WikiDer > Chaetomium thermophilum
| Chaetomium thermophilum | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Королевство: | |
| Разделение: | |
| Учебный класс: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | |
| Разновидность: | С. термофилум |
| Биномиальное имя | |
| Chaetomium thermophilum Ла Туш (1950) | |
Chaetomium thermophilum термофильный нитевидный грибок. Он растет на навоз или компост (гнилая органика). Он примечателен тем, что является эукариотом с высокой температурной устойчивостью (60 ° C). Оптимальная температура роста 50–55 ° C.[1]
Исследование
Chaetomium thermophilum является центром исследований на кафедре биохимии в Гейдельбергский университет, Германия. Поскольку грибы являются эукариотами и не далеки от животных, они являются хорошими моделями для сравнительных исследований, которыми легко манипулировать, а в случае С. термофилум, это имеет особое значение. Во-первых, учитывая то, что он теплолюбив, белки полученные из этого грибка термостабильны и, следовательно, с ними легче работать. Белки из С. термофилум термофильны и поэтому лучше подходят для исследований (структурных и биохимических), чем сопоставимые мезофильный грибы. Изучая белки комплекса ядерных пор, было обнаружено, что выделение белка было более обильным и более растворимым, чем в дрожжах (дрожжевые белки осаждаются при более низкой температуре).[2]
Геном и протеом
Геном С. термофилум был полностью упорядочен. Он занимает 28,3 Мбайт и кодирует 7227 предсказанных генов, кодирующих белок.[1][3] Saccharomyces cerevisiae, модельные дрожжи, на 73% гомологичны этому грибку.
Протеом С. термофилум было изучено и идентифицировано 27 различных белковых сообществ, включая 108 взаимосвязанных комплексов.[4]
Модельная система для идентификации белковых взаимодействий более высокого порядка
Первое наблюдение метаболизма в метаболизме жирных кислот с высоким разрешением было получено в результате криоэлектронно-микроскопического анализа клеточных гомогенатов из С. термофилум. Другие белковые комплексы и взаимодействия более высокого порядка были предсказаны и подтверждены с использованием новой интеграции экспериментальных и вычислительных методов, которые включают протеомику, сшивающую масс-спектрометрию, вычислительную структурную биологию и электронную микроскопию. Клеточные гомогенаты С. термофилум были использованы для получения структур белковых комплексов с высоким разрешением, с чистотой нативного белкового комплекса <40%.[4]
Рекомендации
- ^ а б Бок, Томас; Чен, Вэй-Хуа; Ори, Алессандро; Малик, Найаб; Сильва-Мартин, Ноэлла; Уэрта-Сепас, Хайме; Пауэлл, Шон Т .; Kastritis, Panagiotis L .; Смышляев, Георгий (16.12.2014). «Комплексный подход к аннотации генома эукариотического термофила Chaetomium thermophilum». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (22): 13525–13533. Дои:10.1093 / нар / gku1147. ISSN 0305-1048. ЧВК 4267624. PMID 25398899.
- ^ Понимание структуры и сборки комплекса ядерных пор с использованием генома эукариотического термофила
- ^ «Общедоступные геномы Genozymes». Genome.fungalgenomics.ca. Получено 2014-05-17.
- ^ а б Kastritis, Panagiotis L .; О'Рейли, Фрэнсис Дж .; Бок, Томас; Ли, Юаньюэ; Rogon, Matt Z .; Бучак, Катаржина; Романова, Натали; Беттс, Мэтью Дж .; Буй, Кхань Хай (01.07.2017). «Захват белковых сообществ с помощью структурной протеомики в термофильных эукариотах». Молекулярная системная биология. 13 (7): 936. Дои:10.15252 / msb.20167412. ISSN 1744-4292. ЧВК 5527848. PMID 28743795.