WikiDer > Катепсин С
| Исключенный домен катепсина С | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 повторное определение нативной структуры дипептидилпептидазы i человека (катепсин c) | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | КатепсинC_exc | ||||||||
| Pfam | PF08773 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR014882 | ||||||||
| SCOP2 | 1k3b / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
Катепсин С (CTSC) также известный как дипептидилпептидаза I (DPP-I) это лизосомный экзо-цистеиновая протеаза принадлежащий к семейству пептидаз С1. У человека он кодируется CTSC ген.[4][5]
Функция
Катепсин C, по-видимому, является центральным координатором активации многих сериновые протеазы в иммунных / воспалительных клетках.
Катепсин С катализирует удаление дипептидов из N-конец белков и пептидных субстратов, за исключением случаев, когда (i) аминогруппа N-конца заблокирована, (ii) сайт расщепления находится по обе стороны от пролинового остатка, (iii) N-концевой остаток представляет собой лизин или аргинин или (iv) структура пептида или белка предотвращает дальнейшее расщепление с N-конца.
Структура
КДНК, кодирующие крысу, человека, мышь, бык, собаку и две Шистосома катепсин Cs был клонирован и секвенирован и показал, что фермент является высококонсервативным.[6] КДНК катепсина C человека и крысы кодируют предшественники (препрокатепсин C), содержащие сигнальные пептиды из 24 остатков, про-области из 205 (катепсин C) или 206 (катепсин C человека) остатков и каталитические домены из 233 остатков, которые содержат каталитические остатков и на 30-40% идентичны зрелым аминокислотным последовательностям папаин и ряд других катепсинов, включая катепсины, B, ЧАС, K, L, и S.[7]
Транслированный препрокатепсин C процессируется в зрелую форму по меньшей мере за четыре отщепления полипептидной цепи. Сигнальный пептид удаляется во время транслокации или секреции профермента (прокатепсина C) и большого N-концевого фрагмента прорегиона (также известного как домен исключения),[8] который сохраняется в зрелом ферменте, отделяется от каталитического домена удалением второстепенного C-терминал часть про-области, называемая активационным пептидом. Тяжелая цепь из примерно 164 остатков и легкая цепь из примерно 69 остатков образуются в результате расщепления каталитического домена.
В отличие от других членов папаин В семействе зрелый катепсин С состоит из четырех субъединиц, каждая из которых состоит из N-концевого фрагмента прорегиона, тяжелой цепи и легкой цепи. И про-фрагмент области, и тяжелая цепь гликозилированы.
Клиническое значение
Было показано, что дефекты кодируемого белка являются причиной Болезнь Папийона-Лефевра,[9][10] аутосомно-рецессивное заболевание, характеризующееся ладонно-подошвенным кератоз и пародонтит.
Катепсин C функционирует как ключевой фермент в активации сериновых пептидаз гранул в воспалительных клетках, таких как эластаза и катепсин G в клетках нейтрофилов и химаза и триптаза в тучных клетках. При многих воспалительных заболеваниях, таких как ревматоидный артрит, хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ), воспалительное заболевание кишечника, астма, сепсис и муковисцидоз, значительная часть патогенеза обусловлена повышенной активностью некоторых из этих воспалительных протеаз. После активации катепсином С протеазы способны разрушать различные компоненты внеклеточного матрикса, что может привести к повреждению тканей и хроническому воспалению.
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000109861 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Entrez Gene: CTSC катепсин C".
- ^ Париж А., Струкель Б., Пунгеркар Дж., Ренко М., Доленц И., Тюрк V (август 1995 г.). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности человеческого препрокатепсина C». Письма FEBS. 369 (2–3): 326–30. Дои:10.1016/0014-5793(95)00777-7. PMID 7649281. S2CID 45737414.
- ^ Hola-Jamriska L, Tort JF, Dalton JP, Day SR, Fan J, Aaskov J, Brindley PJ (август 1998 г.). «Катепсин С из Schistosoma japonicum - кДНК, кодирующая препроэнзим и его филогенетические отношения». Европейский журнал биохимии / FEBS. 255 (3): 527–34. Дои:10.1046 / j.1432-1327.1998.2550527.x. PMID 9738890.
- ^ Коминами Э., Исидо К., Муно Д., Сато Н. (июль 1992 г.). «Первичная структура и тканевое распределение катепсина С». Биологическая химия Хоппе-Зейлер. 373 (7): 367–73. Дои:10.1515 / bchm3.1992.373.2.367. PMID 1515062.
