WikiDer > CHI3L1

CHI3L1
CHI3L1
Белок CHI3L1 PDB 1hjv.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыCHI3L1, хитиназа 3-подобная 1 (гликопротеин-39 хряща), ASRT7, CGP-39, GP-39, GP39, HC-gp39, HCGP-3P, YKL-40, YKL40, YYL-40, hCGP-39, хитиназа 3 подобная 1, ЯК-40
Внешние идентификаторыOMIM: 601525 MGI: 1340899 ГомолоГен: 55569 Генные карты: CHI3L1
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение CHI3L1
Геномное расположение CHI3L1
Группа1q32.1Начните203,178,931 бп[1]
Конец203,186,704 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CHI3L1 209395 в формате fs.png

PBB GE CHI3L1 209396 s в формате fs.png

PBB GE CHI3L1 216546 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001276

NM_007695
NM_001374626

RefSeq (белок)

NP_001267
NP_001267.2

NP_031721
NP_001361555

Расположение (UCSC)Chr 1: 203.18 - 203.19 МбChr 1: 134.18 - 134.19 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Хитиназа-3-подобный протеин 1 (CHI3L1), также известен как YKL-40, это секретный гликопротеин это примерно 40кДа размером, который у человека кодируется CHI3L1 ген.[5][6][7] Название YKL-40 происходит от трех N-терминальных аминокислоты присутствует на секретном бланке и его молекулярная масса. YKL-40 экспрессируется и секретируется различными типы клеток в том числе макрофаги, хондроциты, фибробластоподобные синовиальные клетки, гладкомышечные клетки сосудов и звездчатые клетки печени. Биологическая функция YKL-40 неясна. Неизвестно, есть ли конкретный рецептор. Его характер экспрессии связан с патогенными процессами, связанными с воспалением, ремоделированием внеклеточной ткани, фиброз и солидные карциномы[8] и астма.[9]

Функция

Хитиназы катализировать гидролиз хитин, что является обильным гликополимер найдено в насекомых экзоскелеты и клеточные стенки грибов. В гликозид гидролаза Семейство 18 хитиназ включает восемь членов семьи человека. Этот ген кодирует гликопротеин член семейства гликозилгидролаз 18. Белок лишен активности хитиназы и секретируется активированным макрофаги, хондроциты, нейтрофилы и синовиальные клетки. Считается, что белок играет роль в процессе воспаления и ремоделирования тканей.[7] YKL-40 не хватает хитиназа активность из-за мутаций в активном сайте (консервативная последовательность: DXXDXDXE; последовательность YKL-40: DGLDLAWL).[8]

Регулировка и механизм

YKL-40 был связан с активацией AKT за выживание (противапоптотический) сигнальный путь. YKL-40 продвигает ангиогенез через VEGF-зависимые и независимые пути.[10]

YKL-40 - фактор миграции для первичного астроциты и его выражение контролируется NFI-X3, STAT3, и АП-1.[11]

CHI3l1 индуцируется различными видами рака и в присутствии семафорин 7А (белок) может подавлять множественные противоопухолевые ответы иммунной системы. Активация противовирусного иммунного пути, известного как RIG-подобная геликаза (RLH), обладает способностью противодействовать индукции CHI3l1. Раковые клетки могут компенсировать RLH, стимулируя NLRX1. Поли (I: C)РНК-подобная молекула может стимулировать активацию RLH. Активация RLH также может подавлять экспрессию рецептора ИЛ-13Rα2п и легочный метастаз. Он хранит NK клетка накопление и активация. Это увеличивает выражение IFN-α / β, чемерин и его рецептор ChemR23, п-кофилин, LIMK2 и PTEN и подавление BRAF и NLRX1 в зависимости от MAVS.[12]

Рак

Предполагается, что YKL-40 играет роль в пролиферации раковых клеток, выживании, инвазивности и в регуляции взаимодействий между клетками и матрицей. Предполагается, что YKL-40 является маркером, связанным с более плохим клиническим исходом в генетически определенных подгруппах различных опухолей. YKL-40 был недавно введен в (ограниченную) клиническую практику. Для его обнаружения доступно несколько методов.[8]

YKL-40 - это Чт2 продвижение цитокин что присутствует на высоких уровнях в микросреда опухоли и в сыворотке больных раком.[13][14] Повышенные уровни YKL-40 сильно коррелируют со стадией и исходом различных типов рака, что определяет YKL-40 как биомаркер тяжести заболевания.[15] Нацеливание YKL-40 с нейтрализующие антитела эффективен в качестве лечения на животных моделях мультиформная глиобластома.[16]

YKL-40 также увеличивает выживаемость опухоли в ответ на гамма-облучение.[10]

