WikiDer > Мотив РНК Bacteroidales-1

Bacteroidales-1 RNA motif
Bacteroidales-1 РНК
Bacteroidales-1-RNA.svg
Консенсусная вторичная структура РНК Bacteroidales-1
Идентификаторы
СимволBacteroidales-1
РфамRF01693
Прочие данные
РНК типмРНК
Домен (ы)Bacteroidales
PDB структурыPDBe

В Мотив РНК Bacteroidales-1 консервированный РНК структура идентифицирована биоинформатика.[1] Он был идентифицирован только в бактерии в пределах порядок (биология) Bacteroidales. Его предполагаемая длина обозначена промотором на одном конце, который соответствует альтернативной консенсусной последовательности, распространенной в типе Bacteroidetes, а его 3 'конец обозначен предсказанным терминаторы транскрипции.[2] Часто располагается ниже по потоку ген который кодирует L20 рибосомальный субъединица, хотя неясно, есть ли функциональная причина, лежащая в основе этой очевидной ассоциации.[1]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ а б Вайнберг З., Ван Дж. Х, Бог Дж. И др. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика обнаруживает 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Геном Биол. 11 (3): R31. Дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. ЧВК 2864571. PMID 20230605.
  2. ^ Бейли Д.П., Роча Е.Р., Смит С.Дж. (декабрь 2000 г.). «Анализ генов cepA и других Bacteroides fragilis показывает уникальную структуру промотора». FEMS Microbiol. Латыш. 193 (1): 149–154. Дои:10.1111 / j.1574-6968.2000.tb09417.x. PMID 11094294.

внешние ссылки