WikiDer > DCP1A

DCP1A
DCP1A
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыDCP1A, HSA275986, Nbla00360, SMAD4IP1, SMIF, декаппинг мРНК 1A
Внешние идентификаторыOMIM: 607010 MGI: 1923151 ГомолоГен: 10178 Генные карты: DCP1A
Расположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек)[1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное расположение DCP1A
Геномное расположение DCP1A
Группа3п21.1Начните53,283,429 бп[1]
Конец53,347,586 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DCP1A 218508 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_018403
NM_001290204
NM_001290205
NM_001290206
NM_001290207

NM_133761

RefSeq (белок)

NP_001277133
NP_001277134
NP_001277135
NP_001277136
NP_060873

NP_598522

Расположение (UCSC)Chr 3: 53,28 - 53,35 МбChr 14: 30,48 - 30,53 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

фермент, расщепляющий мРНК 1A это белок что у людей кодируется DCP1A ген.[5]

Удаление колпачков является ключевым этапом в общем и регулируемом распаде мРНК. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой расщепляющий фермент. Этот белок и другой фермент декапирования образуют комплекс декапирования, который взаимодействует с нонсенс-опосредованным фактором распада hUpf1 и может рекрутироваться в мРНК, содержащие кодоны преждевременной терминации. Этот белок также участвует в сигнальном пути TGF-beta.[5]

Взаимодействия

DCP1A был показан взаимодействовать с DCP2[6] и UPF1.[6] Также было показано, что он сочетается с GW182, и другие маркеры П-боди.[7] DCP1A человека является гетеротримерным,[8] и контактирует с каркасом EDC3 / 4.[9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000272886 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021962 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: DCP1A, гомолог А DCP1-фермента (S. cerevisiae)».
  6. ^ а б Lykke-Andersen J (декабрь 2002 г.). «Идентификация человеческого комплекса декапирования, связанного с белками hUpf в нонсенс-опосредованном распаде». Молекулярная и клеточная биология. 22 (23): 8114–21. Дои:10.1128 / MCB.22.23.8114-8121.2002. ЧВК 134073. PMID 12417715.
  7. ^ Eystathioy T, Jakymiw A, Chan EK, Séraphin B, Cougot N, Fritzler MJ (октябрь 2003 г.). «Белок GW182 колокализуется с белками, ассоциированными с деградацией мРНК hDcp1 и hLSm4 в цитоплазматических тельцах GW». РНК. 9 (10): 1171–3. Дои:10.1261 / rna.5810203. ЧВК 1370480. PMID 13130130.
  8. ^ Тритшлер Ф., Браун Дж. Э., Моц С., Игрежа С., Хаас Дж., Трюффо В., Изаурральде Е., Вайхенридер О. (декабрь 2009 г.). «DCP1 образует асимметричные тримеры для сборки в активные комплексы декапирования мРНК в метазоа». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 106 (51): 21591–6. Bibcode:2009ПНАС..10621591Т. Дои:10.1073 / pnas.0909871106. ЧВК 2789166. PMID 19966221.
  9. ^ Тритшлер Ф., Эулалио А., Трюффо В., Хартманн М.Д., Хелмс С., Шмидт С., Коулз М., Изаурральде Е., Вайхенридер О. (декабрь 2007 г.). «Дивергентная складка Sm в белках EDC3 опосредует связывание DCP1 и нацеливание на P-тела». Молекулярная и клеточная биология. 27 (24): 8600–11. Дои:10.1128 / MCB.01506-07. ЧВК 2169425. PMID 17923697.

дальнейшее чтение