- ^ Тюрк Д., Янич В., Штерн I, Подобник М., Ламба Д., Даль С.В., Лауритцен С., Педерсен Дж., Терк В., Тюрк Б. (декабрь 2001 г.). «Структура дипептидилпептидазы I (катепсин С): домен исключения, добавленный к каркасу эндопептидазы, создает машину для активации гранулярных сериновых протеаз». Журнал EMBO. 20 (23): 6570–82. Дои:10.1093 / emboj / 20.23.6570. ЧВК 125750. PMID 11726493.
- ^ Вани А.А., Девкар Н., Патоле М.С., Шоуче Ю.С. (февраль 2006 г.). «Описание двух новых мутаций гена катепсина С у пациентов с синдромом Папийона-Лефевра». Журнал пародонтологии. 77 (2): 233–7. Дои:10.1902 / jop.2006.050124. PMID 16460249.
- ^ Мид Дж. Л., де Винтер Е. А., Бретт П., Шариф С. М., Вудс К. Г., Маркхэм А. Ф., Кук Г. П. (май 2006 г.). «Семья с синдромом Папийона-Лефевра выявляет потребность в катепсине С для активации гранзима В и цитолитической активности NK-клеток». Кровь. 107 (9): 3665–8. Дои:10.1182 / кровь-2005-03-1140. PMID 16410452.
дальнейшее чтение
- Макгуайр MJ, Lipsky PE, Thiele DL (июнь 1992 г.). «Очистка и характеристика дипептидилпептидазы I из селезенки человека». Архивы биохимии и биофизики. 295 (2): 280–8. Дои:10.1016/0003-9861(92)90519-3. PMID 1586157.
- Париж А., Струкель Б., Пунгеркар Дж., Ренко М., Доленц И., Тюрк V (август 1995 г.). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности человеческого препрокатепсина C». Письма FEBS. 369 (2–3): 326–30. Дои:10.1016/0014-5793(95)00777-7. PMID 7649281. S2CID 45737414.
- Доленц I, Тюрк Б, Пунгерчич Дж, Ритонья А, Тюрк V (сентябрь 1995 г.). «Олигомерная структура и субстрат, индуцированный ингибированием катепсина С человека». Журнал биологической химии. 270 (37): 21626–31. Дои:10.1074 / jbc.270.37.21626. PMID 7665576.
- Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Рао Н.В., Рао Г.В., Хойдал-младший (апрель 1997 г.). «Человеческая дипептидил-пептидаза I. Характеристика, локализация и экспрессия гена». Журнал биологической химии. 272 (15): 10260–5. Дои:10.1074 / jbc.272.15.10260. PMID 9092576.
- Фишер Дж., Бланше-Бардон К., Прюдхомм Дж. Ф., Павек С., Стейлен П. М., Дубертрет Л., Вайссенбах Дж. (1997). «Картирование синдрома Папийона-Лефевра в области хромосомы 11q14». Европейский журнал генетики человека. 5 (3): 156–60. Дои:10.1159/000484751. HDL:2066/24363. PMID 9272739.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Цигич Б., Крижай И., Краль Б., Тюрк В., Пейн Р.Х. (январь 1998 г.). «Стехиометрия и гетерогенность про-региональной цепи в тетрамерном катепсине С человека». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология. 1382 (1): 143–50. Дои:10.1016 / S0167-4838 (97) 00173-8. PMID 9507095.
- Тумс К., Джеймс Дж., Вуд А.Дж., Ву К.Л., Маккормик Д., Ленч Н., Хьюитт С., Мойнихан Л., Робертс Э., Вудс К.Г., Маркхэм А., Вонг М., Видмер Р., Гаффар К.А., Пембертон М., Хусейн И.Р., Темтами С.А. , Дэвис Р., Рид А. П., Слоан П., Диксон М. Дж., Таккер Н. С. (декабрь 1999 г.). «Мутации с потерей функции в гене катепсина C приводят к заболеваниям пародонта и ладонно-подошвенному кератозу». Природа Генетика. 23 (4): 421–4. Дои:10.1038/70525. PMID 10581027. S2CID 11433166.
