WikiDer > Clostridiaceae
 | Эта статья нужны дополнительные цитаты для проверка. (Декабрь 2009 г.) (Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения) |
В Clostridiaceae семья бактериальный учебный класс Clostridia, и содержат род Clostridium.
Семейство Clostridiaceae (научное название), определенное таксономической схемой Руководство Берджи по систематической бактериологии содержит в качестве ядра род Clostridium (Sensu stricto), а также Acetivibrio, Acidaminobacter, Алкалифил, Анаэробактер, Калораматор, Caloranaerobacter, Копробациллы, Дорея, Натронинкола, Оксобактер, Сарцина, Споробактер, Термопрахиум, Thermohalobacter, и Тиндаллия. Предыдущее включение этих дополнительных родов в семейство Clostridiaceae по большей части основано на том, что типовые виды этих родов во многих случаях филогенетически связаны с неправильно классифицированными видами рода. ClostridiumОднако, за исключением Анаэробактер, Калораматор, Оксобактер, Сарцина, и Термопрахиум, эти роды находятся вне зоны действия того, что можно считать истинным семейством Clostridiaceae, и теперь считаются принадлежащими к другим семействам в пределах низкого G + C, грамположительного типа.
Эта неправильная классификация является результатом хорошо известных проблем современной таксономической структуры традиционного рода. Clostridium. Филогенетический анализ Коллинза (1994) был первым крупномасштабным сравнением последовательностей гена 16S рРНК видов рода Clostridium и родственные таксоны. Дело в том, что виды рода Clostridium не образовывали монофилетическую группу, было показано в ряде исследований, в которых небольшие группы Clostridium виды сравнивались еще в 1981 году. Сравнительное исследование Коллинза (1994) и последующие исследования можно использовать для вывода, что более половины видов, отнесенных в настоящее время к этому роду, на самом деле не имеют близкого родства с типовым видом, C. butyricum, и с филогенетической точки зрения не должны включаться в новый определенный род Clostridium.
Это обширное генетическое разнообразие рода Clostridium были показаны с помощью исследований гибридизации 23S рРНК: ДНК еще в 1975 году Джонсоном и Фрэнсисом, но подход к последовательности генов 16S рРНК выявил фактические филогенетические отношения между видами этого рода и другими родами.
Род Clostridium в настоящее время включает 152 достоверно описанных вида в номенклатуре.[3] Однако на основе анализа последовательностей гена 16S рРНК только 73 из них попадают в зону действия типовых видов рода. Clostridium.
Рекомендации
- ^ Прибрам, Эрнст Август: Классификация Schizomyceten. Ф. Дойтике, Лейпциг, (1933), стр. 1–143.
- ^ Lakhal, R; Pradel, N; Postec, A; Оливье, Б; Cayol, JL; Годфрой, А; Фардо, ML; Гале, Г. (сентябрь 2015 г.). «Crassaminicella profunda gen. Nov., Sp. Nov., Анаэробная морская бактерия, выделенная из глубоководных отложений» (PDF). Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 65 (9): 3097–102. Дои:10.1099 / ijsem.0.000386. PMID 26296351.
- ^ www.bacterio.net
