот белок также называют RhoGEF1 или p115-RhoGEF.

Функция

Фактор обмена нуклеотидов гуанина 1 равен фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (ГЭФ) для RhoA малая ГТФаза белок.[8] Ро - это малая ГТФаза белок, который неактивен при связывании с гуанин нуклеотид ВВП. Но при воздействии на него белков Rho GEF, таких как RhoGEF1, этот GDP высвобождается и заменяется GTP, что приводит к активному состоянию Rho. В этой активной, GTP-связанной конформации Rho может связываться и активировать специфические эффектор белки и ферменты регулировать клеточные функции.[9] В частности, активный Rho является основным регулятором клетки. актин цитоскелет.[9]

RhoGEF1 является членом группы из четырех белков RhoGEF, которые, как известно, активируются G-белковые рецепторы в сочетании с г12 и G13 гетеротримерные G-белки.[10][11] Остальные ARHGEF11 (также известный как PDZ-RhoGEF), ARHGEF12 (также известный как LARG) и AKAP13 (также известный как ARHGEF13 и Lbc). [12][13] GPCR-регулируемый RhoGEF1 (и эти родственные GEF белки) действует как эффектор для G12 и G13 G белки. Помимо активации G12 или G13 G, три из этих четырех белков RhoGEF (ARHGEF1 / 11/12) также функционируют как Семья РГО Белки, активирующие ГТФазу (GAP) для увеличения скорости гидролиза GTP G1213 альфа-белки (которые сами являются белками GTPase). Это действие увеличивает скорость дезактивации G-белка, ограничивая время, в течение которого эти RhoGEF активируют Rho.[14]

Для этого гена было идентифицировано множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, но полноразмерная природа и функция некоторых вариантов не определены.[7]

Взаимодействия

ARHGEF1 было показано взаимодействовать с участием:

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000076928 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040940 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Hart MJ, Sharma S, elMasry N, Qiu RG, McCabe P, Polakis P, Bollag G (октябрь 1996 г.). «Идентификация нового фактора обмена гуаниновых нуклеотидов для Rho GTPase». Журнал биологической химии. 271 (41): 25452–8. Дои:10.1074 / jbc.271.41.25452. PMID 8810315.
  6. ^ Aasheim HC, Pedeutour F, Smeland EB (апрель 1997 г.). «Характеристика, экспрессия и хромосомная локализация человеческого гена, гомологичного онкогену Lsc мыши, с самой сильной экспрессией в гематопоэтических тканях». Онкоген. 14 (14): 1747–52. Дои:10.1038 / sj.onc.1200994. PMID 9135076. S2CID 24528606.
  7. ^ а б "Ген Entrez: ARHGEF1 фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) 1".
  8. ^ Hart MJ, Sharma S, elMasry N, Qiu RG, McCabe P, Polakis P, Bollag G (октябрь 1996 г.). «Идентификация нового фактора обмена гуаниновых нуклеотидов для Rho GTPase». Журнал биологической химии. 271 (41): 25452–8. Дои:10.1074 / jbc.271.41.25452. PMID 8810315.
  9. ^ а б Тумкео Д., Ватанабе С., Нарумия С. (октябрь – ноябрь 2013 г.). «Физиологические роли эффекторов Rho и Rho у млекопитающих». Европейский журнал клеточной биологии. 92 (10–11): 303–15. Дои:10.1016 / j.ejcb.2013.09.002. PMID 24183240.
  10. ^ Kozasa T, Jiang X, Hart MJ, Sternweis PM, Singer WD, Gilman AG и др. (Июнь 1998 г.). «p115 RhoGEF, белок, активирующий GTPase для Galpha12 и Galpha13». Наука. 280 (5372): 2109–11. Дои:10.1126 / science.280.5372.2109. PMID 9641915.
  11. ^ а б Харт MJ, Jiang X, Kozasa T., Roscoe W., Singer WD, Gilman AG и др. (Июнь 1998 г.). «Прямая стимуляция активности обмена гуаниновых нуклеотидов p115 RhoGEF с помощью Galpha13». Наука. 280 (5372): 2112–4. Дои:10.1126 / science.280.5372.2112. PMID 9641916.
  12. ^ Фукухара С., Чикуми Х., Гуткинд Дж. С. (март 2001 г.). «RGS-содержащие RhoGEF: недостающее звено между трансформирующими G-белками и Rho?». Онкоген. 20 (13): 1661–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1204182. PMID 11313914.
  13. ^ Дивиани Д., Содерлинг Дж., Скотт Дж. Д. (ноябрь 2001 г.). «AKAP-Lbc закрепляет протеинкиназу А и зародыширует Galpha 12-селективное Rho-опосредованное образование стрессовых волокон». Журнал биологической химии. 276 (47): 44247–57. Дои:10.1074 / jbc.M106629200. PMID 11546812.
  14. ^ Козаса Т. (апрель 2001 г.). «Регулирование опосредованной G-белком передачи сигнала белками RGS». Науки о жизни. 68 (19–20): 2309–17. Дои:10.1016 / S0024-3205 (01) 01020-7. PMID 11358341.
  15. ^ а б Johnson EN, Seasholtz TM, Waheed AA, Kreutz B, Suzuki N, Kozasa T. и др. (Декабрь 2003 г.). «RGS16 ингибирует передачу сигналов через ось G альфа 13-Rho». Природа клеточной биологии. 5 (12): 1095–103. Дои:10.1038 / ncb1065. PMID 14634662. S2CID 6798899.
  16. ^ Холинстат М., Мехта Д., Козаса Т., Миншалл Р.Д., Малик А.Б. (август 2003 г.). «Протеинкиназа Calpha-индуцированное фосфорилирование p115RhoGEF сигнализирует о перестройке эндотелиального цитоскелета». Журнал биологической химии. 278 (31): 28793–8. Дои:10.1074 / jbc.M303900200. PMID 12754211.

внешние ссылки

дальнейшее чтение