WikiDer > DNMT1

DNMT1
DNMT1
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыDNMT1, ADCADN, AIM, CXXC9, DNMT, HSN1E, MCMT, m.HsaI, ДНК (цитозин-5 -) - метилтрансфераза 1, ДНК-метилтрансфераза 1
Внешние идентификаторыOMIM: 126375 MGI: 94912 ГомолоГен: 124071 Генные карты: DNMT1
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение DNMT1
Геномное расположение DNMT1
Группа19p13.2Начинать10,133,345 бп[1]
Конец10,231,286 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DNMT1 201697 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001130823
NM_001379
NM_001318730
NM_001318731

NM_001199431
NM_001199432
NM_001199433
NM_010066
NM_001314011

RefSeq (белок)

NP_001124295
NP_001305659
NP_001305660
NP_001370

NP_001186360
NP_001186361
NP_001186362
NP_001300940
NP_034196

Расположение (UCSC)Chr 19: 10.13 - 10.23 МбChr 9: 20.91 - 20.96 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

ДНК (цитозин-5) -метилтрансфераза 1 является фермент который катализирует перенос метильных групп в определенные структуры CpG в ДНК, процесс, называемый Метилирование ДНК. У человека он кодируется DNMT1 ген.[5] DNMT1 является частью семейства ДНК-метилтрансфераза ферменты, состоящие в основном из DNMT1, DNMT3A, и DNMT3B.

Функция

Этот фермент отвечает за поддерживающее метилирование ДНК, что обеспечивает точность воспроизведения унаследованных эпигенетических паттернов. Он имеет очень отчетливое предпочтение метилирования CpG на гемиметилированной ДНК.[6] Аберрантные паттерны метилирования связаны с некоторыми опухолями и аномалиями развития человека.[7][8]

Смотрите также

Взаимодействия

DNMT1 был показан взаимодействовать с UHRF1 ,:

DNMT1 хорошо транскрибируется во время S-фазы клеточного цикла, когда он необходим для метилирования вновь созданных гемиметилированных сайтов на дочерних цепях ДНК.[16] Его взаимодействие с PCNA и UHRF1 вовлечено в его локализацию в репликационной вилке.[17] Прямое сотрудничество между DNMT1 и G9a координирует метилирование ДНК и H3K9 во время деления клетки.[15] Это метилирование хроматина необходимо для стабильной репрессии экспрессии генов во время развития млекопитающих.

Модельные организмы

Нокаут-эксперименты показали, что этот фермент ответственен за основную часть метилирования в клетках мыши и важен для эмбрионального развития.[18] Также было показано, что отсутствие как материнского, так и зиготического Dnmt1 приводит к полному деметилированию импринтированных генов в бластоцистах.[19]

