WikiDer > Энтатическое состояние

Entatic state

В биоинорганическая химия, энтатическое состояние представляет собой «состояние атома или группы, геометрическое или электронное состояние которого из-за связывания с белком адаптировано для функционирования».[1] Этот термин был придуман Валле и Уильямсом,[2] основан на «реечном механизме» Мальмстрома.[3] Считается, что эти состояния улучшают химию ионов металлов в биологическом катализе.[4]

Примером энтатического состояния является центр меди в пластоцианин, окислительно-восстановительный фермент. В этом белке медь перемещается между окисленным и восстановленным состояниями, Cu2+ и Cu+, соответственно. Каждая степень окисления предпочитает разные координационная геометрия: в то время как медь (II) обычно имеет плоскую квадратную форму и предпочитает твердые основы такие как кислородные и азотные лиганды, медь (I) обычно является тетраэдрической и связывается преимущественно с мягкими основаниями, такими как лиганды серы. Поскольку скорость переноса электронов зависит от реорганизационная энергия, идеальная скорость могла бы быть получена для центров Cu, имеющих промежуточную геометрию между требованиями каждой степени окисления. Фактически, сайт Cu не является ни плоским, ни тетраэдрическим, он считается искаженным тетраэдрическим, с двумя лигандами азота от остатков гистидина и двумя лигандами серы от остатков метионина и цистеина, и поэтому может считаться энтатическим состоянием. Согласно гипотезе энтатического состояния, искажение является результатом деформации, вызванной связыванием лигандов с относительной ориентацией, которая заранее задана белком.

Некоторые теоретические расчеты показывают, что модельная система может иметь геометрию, аналогичную наблюдаемой в белке, без какой-либо деформации; эти результаты, однако, остаются спорными.[3]

Рекомендации

  1. ^ ИЮПАК, Сборник химической терминологии2-е изд. («Золотая книга») (1997). Исправленная онлайн-версия: (1997) "Энтатическое состояние". Дои:10.1351 / goldbook.ET06763
  2. ^ Валле Б.Л., Уильямс RJP (1968) Proc Natl Acad Sci USA 59, 498.
  3. ^ а б Николас Кальцояннис; Джон Э. Макгрейди; Йохен Аутшбах (2004). Принципы и приложения функциональной теории плотности в неорганической химии. Springer. стр.47–49. ISBN 3-540-21861-0.
  4. ^ Перри А. Фрей; Адриан Д. Хегеман. Механизмы ферментативных реакций. Издательство Оксфордского университета. п. 210. ISBN 0-19-512258-5.