WikiDer > Фимбрин

Fimbrin
PLS1
PDB 1pxy EBI.jpg
Идентификаторы
ПсевдонимыPLS1, Фимбрин, пластин 1, DFNA76
Внешние идентификаторыOMIM: 602734 MGI: 104809 ГомолоГен: 68270 Генные карты: PLS1
Расположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек)[1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное расположение PLS1
Геномное расположение PLS1
Группа3q23Начинать142,596,393 бп[1]
Конец142,713,664 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001145319
NM_001172312
NM_002670

NM_001033210

RefSeq (белок)

NP_001138791
NP_001165783
NP_002661

NP_001028382

Расположение (UCSC)Chr 3: 142,6 - 142,71 МбChr 9: 95,75 - 95,85 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фимбрин также известен как пластин 1 это белок что у человека кодируется PLS1 ген.[5] Фимбрин - это актин сшивающий белок, важный в образовании филоподия.

Структура

Фимбрин принадлежит к кальпонин гомология (CH) доменное суперсемейство белков, сшивающих актин. Как и другие члены этого суперсемейства, в которое входят α-актинин, β-спектрин, дистрофин, АБП-120 и филамин, он имеет консервативный актин-связывающий домен 27 кДа, который содержит тандемную дупликацию последовательности, гомологичной кальпонину. Помимо перекрестного связывания актиновых филаментов в пучки и сети, домены CH также связывают промежуточные нити и некоторые белки сигнальной трансдукции к актину цитоскелет. Структурное сравнение актиновых филаментов и актиновых филаментов, декорированных CH-доменом фимбрина, выявило изменения в структуре актина из-за опосредованного фимбрином перекрестного связывания, которое может влиять на сродство актиновых филаментов к другим актин-связывающим белкам и может быть частью регуляции сам цитоскелет.[6]

У людей три высокогомологичных, строго тканевых и локальных изоформы были идентифицированы: I-, T- и L-фимбрин.[6] L-фимбрин встречается только в нормальных или преобразованных лейкоциты где это становится фосфорилированный в ответ на другие факторы, такие как интерлейкин-1. И-фимбрин экспрессируется эпителиальными клетками кишечника и почек.[7] Т-фимбрин содержится в эпителиальный и мезенхимальный клетки, полученные из твердой ткани, где она не фосфорилируется. Различия в экспрессии, последовательности и фосфорилировании среди различных изоформ фимбрина указывают на вероятность функциональных различий.[7]

Функция

Фимбрин присутствует в нескольких различных структурах в разных типах клеток, включая кишечные. микроворсинки, волосковая клетка стереоцилии и фибробласт филоподия.[7] Обычно это связано с поляризованными актиновыми филаментами в мембранные оборки, филоподии, стереоцилии и адгезионные бляшки. Гомология последовательностей и биохимические свойства показывают, что фимбрин высоко консервативен от дрожжей до человека. Мутанты дрожжей, лишенные фимбрина, дефектны в морфогенез и эндоцитоз.[6]

Из-за непосредственной близости тандемных актин-связывающих доменов фимбрин управляет образованием плотно связанных актиновых филаментов, которые участвуют в динамических процессах, включая цитокинез при инвазии дрожжей и клеток-хозяев энтеропатические бактерии. Хотя участие фимбрина в подобных процессах, а также его роль в сборке и регуляции сетей микрофиламентов хорошо документированы, имеется меньше экспериментальных данных, описывающих общую доменную организацию молекулы. Кляйн и другие. (2004) подробно описали кристаллическую структуру Arabidopsis thaliana и Schizosaccharomyces pombe ядра фимбрина в попытке подчеркнуть компактную и отчетливо асимметричную организацию молекулы фимбрина. Это структурное исследование ядра фимбрина представляет собой первое подробное структурное описание функционального белка, связывающего актин.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120756 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000049493 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ «Энтрез Джин: Пластин 1».
  6. ^ а б c де Арруда М.В., Уотсон С., Лин С.С., Ливитт Дж., Мацудаира П. (сентябрь 1990 г.). «Фимбрин является гомологом цитоплазматического фосфопротеина пластина и имеет домены, гомологичные кальмодулину и белкам гелеобразования актина». J. Cell Biol. 111 (3): 1069–79. Дои:10.1083 / jcb.111.3.1069. ЧВК 2116281. PMID 2391360.
  7. ^ а б c Чафель М.М., Шен В., Мацудаира П. (июнь 1995 г.). «Последовательная экспрессия и дифференциальная локализация I-, L- и T-фимбрина во время дифференцировки кишечника мыши и желточного мешка». Дев Дин. 203 (2): 141–51. Дои:10.1002 / aja.1002030203. PMID 7655078. S2CID 20594198.
  8. ^ Кляйн М.Г., Ши В., Рамагопал Ю., Ценг Ю., Вирц Д., Ковар Д. Р., Стайгер С. Дж., Альмо СК (июнь 2004 г.). «Структура актинового перекрестно сшивающего ядра фимбрина» (PDF). Структура. 12 (6): 999–1013. Дои:10.1016 / j.str.2004.04.010. PMID 15274920.

дальнейшее чтение