Клиническое значение

DNMT1 играет важную роль в поддержании гемопоэтических стволовых клеток (HSC). HSC с пониженным DNMT1 не могут эффективно самообновляться после трансплантации.[20] Также было показано, что он имеет решающее значение для других типов стволовых клеток, таких как стволовые клетки кишечника (ISC) и стволовые клетки молочных желез (MaSC). Условная делеция DNMT1 приводит к общему гипометилированию кишечника, расширению крипт и изменению времени дифференцировки ISC, а также к пролиферации и поддержанию MaSCs.[21]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000130816 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000004099 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Йен Р. У., Вертино П. М., Нелкин Б. Д., Ю. Д. Дж., Эль-Дейри В., Кумарасвами А., Леннон Г. Г., Траск Б. Д., Челано П., Бейлин С. Б. (май 1992 г.). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей метилтрансферазу ДНК человека». Исследования нуклеиновых кислот. 20 (9): 2287–91. Дои:10.1093 / nar / 20.9.2287. ЧВК 312343. PMID 1594447.
  6. ^ Германн А., Гоял Р., Елч А. (ноябрь 2004 г.). «ДНК- (цитозин-C5) -метилтрансфераза Dnmt1 метилирует ДНК процессивно с большим предпочтением гемиметилированных сайтов-мишеней». Журнал биологической химии. 279 (46): 48350–9. Дои:10.1074 / jbc.M403427200. PMID 15339928.
  7. ^ Кляйн С.Дж., Ботуян М.В., Ву Й., Уорд С.Дж., Николсон Г.А., Хамманс С., Ходжо К., Яманиши Х., Карпф А.Р., Уоллес, округ Колумбия, Саймон М., Лендер С., Бордман Л.А., Каннингем Дж.М., Смит Г.Э., Личи В.Дж., Боэс Б. , Аткинсон Э. Дж., Мидда С., Б. Дайк П. Дж., Паризи Дж. Э., Мер Дж., Смит Д. И., Дайк П. Дж. (Июнь 2011 г.). «Мутации в DNMT1 вызывают наследственную сенсорную невропатию с деменцией и потерей слуха». Природа Генетика. 43 (6): 595–600. Дои:10,1038 / нг. 830. ЧВК 3102765. PMID 21532572.
  8. ^ «Ген Entrez: ДНК DNMT1 (цитозин-5 -) - метилтрансфераза 1».
  9. ^ а б c Rountree MR, Bachman KE, Baylin SB (июль 2000 г.). «DNMT1 связывает HDAC2 и новый корепрессор, DMAP1, с образованием комплекса в фокусах репликации». Природа Генетика. 25 (3): 269–77. Дои:10.1038/77023. PMID 10888872. S2CID 26149386.
  10. ^ а б Ким Г.Д., Ни Дж., Келесоглу Н., Робертс Р.Дж., Прадхан С. (август 2002 г.). «Взаимодействие и связь между поддерживающими людьми человека и de novo ДНК (цитозин-5) метилтрансферазами». Журнал EMBO. 21 (15): 4183–95. Дои:10.1093 / emboj / cdf401. ЧВК 126147. PMID 12145218.
  11. ^ Ленертц Б., Уэда Ю., Дерик А.А., Брауншвейг Ю., Перес-Бургос Л., Кубичек С., Чен Т., Ли Е., Йенувейн Т., Петерс А.Х. (июль 2003 г.). «Suv39h-опосредованное метилирование лизина 9 гистона H3 направляет метилирование ДНК в основные сателлитные повторы в перицентрическом гетерохроматине». Текущая биология. 13 (14): 1192–200. Дои:10.1016 / s0960-9822 (03) 00432-9. PMID 12867029.
  12. ^ Иида Т., Суетаке I, Таджима С., Мориока Х, Охта С., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Зажим PCNA способствует действию ДНК-цитозинметилтрансферазы 1 на гемиметилированную ДНК». Гены в клетки. 7 (10): 997–1007. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2002.00584.x. PMID 12354094. S2CID 25310911.
  13. ^ Чуанг Л.С., Ян Х.И., Ко Т.В., Нг ХХ, Сюй Г., Ли Б.Ф. (сентябрь 1997 г.). «Комплекс ДНК человека- (цитозин-5) метилтрансфераза-PCNA как мишень для p21WAF1». Наука. 277 (5334): 1996–2000. Дои:10.1126 / science.277.5334.1996. PMID 9302295.
  14. ^ Робертсон К.Д., Айт-Си-Али С., Йокочи Т., Уэйд П.А., Джонс П.Л., Вольф А.П. (июль 2000 г.). «DNMT1 образует комплекс с Rb, E2F1 и HDAC1 и репрессирует транскрипцию с E2F-чувствительных промоторов». Природа Генетика. 25 (3): 338–42. Дои:10.1038/77124. PMID 10888886. S2CID 10983932.
  15. ^ а б Estève PO, Chin HG, Smallwood A, Feehery GR, Gangisetty O, Karpf AR, Carey MF, Pradhan S (ноябрь 2006 г.). «Прямое взаимодействие между DNMT1 и G9a координирует метилирование ДНК и гистонов во время репликации». Гены и развитие. 20 (22): 3089–103. Дои:10.1101 / gad.1463706. ЧВК 1635145. PMID 17085482.
  16. ^ Робертсон К.Д., Кейомарси К., Гонзалес Ф.А., Велическу М., Джонс П.А. (май 2000 г.). «Дифференциальная экспрессия мРНК метилтрансфераз ДНК человека (DNMT) 1, 3a и 3b во время фазового перехода G (0) / G (1) в S в нормальных и опухолевых клетках». Исследования нуклеиновых кислот. 28 (10): 2108–13. Дои:10.1093 / nar / 28.10.2108. ЧВК 105379. PMID 10773079.
  17. ^ Джонс П.А., Лян Джи (ноябрь 2009 г.). «Переосмысление того, как поддерживаются паттерны метилирования ДНК». Обзоры природы. Генетика. 10 (11): 805–11. Дои:10.1038 / nrg2651. ЧВК 2848124. PMID 19789556.
  18. ^ Ли Э., Бестор Т.Х., Яениш Р. (июнь 1992 г.). «Целенаправленная мутация гена ДНК-метилтрансферазы приводит к гибели эмбрионов». Клетка. 69 (6): 915–26. Дои:10.1016 / 0092-8674 (92) 90611-Ф. PMID 1606615. S2CID 19879601.
  19. ^ Хирасава Р., Чиба Х., Канеда М., Таджима С., Ли Е., Яениш Р., Сасаки Х. (июнь 2008 г.). «Материнский и зиготический Dnmt1 необходимы и достаточны для поддержания отпечатков метилирования ДНК во время доимплантационного развития». Гены и развитие. 22 (12): 1607–16. Дои:10.1101 / gad.1667008. ЧВК 2428059. PMID 18559477.
  20. ^ Троубридж Дж. Дж., Сноу Дж. В., Ким Дж., Оркин Ш. (октябрь 2009 г.). «ДНК-метилтрансфераза 1 важна и уникально регулирует кроветворные стволовые клетки и клетки-предшественники». Стволовая клетка клетки. 5 (4): 442–9. Дои:10.1016 / j.stem.2009.08.016. ЧВК 2767228. PMID 19796624.
  21. ^ Августинова А., Бенита С.А. (октябрь 2016 г.). «Эпигенетический контроль функции взрослых стволовых клеток». Обзоры природы. Молекулярная клеточная биология. 17 (10): 643–58. Дои:10.1038 / nrm.2016.76. PMID 27405257. S2CID 24795361.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка