WikiDer > Даблкортин

Doublecortin
DCX
Белок DCX PDB 1mjd.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыDCX, DBCN, DC, LISX, SCLH, XLIS, даблкортин
Внешние идентификаторыOMIM: 300121 MGI: 1277171 ГомолоГен: 7683 Генные карты: DCX
Расположение гена (человек)
Х-хромосома (человек)
Chr.Х-хромосома (человек)[1]
Х-хромосома (человек)
Геномное расположение DCX
Геномное расположение DCX
ГруппаXq23Начните111,293,779 бп[1]
Конец111,412,429 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DCX 204850 s в формате fs.png

PBB GE DCX 204851 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001110222
NM_001110223
NM_001110224
NM_010025

RefSeq (белок)

NP_001103692
NP_001103693
NP_001103694
NP_034155

Расположение (UCSC)Chr X: 111.29 - 111.41 МбChr X: 143,86 - 143,93 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок миграции нейронов даблкортин, также известен как дублин или лиссэнцефалин-X это белок что у людей кодируется DCX ген.[5]

Функция

Экспрессия даблкортина у крыс зубчатые извилины, 21 послеродовой день. Oomen et al., 2009.[6]

Даблкортин (DCX) - это микротрубочка-ассоциированный белок, экспрессируемый нейрональными клетками-предшественниками и незрелыми нейроны в корковых структурах эмбриона и взрослых. Клетки-предшественники нейронов начинают экспрессировать DCX при активном делении, а их дочерние нейрональные клетки продолжают экспрессировать DCX в течение 2–3 недель по мере того, как клетки созревают в нейроны. Подавление DCX начинается через 2 недели и происходит в то же время, когда эти клетки начинают экспрессировать NeuN, маркер зрелых нейронов.[7]

Из-за почти исключительной экспрессии DCX в развивающихся нейронах это белок все чаще используется как маркер для нейрогенез. Действительно, уровни экспрессии DCX повышаются в ответ на упражнения,[8] и это увеличение происходит параллельно с увеличением Брду маркировка, которая в настоящее время является «золотым стандартом» в измерении нейрогенеза.

Было обнаружено, что даблкортин связывать к микротрубочка цитоскелет. В естественных условиях и in vitro Анализы показывают, что Doublecortin стабилизирует микротрубочки и вызывает образование пучков.[9] Даблкортин - это основной белок с изоэлектрическая точка из 10 типичных для связывания микротрубочек белки.

Выбить мышь

Двухслойный гиппокамп у мышей с нокаутом Doublecortin (правые панели) по сравнению с нормальным гиппокампом у мышей дикого типа (левые панели). Рисунок извлечен из работы лаборатории г. Фиона Фрэнсис

У мышей, у которых был обнаружен ген Doublecortin выбит, корковые слои по-прежнему правильно сформированы. Однако гиппокамп у этих мышей обнаруживается дезорганизация в области CA3. Обычно один слой пирамидные клетки у мутантов рассматривается как двойной слой. Эти мыши также ведут себя иначе, чем их однопометники дикого типа, и страдают эпилепсией.[10]

Структура

Даблкортин
PDB 1uf0 EBI.jpg
структура раствора N-концевого домена dcx двойной кортин-подобной киназы человека
Идентификаторы
СимволDCX
PfamPF03607
ИнтерПроIPR003533
SCOP21mfw / Объем / СУПФАМ
CDDcd01617

Подробный последовательность анализ Doublecortin и Doublecortin-подобных белков позволил идентифицировать тандемный повтор эволюционно сохраненный Даблкортин (ДК) домены. Эти домены находятся в N конечная белков и состоит из тандемно повторяющихся копий примерно 80 аминокислоты область, край. Было высказано предположение, что первый DC-домен Doublecortin связывает тубулин и усиливает полимеризацию микротрубочек.[11]

Было показано, что даблкортин влияет на структуру микротрубочек. Зарождение микротрубочек in vitro в присутствии Doublecortin имеют почти исключительно 13 протофиламентов, тогда как ядро ​​микротрубочек без Doublecortin присутствует в диапазоне различных размеров.

