WikiDer > Кристоф Дессимо

Christophe Dessimoz
Кристоф Дессимо
Кристоф Дессимоц ISMBECCB19-108 (48722254541) .jpg
Родился
Кристоф Дессимо

1980 (39–40 лет)
Альма-матерETH Цюрих (Магистр, доктор философии)
ИзвестенОртологичная матрица (OMA)[1]
НаградыПриз Овертона (2019)[2]
Научная карьера
ПоляБиоинформатика
Геномика
Филогенетика
Эволюция
Вычислительная биология[3]
УчрежденияЛозаннский университет
Европейский институт биоинформатики
Университетский колледж Лондона
Швейцарский институт биоинформатики
ТезисСравнительная геномика с использованием парных эволюционных расстояний (2009)
ДокторантГастон Гонне[4]
Интернет сайтлаборатория.dessimoz.org/люди/ christophe-dessimoz

Кристоф Дессимо это Швейцарский национальный научный фонд (SNSF) Профессор Лозаннский университет, Доцент кафедры Университетский колледж Лондона и руководитель группы на Швейцарский институт биоинформатики.[5][3][6][7][8] Он был награжден Приз Овертона в 2019 году за его вклад в вычислительная биология.[2]


Образование

Дессимоз получил свое Магистр естественных наук степень в 2003 году[5] и кандидат наук в Информатика в 2009 году из ETH Цюрих в Швейцария[9] где его докторскими исследованиями руководил Гастон Гонне[4] и рассмотрено Амос Байрох.[9]

Карьера и исследования

После постдокторское исследование на Европейский институт биоинформатики (EBI) на Кампус Wellcome Genome в Hinxton, Кембриджшир,[10] он присоединился Университетский колледж Лондона (UCL) как лектор в 2013 году и был повышен до Читатель в 2015 году.[5] В 2015 году он присоединился к Лозаннский университет в качестве профессора, сохраняя назначение в UCL.[11] С 2016 года Дессимоз является руководителем группы в Швейцарский институт биоинформатики[5] где его исследовательские интересы биоинформатика, геномика, филогенетика, эволюция и вычислительная биология.[3][12][13][14][15]

Дессимоз известен своим руководством Ортологичная матрица (OMA)[1] который предоставляет информацию о ортологичный белки. OMA имеет важные приложения в прогноз функции белка.[2] Подход Дессимоза к сравнительный анализ оказал большое влияние на три ключевые области вычислительной биологии: ортологический вывод, выравнивание последовательностей, а генная онтология (ИДТИ).[2][16][17]

Награды и награды

Дессимоз был награжден Приз Овертона посредством Международное общество вычислительной биологии (ISCB) в 2019 году за выдающийся вклад в вычислительную биологию.[2]