Болезнь Альцгеймера

Так как Болезнь Альцгеймера прогрессирует, растворимый амилоид бета агрегаты в головном мозге могут вызывать активацию микроглия, который запускает синтез провоспалительных медиаторов.[17] Это приводит к увеличению Chi3l1 выражение в астроциты.[17] Есть доказательства того, что уровни YKL-40 повышены у пациентов с болезнью Альцгеймера по сравнению с когнитивно нормальными людьми.[17] Повышенные уровни мРНК YKL-40 были обнаружены в мозге, пораженном болезнью Альцгеймера, по сравнению с нормальным контролем.[17] Кроме того, YKL-40 коррелирует с другими слабоумие биомаркеры, такие как тау-белки и бета-амилоид.[17] YKL-40 исследуется как новый биомаркер болезни Альцгеймера, количественно определяемый в спинномозговая жидкость или кровь.[18]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000133048 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000064246 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Хакала Б. Е., Уайт С., Реклис А. Д. (декабрь 1993 г.). «Человеческий хрящевой gp-39, главный секреторный продукт суставных хондроцитов и синовиальных клеток, является членом семейства хитиназных белков у млекопитающих». Журнал биологической химии. 268 (34): 25803–10. PMID 8245017.
  6. ^ Рели М., Краузе С.В., Андриесен Р. (июль 1997 г.). «Молекулярная характеристика гена gp-39 человеческого хряща (CHI3L1), члена семейства белков хитиназы и маркера поздних стадий дифференцировки макрофагов». Геномика. 43 (2): 221–5. Дои:10.1006 / geno.1997.4778. PMID 9244440.
  7. ^ а б «Ген Entrez: CHI3L1 хитиназа 3-подобная 1 (хрящевой гликопротеин-39)».
  8. ^ а б c Казакова М.Х., Сарафян В.С. (2009-03-01). «YKL-40 - новый биомаркер в клинической практике?». Folia Medica. 51 (1): 5–14. PMID 19437893.
  9. ^ Обер К., Тан З., Сан Y, Поссик Дж. Д., Пан Л., Николае Р., Рэдфорд С., Парри Р. Р., Хайнцманн А., Дайхманн К. А., Лестер Л. А., Герн Дж. Э., Леманске Р. Ф., Николае Д. Л., Элиас Дж. А., Чупп Г. Л. (апрель 2008 г. ). «Влияние вариации CHI3L1 на сывороточный уровень YKL-40, риск астмы и функцию легких». Медицинский журнал Новой Англии. 358 (16): 1682–91. Дои:10.1056 / NEJMoa0708801. ЧВК 2629486. PMID 18403759.
  10. ^ а б Франческоне Р.А., Скалли С., Файбиш М., Тейлор С.Л., О Д., Мораль Л., Ян В., Бентли Б., Шао Р. (апрель 2011 г.). «Роль YKL-40 в ангиогенезе, радиорезистентности и прогрессировании глиобластомы». Журнал биологической химии. 286 (17): 15332–43. Дои:10.1074 / jbc.M110.212514. ЧВК 3083166. PMID 21385870.
  11. ^ Сингх С.К., Бхардвадж Р., Вильчинска К.М., Думур К.И., Кордула Т. (ноябрь 2011 г.). «Комплекс ядерного фактора I-X3 и STAT3 регулирует миграцию астроцитов и глиомы через секретируемый гликопротеин YKL-40». Журнал биологической химии. 286 (46): 39893–903. Дои:10.1074 / jbc.M111.257451. ЧВК 3220556. PMID 21953450.
  12. ^ Ма Б., Херцог Е. Л., Мур М., Ли С. М., На Ш., Ли К. Г., Элиас Дж. А. (май 2016 г.). "RIG-подобная геликаза регуляция хитиназы 3-подобной 1 оси и легочных метастазов". Научные отчеты. 6: 26299. Bibcode:2016НатСР ... 626299М. Дои:10.1038 / srep26299. ЧВК 4873814. PMID 27198666.
  13. ^ Høgdall EV, Ringsholt M, Høgdall CK, Christensen IJ, Johansen JS, Kjaer SK, Blaakaer J, Ostenfeld-Møller L, Price PA, Christensen LH (январь 2009 г.). «Экспрессия YKL-40 в ткани и уровни в плазме у пациентов с раком яичников». BMC Рак. 9: 8. Дои:10.1186/1471-2407-9-8. ЧВК 2645422. PMID 19134206.
  14. ^ Бернарди Д., Падоан А., Баллин А., Сартори М., Манара Р., Сциенца Р., Плебани М., Делла Пуппа А. (апрель 2012 г.). «Сыворотка YKL-40 после резекции церебральной глиобластомы». Журнал нейроонкологии. 107 (2): 299–305. Дои:10.1007 / s11060-011-0762-7. PMID 22102082.
  15. ^ Johansen JS, Christensen IJ, Riisbro R, Greenall M, Han C., Price PA, Smith K, Brünner N, Harris AL (июль 2003 г.). «Высокий уровень сывороточного YKL-40 у пациентов с первичным раком груди связан с короткой выживаемостью без рецидивов». Исследования и лечение рака груди. 80 (1): 15–21. Дои:10.1023 / А: 1024431000710. PMID 12889595.
  16. ^ Файбиш М., Франческоне Р., Бентли Б., Ян В., Шао Р. (май 2011 г.). «YKL-40-нейтрализующее антитело блокирует ангиогенез и прогрессирование опухоли: потенциальный терапевтический агент при раке». Молекулярная терапия рака. 10 (5): 742–51. Дои:10.1158 / 1535-7163.MCT-10-0868. ЧВК 3091949. PMID 21357475.
  17. ^ а б c d е Muszyński P, Groblewska M, Kulczyńska-Przybik A, Kułakowska A, Mroczko B (31.07.2017). «YKL-40 как потенциальный биомаркер и возможная цель в терапевтических стратегиях болезни Альцгеймера». Современная нейрофармакология. 15 (6): 906–917. Дои:10,2174 / 1570159X15666170208124324. ЧВК 5652033. PMID 28183245.
  18. ^ Молинуево Дж. Л., Эйтон С., Батрла Р., Беднар М. М., Биттнер Т., Каммингс Дж., Фаган А. М., Хампель Х, Мильке М. М., Микульскис А., О'Брайант С., Шелтенс П., Севиньи Дж., Шоу Л. М., Соареш HD, Тонг Г., Trojanowski JQ, Zetterberg H, Blennow K (декабрь 2018 г.). «Текущее состояние биомаркеров жидкости Альцгеймера». Acta Neuropathologica. 136 (6): 821–853. Дои:10.1007 / s00401-018-1932-х. ЧВК 6280827. PMID 30488277.

внешние ссылки

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.