WikiDer > Жадность

Avidity

В биохимия, жадность относится к накопленной силе несколько близость отдельных нековалентный связывающие взаимодействия, например, между белковым рецептором и его лиганд, и обычно называется функциональным сродством. Таким образом, жадность отличается от близость, который описывает силу Один взаимодействие. Однако, поскольку отдельные события связывания увеличивают вероятность возникновения других взаимодействий (т. Е. Увеличивают локальную концентрацию каждого партнера по связыванию в непосредственной близости от сайта связывания), авидность следует рассматривать не как простую сумму составляющих его аффинностей, а как совокупное эффект всех аффинностей, участвующих в биомолекулярном взаимодействии. Особо важный аспект относится к феномену «энтропии авидности».[1] Биомолекулы часто образуют гетерогенные комплексы или гомогенные олигомеры и мультимеры или полимеры. Если кластерные белки образуют организованную матрицу, такую ​​как клатрин-coat взаимодействие описывается как зрелость.[нужна цитата]

Взаимодействие антитело-антиген

Avidity обычно применяется к антитело взаимодействия, при которых несколько антигенсвязывающих сайтов одновременно взаимодействуют с мишенью антигенный эпитопы, часто в многомерных структурах. По отдельности каждое связывающее взаимодействие может быть легко нарушено; однако, когда одновременно присутствует много связывающих взаимодействий, временное расцепление одного сайта не позволяет молекуле диффундировать, и связывание этого слабого взаимодействия, вероятно, будет восстановлено.[нужна цитата]

Каждое антитело имеет по крайней мере два антигенсвязывающих сайта, поэтому антитела могут быть бивалентными или поливалентными. Авидность (функциональное сродство) - это совокупная сила множественных сродств.[2] Например, IgM считается, что он имеет низкое сродство, но высокую авидность, потому что он имеет 10 слабых сайтов связывания для антигена в отличие от 2 более сильных сайтов связывания IgG, IgE и IgD с более высокой аффинностью одиночного связывания.[нужна цитата]

Близость

Аффинность связывания является мерой динамического равновесия отношения скорости (kна) и вне ставки (kвыключенный) при определенных концентрациях реагентов. Константа сродства, Kа, - величина, обратная константе диссоциации, Kd. Сила комплексообразования в растворе связана с константы устойчивости комплексов, однако в случае больших биомолекул, таких как рецептор-лиганд пар, их взаимодействие также зависит от других структурных и термодинамических свойств реагентов, а также от их ориентации и иммобилизации.[нужна цитата]

Есть несколько методы исследования белок-белковых взаимодействий существующие с различиями в иммобилизации каждого реагента в 2D или 3D ориентации. Измеренные аффинности хранятся в общедоступных базах данных, таких как База данных Ki и BindingDB.[нужна цитата] Например, аффинность - это сила связи между сложными структурами эпитоп антигенной детерминанты и паратоп антигенсвязывающего сайта антитела. Участвующие нековалентные взаимодействия могут включать: водородные связи, электростатические связи, силы Ван дер Ваальса и гидрофобные силы.[3]

Расчет аффинности связывания для бимолекулярной реакции (1 сайт связывания антитела на 1 антиген):

где [Ab] - антитело концентрации и [Ag] - антиген концентрация в свободном ([Ab], [Ag]) или связанном ([AbAg]) состоянии.

расчет константы ассоциации (или константа равновесия):

расчет константы диссоциации:

Заявление

Тесты на авидность вирус краснухи, Toxoplasma gondii, цитомегаловирус (CMV), вирус ветряной оспы, Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ), вирусы гепатита, Вирус Эпштейна-Барра, и другие были разработаны несколько лет назад. Эти тесты помогают отличить острую, рецидивирующую или перенесенную инфекцию по жадности маркера-специфического IgG. В настоящее время используются два теста на авидность. Это хорошо известный хаотропный (традиционный) анализ и недавно разработанный анализ AVIcomp (конкуренция авидности).[4]

Смотрите также

Существует ряд технологий, позволяющих охарактеризовать интенсивность молекулярных взаимодействий, в том числе: switchSENSE и поверхностный плазмонный резонанс.[5][6]

Рекомендации

  1. ^ Китов П.И., Bundle DR (декабрь 2003 г.). «О природе эффекта многовалентности: термодинамическая модель». Журнал Американского химического общества. 125 (52): 16271–84. Дои:10.1021 / ja038223n. PMID 14692768.
  2. ^ Рудник С.И., Адамс Г.П. (апрель 2009 г.). «Аффинность и авидность в нацеливании на опухоли на основе антител». Биотерапия рака и радиофармацевтические препараты. 24 (2): 155–61. Дои:10.1089 / cbr.2009.0627. ЧВК 2902227. PMID 19409036.
  3. ^ Джейнвей CA, Трэверс П., Уолпорт М, Шломчик MJ (2001). Иммунобиология (5-е изд.). Нью-Йорк: Наука Гарланд. п.104. ISBN 0-8153-3642-X.[страница нужна]
  4. ^ Curdt I, Praast G, Sickinger E, Schultess J, Herold I, Braun HB и др. (Март 2009 г.). «Разработка полностью автоматизированного определения авидности маркера-специфического иммуноглобулина G (IgG) на основе формата анализа конкуренции авидности: приложение для тестов Abbott Architect на цитомегаловирус и Toxo IgG Avidity». Журнал клинической микробиологии. 47 (3): 603–13. Дои:10.1128 / JCM.01076-08. ЧВК 2650902. PMID 19129411.
  5. ^ Gjelstrup LC, Kaspersen JD, Behrens MA, Pedersen JS, Thiel S, Kingshott P и др. (Февраль 2012 г.). «Роль наноразмерных лигандных паттернов в поливалентном связывании большими маннан-связывающими олигомерами лектина». Журнал иммунологии. 188 (3): 1292–306. Дои:10.4049 / jimmunol.1103012. PMID 22219330.
  6. ^ Воруп-Йенсен Т. (декабрь 2012 г.). «О роли поливалентного связывания в иммунном распознавании: перспективы нанонауки в иммунологии и иммунный ответ на наномедицины». Расширенные обзоры доставки лекарств. 64 (15): 1759–81. Дои:10.1016 / j.addr.2012.06.003. PMID 22705545.

дальнейшее чтение

  • Roitt IM, Brostoff J, Male DK (2001). Иммунология (6-е изд.). Издательство Мосби. п. 72. ISBN 978-0-7234-3189-3.

внешняя ссылка