использованная литература

  1. ^ а б Альтенхофф, Адриан М; Гловер, Наташа М; Поезд, Клеман-Мари; Калеб, Клара; Уорвик Вестроци, Алекс; Дилус, Дэвид; де Фариас, Tarcisio M; Зиле, Карина; Стивенсон, Чарльз; Лонг, Цзяо; Редестиг, Хеннинг; Gonnet, Gaston H; Дессимоз, Кристоф (2018). «База данных ортологии OMA в 2018 году: поиск эволюционных взаимосвязей между всеми сферами жизни с помощью более богатых веб-интерфейсов и программных интерфейсов». Исследования нуклеиновых кислот. 46 (D1): D477 – D485. Дои:10.1093 / нар / gkx1019. ISSN 0305-1048. ЧВК 5753216. PMID 29106550.
  2. ^ а б c d е Ковац, Дайан; Шамир, Рон; Фогг, Кристиана (2019). "Премия ISCB Overton 2019: Кристоф Дессимоз". F1000 Исследования. 8: 722. Дои:10.12688 / f1000research.19220.1. ISSN 2046-1402. ЧВК 6534074. PMID 31164977.
  3. ^ а б c Кристоф Дессимо публикации, проиндексированные Google ученый Отредактируйте это в Викиданных
  4. ^ а б Кристоф Дессимо на Проект "Математическая генеалогия" Отредактируйте это в Викиданных
  5. ^ а б c d Дессимоз, Кристоф (2019). «Дессимоз Лаб». lab.dessimoz.org.
  6. ^ Кристоф Дессимо публикации из Европа PubMed Central
  7. ^ Кристоф Дессимо публикации, проиндексированные Scopus библиографическая база данных. (требуется подписка)
  8. ^ Кристоф Дессимо на Twitter Отредактируйте это в Викиданных
  9. ^ а б Дессимоз, Кристоф (2009). Сравнительная геномика с использованием парных эволюционных расстояний. ethz.ch (Кандидатская диссертация). ETH Zurich. Дои:10.3929 / ethz-a-005762050. OCLC 935351416. открытый доступ
  10. ^ Гольдман, Ник; Бертоне, Пол; Чен, Сиюань; Дессимоз, Кристоф; ЛеПруст, Эмили М .; Сипос, Ботонд; Бирни, Юэн (2013). «На пути к практичному, емкому, не требующему обслуживания хранилищу информации в синтезированной ДНК». Природа. 494 (7435): 77–80. Bibcode:2013Натура 494 ... 77Г. Дои:10.1038 / природа11875. ISSN 0028-0836. ЧВК 3672958. PMID 23354052.
  11. ^ "Доктор Кристоф Дессимоз". ucl.ac.uk. Получено 6 марта 2019.
  12. ^ Водак, Шошана; Суннокер, Микаэль; Бузетто, Альберто Джованни; Нумминен, Элина; Корандер, Юкка; Фолль, Матье; Дессимоз, Кристоф (2013). «Приближенное байесовское вычисление». PLOS вычислительная биология. 9 (1): e1002803. Bibcode:2013PLSCB ... 9E2803S. Дои:10.1371 / journal.pcbi.1002803. ISSN 1553-7358. ЧВК 3547661. PMID 23341757.
  13. ^ Анисимова Мария; Гил, Мануэль; Дюфаяр, Жан-Франсуа; Дессимоз, Кристоф; Гаскуэль, Оливье (2011). «Обзор методов поддержки филиалов демонстрирует точность, мощность и надежность схем быстрого приближения на основе правдоподобия». Систематическая биология. 60 (5): 685–699. Дои:10.1093 / sysbio / syr041. ISSN 1076-836X. ЧВК 3158332. PMID 21540409.
  14. ^ Эйзен, Джонатан А.; Альтенхофф, Адриан М .; Дессимоз, Кристоф (2009). «Филогенетическая и функциональная оценка проектов и методов вывода ортологов». PLOS вычислительная биология. 5 (1): e1000262. Bibcode:2009PLSCB ... 5E0262A. Дои:10.1371 / journal.pcbi.1000262. ISSN 1553-7358. ЧВК 2612752. PMID 19148271.
  15. ^ Аббош, Кристофер; Birkbak, Nicolai J .; Wilson, Gareth A .; Джамал-Ханджани, Мариам; Константин, Тюдор; Салари, Рахеле; Ле Кен, Джон; Мур, Дэвид А .; Вейрия, Сельвараджу; Розенталь, Рэйчел; Марафиоти, Тереза; и другие. (2017). «Филогенетический анализ цтДНК показывает эволюцию рака легких на ранней стадии». Природа. 545 (7655): 446–451. Bibcode:2017Натура.545..446A. Дои:10.1038 / природа22364. ISSN 0028-0836. ЧВК 5812436. PMID 28445469.
  16. ^ Дессимоз, Кристоф (2017). Дессимоз, Кристоф; Škunca, Nives (ред.). Справочник по генной онтологии. Методы молекулярной биологии. 1446. Дои:10.1007/978-1-4939-3743-1. ISBN 9781493937431. ISSN 1064-3745. S2CID 3708801. открытый доступ
  17. ^ Годе, Паскаль; Шкунца, Нивес; Ху, Джеймс С .; Дессимоз, Кристоф (2017). «Букварь по онтологии генов». Справочник по генной онтологии. Методы молекулярной биологии. 1446. С. 25–37. Дои:10.1007/978-1-4939-3743-1_3. ISBN 978-1-4939-3741-7. ISSN 1064-3745. ЧВК 6377150. PMID 27812933.