- Hart TC, Hart PS, Bowden DW, Michalec MD, Callison SA, Walker SJ, Zhang Y, Firatli E (декабрь 1999 г.). «Мутации гена катепсина C ответственны за синдром Папийона-Лефевра». Журнал медицинской генетики. 36 (12): 881–7. Дои:10.1136 / jmg.36.12.881 (неактивно 11.10.2020). ЧВК 1734286. PMID 10593994.CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на октябрь 2020 г. (связь)
- Hart TC, Hart PS, Michalec MD, Zhang Y, Firatli E, Van Dyke TE, Stabholz A, Zlotogorski A, Shapira L, Soskolne WA, Zlorogorski A (февраль 2000 г.). «Синдром Хаима-Мунка и синдром Папийона-Лефевра - аллельные мутации в катепсине С». Журнал медицинской генетики. 37 (2): 88–94. Дои:10.1136 / jmg.37.2.88. ЧВК 1734521. PMID 10662807.
- Hart TC, Hart PS, Michalec MD, Zhang Y, Marazita ML, Cooper M, Yassin OM, Nusier M, Walker S (февраль 2000 г.). «Локализация гена препубертатного периодонтита на хромосоме 11q14 и идентификация мутации гена катепсина C». Журнал медицинской генетики. 37 (2): 95–101. Дои:10.1136 / jmg.37.2.95. ЧВК 1734516. PMID 10662808.
- Сузуки Ю., Исихара Д., Сасаки М., Накагава Х., Хата Х, Цунода Т., Ватанабэ М., Комацу Т., Ота Т., Исогай Т., Суяма А., Сугано С. (март 2000 г.). «Статистический анализ 5'-нетранслируемой области мРНК человека с использованием библиотек кДНК« олиго-кэпированных »». Геномика. 64 (3): 286–97. Дои:10.1006 / geno.2000.6076. PMID 10756096.
- Цигич Б., Даль С.В., Пейн Р.Х. (октябрь 2000 г.). «Остаточная про-часть катепсина С удовлетворяет критериям, необходимым для внутримолекулярного шаперона в сворачивании и стабилизации профермента человека». Биохимия. 39 (40): 12382–90. Дои:10.1021 / bi0008837. PMID 11015218.
- Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
- Hart PS, Zhang Y, Firatli E, Uygur C, Lotfazar M, Michalec MD, Marks JJ, Lu X, Coates BJ, Seow WK, Marshall R, Williams D, Reed JB, Wright JT, Hart TC (декабрь 2000 г.). «Идентификация мутаций катепсина С у пациентов с синдромом папийона-Лефевра». Журнал медицинской генетики. 37 (12): 927–32. Дои:10.1136 / jmg.37.12.927. ЧВК 1734492. PMID 11106356.
- Чжан Ю., Лундгрен Т., Ренверт С., Татакис Д. Н., Фиратли Э, Уйгур К., Харт П. С., Горри М. С., Маркс Дж. Дж., Харт Т.С. (февраль 2001 г.). «Доказательства эффекта основателя для четырех мутаций гена катепсина С у пациентов с синдромом Папийона-Лефевра». Журнал медицинской генетики. 38 (2): 96–101. Дои:10.1136 / jmg.38.2.96. ЧВК 1734811. PMID 11158173.
- Накано А., Номура К., Накано Х., Оно Ю., ЛаФорджиа С., Пулккинен Л., Хашимото И., Уитто Дж. (Февраль 2001 г.). «Синдром Папийона-Лефевра: мутации и полиморфизмы в гене катепсина С». Журнал следственной дерматологии. 116 (2): 339–43. Дои:10.1046 / j.1523-1747.2001.01244.x. PMID 11180012.
- Альенде Л.М., Гарсия-Перес М.А., Морено А., Корелл А., Карасол М., Мартинес-Канут П., Арнаис-Вильена А. (февраль 2001 г.). «Ген катепсина C: первый сложный гетерозиготный пациент с синдромом Папийона-Лефевра и новой бессимптомной мутацией». Человеческая мутация. 17 (2): 152–3. Дои:10.1002 / 1098-1004 (200102) 17: 2 <152 :: AID-HUMU10> 3.0.CO; 2- #. PMID 11180601.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК 311072. PMID 11230166.
внешняя ссылка
- В МЕРОПЫ онлайн-база данных пептидаз и их ингибиторов: C01.070
- Катепсин + C в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
PDB галерея | |
|---|---|
|
