WikiDer > ARHGEF11

ARHGEF11
Доступные конструкции
PDB	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1HTJ, 1XCG, 2DLS, 3KZ1, 3T06, 5E6P
Идентификаторы
Псевдонимы	ARHGEF11, GTRAP48, PDZ-RHOGEF, Фактор обмена нуклеотидов гуанина 11
Внешние идентификаторы	OMIM: 605708 MGI: 2441869 ГомолоГен: 11409 Генные карты: ARHGEF11
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 1 (человек)
Конец	157,045,370 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 3 (мышь)
Конец	87,738,034 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase; • GO: 0001948 связывание с белками; • Активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Rho; • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов; • Связывание с рецептором, сопряженным с G-белком;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • цитозоль; • мембрана;
Биологический процесс	• Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком; • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • регулирование роста клеток; • Передача сигнала белка Rho; • установление полярности клеток; • положительная регуляция апоптотического процесса; • регуляция передачи сигнала белка Rho; • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase; • поперечно-полосатое сокращение мышц; • организация актинового цитоскелета; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	9826
	213498
	ENSG00000132694
	ENSMUSG00000041977
	O15085
	н / д
	NM_014784; NM_198236; NM_001377418; NM_001377419
	NM_001003912; NM_001360195; NM_001360197
	NP_055599; NP_937879; NP_001364347; NP_001364348
	н / д
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

ARHGEF11

Фактор обмена нуклеотидов гуанина 11 это белок что у людей кодируется ARHGEF11 ген.^[5]^[6]^[7] Этот белок также называют RhoGEF11 или PDZ-RhoGEF.

Функция

Фактор обмена нуклеотидов гуанина 11 равен фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (ГЭФ) для RhoA малая ГТФаза белок.^[8] Ро - это малая ГТФаза белок, который неактивен при связывании с гуанин нуклеотид ВВП. Но при воздействии на него белков Rho GEF, таких как RhoGEF1, этот GDP высвобождается и заменяется GTP, что приводит к активному состоянию Rho. В этой активной, GTP-связанной конформации Rho может связываться и активировать специфические эффектор белки и ферменты регулировать клеточные функции.^[9] В частности, активный Rho является основным регулятором клетки. актин цитоскелет.^[9]

RhoGEF11 является членом группы из четырех белков RhoGEF, которые, как известно, активируются G-белковые рецепторы в сочетании с г₁₂ и G₁₃ гетеротримерные G-белки.^[8] Остальные ARHGEF1 (также известный как p115-RhoGEF), ARHGEF12 (также известный как LARG) и AKAP13 (также известный как ARHGEF13 и Lbc). ^[10]^[11] Регулируемый GPCR RhoGEF11 (и эти родственные GEF белки) действует как эффектор для G₁₂ и G₁₃ G белки. Помимо активации G₁₂ или G₁₃ G, три из этих четырех белков RhoGEF (ARHGEF1 / 11/12) также функционируют как Семья РГО Белки, активирующие ГТФазу (GAP) для увеличения скорости гидролиза GTP G₁₂/Г₁₃ альфа-белки (которые сами являются белками GTPase). Это действие увеличивает скорость дезактивации G-белка, ограничивая время, в течение которого эти RhoGEF активируют Rho.^[12]

Были описаны два альтернативных транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[7]

Взаимодействия

ARHGEF11 было показано взаимодействовать с участием:

