WikiDer > Дермцидин

Dermcidin
DCD
Дермцидин-1L 2KSG.png
Доступные конструкции
PDBПоиск Human UniProt: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыDCD, AIDD, DCD-1, DSEP, HCAP, PIF, дермцидин
Внешние идентификаторыOMIM: 606634 ГомолоГен: 89039 Генные карты: DCD
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное местоположение для DCD
Геномное местоположение для DCD
Группа12q13.2Начинать54,644,589 бп[1]
Конец54,648,493 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DCD gnf1h01261 ​​на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_053283
NM_001300854

н / д

RefSeq (белок)

NP_001287783
NP_444513

н / д

Расположение (UCSC)Chr 12: 54,64 - 54,65 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Дермицидин, также известный как фактор, индуцирующий протеолиз (СДС), это белок что у людей кодируется DCD ген.[3][4] Это антимикробный пептид[4] секретируется человеком эккринные потовые железы на кожу как часть врожденной защиты иммунной системы хозяина. Он также участвует в протеолизе.[4]

Функция

Дермицидин - это секретируемый белок, который впоследствии превращается в зрелые пептиды с различными биологическими активностями. С-концевой пептид конститутивно экспрессируется в поте и обладает антибактериальным и противогрибковым действием. N-концевой пептид, также известный как диффузный пептид уклонения от выживания, способствует выживанию нервных клеток в условиях тяжелого окислительного стресса. Гликозилированная форма N-концевого пептида может быть связана с кахексией (мышечным истощением) у онкологических больных.[4]

      Пептид уклонения от выживания                            Антимикробный пептидYDPEAASAPGSGNPCHEASAAQKENAGEDPGLARQAPKPRKQRSSLLEKGLDGAKKAVGGLGKLGKDAVEDLESVGKGAVHDVKDVLDSVL

C-концевой предшественник DCD-1L представляет собой пептид из 48 остатков, который демонстрирует частичную спиральность в растворе, о чем свидетельствует определение структуры его раствора с помощью ЯМР и CD-спектроскопии. Полноразмерный предшественник обрабатывается неопределенными протеазами, присутствующими в поту человека, с образованием нескольких более коротких пептидов, которые проявляют разную антимикробную активность, названных в соответствии с их С-концевым триплетом аминокислот и длиной их остатков. Одним из таких активных пептидов является SSL25, который демонстрирует двукратное увеличение активности против E.coli по сравнению с DCD-1L.[5]

DCD-1L SSLLEKGLDGAKKAVGGLGKLGKDAVEDLESVGKGAVHDVKDVLDSVLDCD-1 SSLLEKGLDGAKKAVGGLGKLGKDAVEDLESVGKGAVHDVKDVLDSKSSL25 SSLLEKAVGLDGLDGAK

Механизм

Кристаллическая структура дермицидина была решена в растворе, чтобы выявить гексамерный спиральный пучок, опосредованный связыванием иона Zn.[6] Наблюдается, что это формирует наклонный канал в мембранах при компьютерном исследовании с помощью моделирования молекулярной динамики, и один из предполагаемых механизмов противомикробного действия, выведенный из этого наблюдения, заключается в разделении ионного градиента через биологические мембраны. Это подтверждается одновременными наблюдениями в экспериментальных исследованиях зависимой от напряжения деполяризации липидных бислоев.

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000161634 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ Schittek B, Hipfel R, Sauer B, Bauer J, Kalbacher H, Stevanovic S, Schirle M, Schroeder K, Blin N, Meier F, Rassner G, Garbe C (ноябрь 2001 г.). «Дермицидин: новый человеческий пептид-антибиотик, секретируемый потовыми железами». Нат Иммунол. 2 (12): 1133–7. Дои:10.1038 / ni732. PMID 11694882. S2CID 26126901.
  4. ^ а б c d "Entrez Gene: DCD дермицидин".
  5. ^ Baechle D, Flad T, Cansier A и др. (2006). «Катепсин D присутствует в эккринном поте человека и участвует в постсекреторном процессинге антимикробного пептида DCD-1L». J. Biol. Chem. 281 (9): 5406–15. Дои:10.1074 / jbc.M504670200. PMID 16354654.
  6. ^ PDB: 2YMKСонг, Чен; Вайхбродт, Конрад; Сальников, Евгений С; Диновски, Марек; Форсберг, Бьорн О; Бехингер, Буркхард; Стейнем, Клаудиа; де Гроот, Берт Л.; Захария, Ульрих; Зет, Корнелиус (февраль 2013 г.). «Кристаллическая структура и механизм функционирования антимикробного мембранного канала человека». PNAS. 110 (12): 4586–91. Дои:10.1073 / pnas.1214739110. ЧВК 3607029. PMID 23426625.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка