WikiDer > DGCR8

DGCR8
DGCR8
Белок DGCR8 PDB 1x47.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыDGCR8, C22orf12, DGCRK6, Gy1, pasha, Pasha, субъединица микропроцессорного комплекса DGCR8, субъединица микропроцессорного комплекса
Внешние идентификаторыOMIM: 609030 MGI: 2151114 ГомолоГен: 11223 Генные карты: DGCR8
Расположение гена (человек)
Хромосома 22 (человек)
Chr.Хромосома 22 (человек)[1]
Хромосома 22 (человек)
Геномное расположение DGCR8
Геномное расположение DGCR8
Группа22q11.21Начните20,080,232 бп[1]
Конец20,111,877 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DGCR8 219811 в формате fs.png

PBB GE DGCR8 218650 в формате fs.png

PBB GE DGCR8 64474 г в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001190326
NM_022720

NM_033324

RefSeq (белок)

NP_001177255
NP_073557

NP_201581

Расположение (UCSC)Chr 22: 20.08 - 20.11 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

В DGCR8 подблок микропроцессорного комплекса (Синдром ДиДжорджи хромосомный [или критический] регион 8) это белок что у людей кодируется DGCR8 ген.[4] У других животных, особенно у обычных модельные организмы Drosophila melanogaster и Caenorhabditis elegans, белок известен как Паша (партнер Дроша).[5] Это обязательный компонент РНК-интерференция путь.

Функция

DGCR8 локализован на ядро клетки и требуется для микроРНК (miRNA) процессинг. Он привязан к Дроша, РНКаза III фермент, чтобы сформировать Микропроцессорный комплекс который рассекает первичная стенограмма известная как при-миРНК к характеристике стебель-петля структура, известная как пре-миРНК, которая затем обрабатывается ферментом до фрагментов миРНК. Дайсер. DGCR8 содержит РНК-связывающий домен и, как полагают, связывает pri-miRNA, чтобы стабилизировать ее для процессинга Drosha.[6]

DGCR8 также необходим для некоторых типов репарации ДНК. Удаление УФ-индуцированной ДНК фототовары, в течение эксцизионная репарация связанных с транскрипцией нуклеотидов (TC-NER), зависит от фосфорилирования JNK DGCR8 на серин 153.[7] Хотя известно, что DGCR8 действует в биогенезе микроРНК, эта активность не требуется для DGCR8-зависимого удаления УФ-индуцированных фотопродуктов.[7] Эксцизионная репарация нуклеотидов также необходим для восстановления окислительного повреждения ДНК из-за пероксид водорода (ЧАС2О2), а клетки, истощенные по DGCR8, чувствительны к ЧАС2О2.[7]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000128191 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ген Энтреса: ген 8 критической области синдрома ДиДжорджи DGCR8».
  5. ^ Denli AM, Tops BB, Plasterk RH, Ketting RF, Hannon GJ (ноябрь 2004 г.). «Обработка первичных микроРНК микропроцессорным комплексом». Природа. 432 (7014): 231–5. Дои:10.1038 / природа03049. PMID 15531879.
  6. ^ Еом К.Х., Ли Й., Хан Дж., Сух М.Р., Ким В.Н. (2006). "Характеристика DGCR8 / Pasha, важного кофактора Drosha в первичном процессинге miRNA". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (16): 4622–9. Дои:10.1093 / нар / gkl458. ЧВК 1636349. PMID 16963499.
  7. ^ а б c Calses PC, Dhillon KK, Tucker N, Chi Y, Huang JW, Kawasumi M, Nghiem P, Wang Y, Clurman BE, Jacquemont C, Gafken PR, Sugasawa K, Saijo M, Taniguchi T (2017). «DGCR8 опосредует восстановление повреждений ДНК, вызванных ультрафиолетом, независимо от обработки РНК». Сотовый представитель. 19 (1): 162–174. Дои:10.1016 / j.celrep.2017.03.021. ЧВК 5423785. PMID 28380355.

дальнейшее чтение