Смотрите также

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000132694 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041977 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ^а ^б Рюменапп Ю., Бломквист А., Шверер Г., Шабловски Н., Псома А., Якобс К. Х. (октябрь 1999 г.). «Rho-специфическое связывание и катализ обмена гуаниновых нуклеотидов с помощью KIAA0380, члена семейства dbl». Письма FEBS. 459 (3): 313–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01270-3. PMID 10526156.
^ Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д., Охира М., Секи Н., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (апрель 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК исследования. 4 (2): 141–50. Дои:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID 9205841.
^ ^а ^б "Ген Entrez: ARHGEF11 Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) 11".
^ ^а ^б Фукухара С., Мурга С., Зохар М., Игиши Т., Гуткинд Дж. С. (февраль 1999 г.). «Новый PDZ-домен, содержащий фактор обмена гуаниновых нуклеотидов, связывает гетеротримерные G-белки с Rho». Журнал биологической химии. 274 (9): 5868–79. Дои:10.1074 / jbc.274.9.5868. PMID 10026210.
^ ^а ^б Thumkeo, D; Ватанабэ, S; Нарумия, С (октябрь – ноябрь 2013 г.). «Физиологические роли эффекторов Rho и Rho у млекопитающих». Европейский журнал клеточной биологии. 92 (10–11): 303–315. Дои:10.1016 / j.ejcb.2013.09.002. PMID 24183240.
^ Фукухара С., Чикуми Х., Гуткинд Дж. С. (2001). «RGS-содержащие RhoGEF: недостающее звено между трансформирующими G-белками и Rho?». Онкоген. 20 (13): 1661–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1204182. PMID 11313914.
^ Дивиани, Д; Содерлинг, Дж; Скотт, JD (ноябрь 2001 г.). «AKAP-Lbc закрепляет протеинкиназу А и зародыширует Galpha 12-селективное Rho-опосредованное образование стрессовых волокон». Журнал биологической химии. 276 (47): 44247–44257. Дои:10.1074 / jbc.M106629200. PMID 11546812.
^ Козаса Т. (2001). «Регулирование опосредованной G-белком передачи сигнала белками RGS». Life Sci. 68 (19–20): 2309–17. Дои:10.1016 / S0024-3205 (01) 01020-7. PMID 11358341.
^ ^а ^б Чен, Z; Певица, WD; Данеш С.М.; Стернвайс, ПК; Спранг, SR (октябрь 2008 г.). «Распознавание активированных состояний Galpha13 доменом rgRGS PDZRhoGEF». Структура. 16 (10): 1532–1543. Дои:10.1016 / j.str.2008.07.009. ЧВК 2586972. PMID 18940608.
^ ^а ^б ^c Перро В., Васкес-Прадо Дж., Гуткинд Дж. С. (ноябрь 2002 г.). «Плексин B регулирует Rho через факторы обмена гуаниновых нуклеотидов, связанные с лейкемией, Rho GEF (LARG) и PDZ-RhoGEF». Журнал биологической химии. 277 (45): 43115–20. Дои:10.1074 / jbc.M206005200. PMID 12183458.
^ ^а ^б Swiercz JM, Kuner R, Behrens J, Offermanns S (июль 2002 г.). «Plexin-B1 напрямую взаимодействует с PDZ-RhoGEF / LARG, чтобы регулировать RhoA и морфологию конуса роста». Нейрон. 35 (1): 51–63. Дои:10.1016 / S0896-6273 (02) 00750-X. PMID 12123608.
^ Ойнума И., Като Х., Харада А., Негиси М. (июль 2003 г.). «Прямое взаимодействие Rnd1 с Plexin-B1 регулирует PDZ-RhoGEF-опосредованную активацию Rho с помощью Plexin-B1 и индуцирует сокращение клеток в клетках COS-7». Журнал биологической химии. 278 (28): 25671–7. Дои:10.1074 / jbc.M303047200. PMID 12730235.
^ Хиротани М., Охока Ю., Ямамото Т., Нирасава Х., Фуруяма Т., Кого М., Мацуя Т., Инагаки С. (сентябрь 2002 г.). «Взаимодействие плексина-B1 с PDZ-доменом, содержащим факторы обмена генов гуаниновых нуклеотидов». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 297 (1): 32–7. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02122-8. PMID 12220504.

дальнейшее чтение

Тогаши Х., Нагата К., Такагиси М., Сайто Н., Инагаки М. (сентябрь 2000 г.). «Функции rho-специфического фактора обмена гуаниновых нуклеотидов в ретракции нейритов. Возможная роль богатого пролином мотива KIAA0380 в локализации». Журнал биологической химии. 275 (38): 29570–8. Дои:10.1074 / jbc.M003726200. PMID 10900204.
Джексон М., Сонг В., Лю М.Ю., Джин Л., Дайкс-Хоберг М., Лин К.И., Бауэрс В.Дж., Федерофф Г.Дж., Стернвейс П.С., Ротштейн Д.Д. (март 2001 г.). «Модуляция нейронального транспортера глутамата EAAT4 двумя взаимодействующими белками». Природа. 410 (6824): 89–93. Дои:10.1038/35065091. PMID 11242047.
Лонгенекер К.Л., Льюис М.Э., Чикуми Х., Гуткинд Дж.С., Деревенда З.С. (июль 2001 г.). «Структура RGS-подобного домена из PDZ-RhoGEF: связывание передачи сигналов, связанных с гетеротримерным g-белком, с Rho GTPases». Структура. 9 (7): 559–69. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00620-7. PMID 11470431.
Перро В., Васкес-Прадо Дж., Гуткинд Дж. С. (ноябрь 2002 г.). «Плексин B регулирует Rho через факторы обмена гуаниновых нуклеотидов, связанные с лейкемией, Rho GEF (LARG) и PDZ-RhoGEF». Журнал биологической химии. 277 (45): 43115–20. Дои:10.1074 / jbc.M206005200. PMID 12183458.
Driessens MH, Olivo C, Nagata K, Inagaki M, Collard JG (октябрь 2002 г.). «B-плексины активируют Rho через PDZ-RhoGEF». Письма FEBS. 529 (2–3): 168–72. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03323-9. PMID 12372594.
Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (ноябрь 2002 г.). «Белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК». Геномные исследования. 12 (11): 1773–84. Дои:10.1101 / гр. 406902. ЧВК 187542. PMID 12421765.
Барак А., Базиль Дж., Васкес-Прадо Дж., Гао Й., Чжэн И., Гуткинд Дж. С. (февраль 2004 г.). «Прямое взаимодействие активированной p21 киназы 4 с PDZ-RhoGEF, G-белком Rhoguanine exchange factor». Журнал биологической химии. 279 (7): 6182–9. Дои:10.1074 / jbc.M309579200. PMID 14625312.
Давидкова Г., Маккаллумсмит Р. Э., Мидор-Вудрафф Дж. Х. (ноябрь 2003 г.). «Экспрессия мРНК ARHGEF11 в таламусе шизофреников» (PDF). Летопись Нью-Йоркской академии наук. 1003: 375–7. Дои:10.1196 / летопись.1300.030. PMID 14684465.
Banerjee J, Wedegaertner PB (апрель 2004 г.). «Идентификация новой последовательности в PDZ-RhoGEF, которая опосредует взаимодействие с актиновым цитоскелетом». Молекулярная биология клетки. 15 (4): 1760–75. Дои:10.1091 / mbc.E03-07-0527. ЧВК 379273. PMID 14742719.
Ван Кью, Лю М., Козаса Т., Ротштейн Д.Д., Стернвейс П.С., Нойбиг Р.Р. (июль 2004 г.). «Рецепторы тромбина и лизофосфатидовой кислоты используют различные rhoGEF в клетках рака простаты». Журнал биологической химии. 279 (28): 28831–4. Дои:10.1074 / jbc.C400105200. PMID 15143072.
Го Х, Ли И, Пэн К., Ху И, Ли Ц, Ся Б, Цзинь Ц. (ноябрь 2005 г.). «Структуры раствора и динамика основной цепи арсенатредуктазы из Bacillus subtilis: обратимый конформационный переключатель, связанный с восстановлением арсената». Журнал биологической химии. 280 (47): 39601–8. Дои:10.1074 / jbc.M508132200. PMID 16192272.
Longhurst DM, Watanabe M, Rothstein JD, Jackson M (апрель 2006 г.). «Взаимодействие PDZRhoGEF с легкими цепями ассоциированного с микротрубочками протеина 1: связь между микротрубочками, актиновым цитоскелетом и полярностью нейронов». Журнал биологической химии. 281 (17): 12030–40. Дои:10.1074 / jbc.M513756200. PMID 16478718.
Гу Дж, Ву X, Донг Q, Ромео MJ, Лин X, Gutkind JS, Берман DM (июнь 2006 г.). «Несинонимичный однонуклеотидный полиморфизм в факторе обмена гуаниновых нуклеотидов PDZ-Rho (Ser1416Gly) модулирует риск рака легких у американцев мексиканского происхождения». Рак. 106 (12): 2716–24. Дои:10.1002 / cncr.21944. PMID 16691626.
Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
Ма Л., Хэнсон Р.Л., Ку Л.Н., Кали А.М., Фу М., Мак Дж.Л., Инфанте А.М., Кобес С., Богардус С., Шульдинер А.Р., Байер Л.Дж. (май 2007 г.). «Варианты ARHGEF11, гена-кандидата на связь с диабетом 2 типа на хромосоме 1q, номинально связаны с инсулинорезистентностью и диабетом 2 типа у индейцев пима». Сахарный диабет. 56 (5): 1454–9. Дои:10.2337 / db06-0640. PMID 17287471.

внешние ссылки

Человек ARHGEF11 расположение генома и ARHGEF11 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

Эта статья о ген на хромосома человека 1 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000132694 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041977 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10526156-5] а ^б Рюменапп Ю., Бломквист А., Шверер Г., Шабловски Н., Псома А., Якобс К. Х. (октябрь 1999 г.). «Rho-специфическое связывание и катализ обмена гуаниновых нуклеотидов с помощью KIAA0380, члена семейства dbl». Письма FEBS. 459 (3): 313–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01270-3. PMID 10526156.

[pmid9205841-6] Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д., Охира М., Секи Н., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (апрель 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК исследования. 4 (2): 141–50. Дои:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID 9205841.

[entrez-7] а ^б "Ген Entrez: ARHGEF11 Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) 11".

[”pmid10026210”-8] а ^б Фукухара С., Мурга С., Зохар М., Игиши Т., Гуткинд Дж. С. (февраль 1999 г.). «Новый PDZ-домен, содержащий фактор обмена гуаниновых нуклеотидов, связывает гетеротримерные G-белки с Rho». Журнал биологической химии. 274 (9): 5868–79. Дои:10.1074 / jbc.274.9.5868. PMID 10026210.

[”pmid24183240”-9] а ^б Thumkeo, D; Ватанабэ, S; Нарумия, С (октябрь – ноябрь 2013 г.). «Физиологические роли эффекторов Rho и Rho у млекопитающих». Европейский журнал клеточной биологии. 92 (10–11): 303–315. Дои:10.1016 / j.ejcb.2013.09.002. PMID 24183240.

[pmid11313914-10] Фукухара С., Чикуми Х., Гуткинд Дж. С. (2001). «RGS-содержащие RhoGEF: недостающее звено между трансформирующими G-белками и Rho?». Онкоген. 20 (13): 1661–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1204182. PMID 11313914.

[”pmid11546812”-11] Дивиани, Д; Содерлинг, Дж; Скотт, JD (ноябрь 2001 г.). «AKAP-Lbc закрепляет протеинкиназу А и зародыширует Galpha 12-селективное Rho-опосредованное образование стрессовых волокон». Журнал биологической химии. 276 (47): 44247–44257. Дои:10.1074 / jbc.M106629200. PMID 11546812.

[”pmid11358341”-12] Козаса Т. (2001). «Регулирование опосредованной G-белком передачи сигнала белками RGS». Life Sci. 68 (19–20): 2309–17. Дои:10.1016 / S0024-3205 (01) 01020-7. PMID 11358341.

[”pmid18940608”-13] а ^б Чен, Z; Певица, WD; Данеш С.М.; Стернвайс, ПК; Спранг, SR (октябрь 2008 г.). «Распознавание активированных состояний Galpha13 доменом rgRGS PDZRhoGEF». Структура. 16 (10): 1532–1543. Дои:10.1016 / j.str.2008.07.009. ЧВК 2586972. PMID 18940608.

[pmid12183458-14] а ^б ^c Перро В., Васкес-Прадо Дж., Гуткинд Дж. С. (ноябрь 2002 г.). «Плексин B регулирует Rho через факторы обмена гуаниновых нуклеотидов, связанные с лейкемией, Rho GEF (LARG) и PDZ-RhoGEF». Журнал биологической химии. 277 (45): 43115–20. Дои:10.1074 / jbc.M206005200. PMID 12183458.

[pmid12123608-15] а ^б Swiercz JM, Kuner R, Behrens J, Offermanns S (июль 2002 г.). «Plexin-B1 напрямую взаимодействует с PDZ-RhoGEF / LARG, чтобы регулировать RhoA и морфологию конуса роста». Нейрон. 35 (1): 51–63. Дои:10.1016 / S0896-6273 (02) 00750-X. PMID 12123608.

[pmid12730235-16] Ойнума И., Като Х., Харада А., Негиси М. (июль 2003 г.). «Прямое взаимодействие Rnd1 с Plexin-B1 регулирует PDZ-RhoGEF-опосредованную активацию Rho с помощью Plexin-B1 и индуцирует сокращение клеток в клетках COS-7». Журнал биологической химии. 278 (28): 25671–7. Дои:10.1074 / jbc.M303047200. PMID 12730235.

[pmid12220504-17] Хиротани М., Охока Ю., Ямамото Т., Нирасава Х., Фуруяма Т., Кого М., Мацуя Т., Инагаки С. (сентябрь 2002 г.). «Взаимодействие плексина-B1 с PDZ-доменом, содержащим факторы обмена генов гуаниновых нуклеотидов». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 297 (1): 32–7. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02122-8. PMID 12220504.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

Navigation