Взаимодействия

Даблкортин показал взаимодействовать с участием PAFAH1B1.[12]

Клиническое значение

Даблкортин мутирует в Х-сцепленный лиссэнцефалия и синдром двойной коры головного мозга, и клинические проявления связаны с полом. У мужчин Х-сцепленная лизэнцефалия приводит к гладкому мозгу из-за отсутствия миграции незрелых нейронов, которые обычно способствуют складчатости поверхности мозга. Синдром двойной коры характеризуется аномальной миграцией нервной ткани во время развития, что приводит к появлению двух полос неуместных нейронов в подкорковом белке, образующих две кортикальные слои, что и дает название синдрому; это открытие обычно происходит у женщин.[13] Мутация была обнаружена Джозеф Глисон и Кристофер А. Уолш в Бостоне.[14][15]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000077279 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031285 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ EntrezGene 1641
  6. ^ Oomen CA, Girardi CE, Cahyadi R, Verbeek EC, Krugers H, Joëls M, Lucassen PJ (2009). «Противоположные эффекты ранней материнской депривации на нейрогенез у самцов и самок крыс». PLOS ONE. 4 (1): e3675. Bibcode:2009PLoSO ... 4.3675O. Дои:10.1371 / journal.pone.0003675. ЧВК 2629844. PMID 19180242.
  7. ^ Brown JP, Couillard-Després S, Cooper-Kuhn CM, Winkler J, Aigner L, Kuhn HG (декабрь 2003 г.). «Временная экспрессия даблкортина во время нейрогенеза у взрослых». J. Comp. Neurol. 467 (1): 1–10. Дои:10.1002 / cne.10874. PMID 14574675. S2CID 25315374.
  8. ^ Couillard-Despres S, Winner B, Schaubeck S, Aigner R, Vroemen M, Weidner N, Bogdahn U, Winkler J, Kuhn HG, Aigner L (январь 2005 г.). «Уровни экспрессии даблкортина в мозге взрослого человека отражают нейрогенез». Евро. J. Neurosci. 21 (1): 1–14. Дои:10.1111 / j.1460-9568.2004.03813.x. PMID 15654838.
  9. ^ Хореш Д., Сапир Т., Фрэнсис Ф., Вольф С. Г., Каспи М., Эльбаум М., Челли Дж., Райнер О. (сентябрь 1999 г.). «Даблкортин, стабилизатор микротрубочек». Гм. Мол. Genet. 8 (9): 1599–610. Дои:10.1093 / hmg / 8.9.1599. PMID 10441322.
  10. ^ Ностен-Бертран М., Каппелер С., Динокур С., Дени С., Жермен Дж., Фан Динь Туй Ф, Верстратен С., Альварес С., Метин С., Челли Дж., Гирос Б., Майлз Р., Деполис А., Фрэнсис Фрэнсис (2008-06- 25). «Эпилепсия у мышей с нокаутом Dcx, связанная с дискретными дефектами ламинирования и повышенной возбудимостью в гиппокампе». PLOS ONE. 3 (6): e2473. Bibcode:2008PLoSO ... 3.2473N. Дои:10.1371 / journal.pone.0002473. ЧВК 2429962. PMID 18575605.
  11. ^ Сапир Т., Хореш Д., Каспи М., Атлас Р., Берджесс Х.А., Вольф С.Г., Фрэнсис Ф., Челли Дж., Эльбаум М., Пьетроковски С., Райнер О. (март 2000 г.). «Кластер мутаций даблкортина в эволюционно консервативных функциональных доменах». Гм. Мол. Genet. 9 (5): 703–12. Дои:10,1093 / hmg / 9,5,703. PMID 10749977.
  12. ^ Каспи М., Атлас Р., Кантор А., Сапир Т., Райнер О. (сентябрь 2000 г.). «Взаимодействие между LIS1 и даблкортином, двумя продуктами гена лиссэнцефалии». Гм. Мол. Genet. 9 (15): 2205–13. Дои:10.1093 / oxfordjournals.hmg.a018911. PMID 11001923.
  13. ^ Онлайн-менделевское наследование в человеке (OMIM): Даблкортин - 300121
  14. ^ Глисон Дж. Г., Аллен К. М., Фокс Дж. В., Ламперти Э. Д., Беркович С., Шеффер И., Купер Э. К., Добинс В. Б., Миннерат С. Р., Росс М. Е., Уолш, Калифорния (январь 1998 г.). «Даблкортин, специфический для мозга ген, мутировавший при Х-сцепленной лизэнцефалии человека и синдроме двойной коры головного мозга, кодирует предполагаемый сигнальный белок». Ячейка. 92 (1): 63–72. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80899-5. PMID 9489700.
  15. ^ Левенштейн DH (2011). «Судороги и эпилепсия». В Loscalzo J, Longo DL, Fauci AS, Kasper DL, Hauser SL (ред.). Принципы внутренней медицины Харрисона (18-е изд.). McGraw-Hill Professional. С. 3251–3269. ISBN 978-0-07-174889-6.

дальнейшее чтение

внешние ссылки


Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR003533