WikiDer > DDX5

DDX5
DDX5
DEAD BOX 5.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыDDX5, G17P1, HLR1, HUMP68, p68, DEAD-box геликаза 5
Внешние идентификаторыOMIM: 180630 MGI: 105037 ГомолоГен: 6797 Генные карты: DDX5
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение DDX5
Геномное расположение DDX5
Группа17q23.3Начните64,498,254 бп[1]
Конец64,508,199 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DDX5 200033 в формате fs.png

PBB GE DDX5 200034 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004396
NM_001320595
NM_001320596
NM_001320597

NM_007840
NM_001355676
NM_001355677

RefSeq (белок)

NP_001307524
NP_001307525
NP_001307526
NP_004387

н / д

Расположение (UCSC)Chr 17: 64,5 - 64,51 МбChr 11: 106,78 - 106,79 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Вероятная АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX5 также известен как Мертвый бокс протеин 5 или РНК геликаза p68 является фермент что у людей кодируется DDX5 ген.[5]

Функция

МЕРТВАЯ коробка белки, характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), предположительно РНК-геликазы. Они участвуют в ряде клеточных процессов, включающих изменение вторичной структуры РНК, таких как инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг, а также сборка рибосом и сплайсосом. Основываясь на паттернах распределения, некоторые члены этого семейства, как полагают, участвуют в эмбриогенезе, сперматогенезе,[6] рост и деление клеток. Этот ген кодирует DEAD-бокс-белок, который представляет собой РНК-зависимую АТФазу, а также связанный с пролиферацией ядерный антиген, специфически реагирующий с опухолевым антигеном вируса обезьяны 40. Этот ген состоит из 13 экзонов, и были обнаружены альтернативно сплайсированные транскрипты, содержащие несколько последовательностей интронов, но не были идентифицированы изоформы, кодируемые этими транскриптами.[5]


Взаимодействия

DDX5 был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108654 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020719 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б "Ген Entrez: DDX5 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) бокс-полипептид 5".
  6. ^ Legrand, JMD; Чан, АЛ; La, HM; Росселло, Ф.Дж.; Änkö, ML; Фуллер-Пейс, ФВ; Хоббс, РМ (23 мая 2019 г.). «DDX5 играет важную транскрипционную и посттранскрипционную роль в поддержании и функционировании сперматогоний». Связь с природой. 10 (1): 2278. Дои:10.1038 / s41467-019-09972-7. PMID 31123254.
  7. ^ Акилесваран Л., Тараска Дж. В., Сайер Дж. А., Геттеми Дж. М., Коглан В. М. (май 2001 г.). «Заякоренный белок А-киназы AKAP95 нацелен на ядерный матрикс и ассоциируется с РНК-геликазой p68». J. Biol. Chem. 276 (20): 17448–54. Дои:10.1074 / jbc.M101171200. PMID 11279182.
  8. ^ Огилви В.К., Уилсон Б.Дж., Николь С.М., Моррис Н.А., Сондерс Л.Р., Барбер Г.Н., Фуллер-Пейс Ф.В. (март 2003 г.). «Родственные DEAD-бокс-РНК-геликазы p68 и p72 существуют в клетках как гетеродимеры». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (5): 1470–80. Дои:10.1093 / нар / gkg236. ЧВК 149829. PMID 12595555.
  9. ^ Уилсон BJ, Giguère V (2007). «Идентификация новых партнеров пути геликаз РНК p68 и p72 с помощью метаанализа Oncomine». BMC Genomics. 8: 419. Дои:10.1186/1471-2164-8-419. ЧВК 3225811. PMID 18005418.
  10. ^ Эндох Х., Маруяма К., Масухиро Й., Кобаяси Й., Гото М., Тай Х., Янагисава Дж., Мецгер Д., Хашимото С., Като С. (август 1999 г.). «Очистка и идентификация РНК-геликазы p68, действующей как транскрипционный коактиватор, специфичный для функции активации 1 рецептора эстрогена человека α». Мол. Cell. Биол. 19 (8): 5363–72. Дои:10.1128 / MCB.19.8.5363. ЧВК 84379. PMID 10409727.
  11. ^ Россоу К.Л., Янкнехт Р. (январь 2003 г.). «Синергизм между РНК-геликазой p68 и коактиваторами транскрипции CBP и p300». Онкоген. 22 (1): 151–6. Дои:10.1038 / sj.onc.1206067. PMID 12527917.
  12. ^ Николь С.М., Каушевич М., Прескотт А.Р., Фуллер-Пейс Ф.В. (июнь 2000 г.). «Ядерная DEAD-бокс-РНК геликаза p68 взаимодействует с ядрышковым белком фибрилларином и специфически колокализуется в формирующихся ядрышках во время телофазы». Exp. Cell Res. 257 (2): 272–80. Дои:10.1006 / excr.2000.4886. PMID 10837141.
  13. ^ Уилсон Б.Дж., Бейтс Г.Дж., Никол С.М., Грегори Д.Д., Перкинс Н.Д., Фуллер-Пейс Ф.В. (август 2004 г.). «РНК-геликазы DEAD-бокса p68 и p72 взаимодействуют с HDAC1 и подавляют транскрипцию промотор-специфическим образом». BMC Mol. Биол. 5: 11. Дои:10.1186/1471-2199-5-11. ЧВК 514542. PMID 15298701.
  14. ^ а б c Ватанабэ М., Янагисава Дж., Китагава Х., Такэяма К., Огава С., Арао Й., Сузава М., Кобаяси Й., Яно Т., Йошикава Х., Масухиро И, Като С. (март 2001 г.). «Подсемейство РНК-связывающих белков DEAD-бокса действует как коактиватор рецептора эстрогена α через N-концевой домен активации (AF-1) с коактиватором РНК, SRA». EMBO J. 20 (6): 1341–52. Дои:10.1093 / emboj / 20.6.1341. ЧВК 145523. PMID 11250900.
  15. ^ Bates GJ, Nicol SM, Wilson BJ, Jacobs AM, Bourdon JC, Wardrop J, Gregory DJ, Lane DP, Perkins ND, Fuller-Pace FV (февраль 2005 г.). «DEAD-бокс-белок p68: новый коактиватор транскрипции супрессора опухоли p53». EMBO J. 24 (3): 543–53. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600550. ЧВК 548656. PMID 15660129.
  16. ^ Яо Х, Брик К., Эврард Й, Сяо Т., Камерини-Отеро Р. Д., Фельзенфельд Г. (2010). «Посредничество транскрипционной изоляции CTCF с помощью DEAD-бокса РНК-связывающего белка p68 и активатора РНК стероидного рецептора SRA». Genes Dev. 24 (22): 2543–2555. Дои:10.1101 / gad.1967810. ЧВК 2975930. PMID 20966046.

дальнейшее чтение