WikiDer > Флуктуационное рассеяние рентгеновских лучей - Википедия

Эксперимент по флуктуационному рассеянию собирает серию снимков дифракции рентгеновских лучей нескольких белков (или других частиц) в растворе. Сверхъяркий рентгеновский лазер обеспечивает быстрые снимки, содержащие неизотропные по углам элементы (спеклы), что в конечном итоге приводит к детальному пониманию структуры образца.

Флуктуационное рассеяние рентгеновских лучей (FXS)^[1][2] является Метод рентгеновского рассеяния похожий на малоугловое рассеяние рентгеновских лучей (SAXS), но выполняется с использованием рентгеновских снимков ниже образца вращательная диффузия раз. Этот метод идеально подходит для использования с ультраярким источником рентгеновского излучения, например лазер на свободных электронах, приводит к получению данных, содержащих значительно больше информации по сравнению с традиционными методами рассеяния.^[3]

FXS можно использовать для определения (больших) макромолекулярных структур,^[4] но также нашла применение при характеристике металлических наноструктур,^[5] магнитные домены^[6] и коллоиды.^[7]

Самая общая установка FXS - это ситуация, в которой делаются быстрые дифракционные снимки моделей, которые в течение длительного периода времени претерпевают полное трехмерное вращение. Особенно интересным подклассом FXS является двухмерный случай, когда образец можно рассматривать как двумерную систему с частицами, демонстрирующими случайное вращение в плоскости. В этом случае существует аналитическое решение относительно связи данных FXS со структурой.^[8] В отсутствие ограничений симметрии нет аналитического отношения данных к структуре для трехмерного случая, хотя различные итерационные процедуры были разработаны.

Обзор

Эксперимент FXS состоит из сбора большого количества рентгеновских снимков образцов в различной случайной конфигурации. Вычисляя угловые корреляции интенсивности для каждого изображения и усредняя их по всем снимкам, средняя двухточечная корреляционная функция может быть подвергнута конечное преобразование Лежандра, в результате чего получается набор так называемых B_л(д, д ') кривые, где л - порядок полиномов Лежандра, а q / q ' передача импульса или обратное разрешение данных.

Математический фон

Визуальное представление математических соотношений флуктуационного рассеяния рентгеновских лучей иллюстрирует связь между электронной плотностью, амплитудой рассеяния, дифрагированной интенсивностью и данными угловой корреляции. Изображение изменено с^[3]

Учитывая частицу с распределением плотности ${ displaystyle rho ( mathbf {r})}$, связанный с ним фактор трехмерной сложной структуры ${ Displaystyle А ( mathbf {q})}$ получается через преобразование Фурье

${ Displaystyle А ( mathbf {q}) = int _ {V} rho ( mathbf {r}) exp [я mathbf {qr}] d mathbf {r}}$

Функция интенсивности, соответствующая комплексному структурному фактору, равна

${ Displaystyle I ( mathbf {q}) = A ( mathbf {q}) A ( mathbf {q}) ^ {*}}$

куда ${ displaystyle ^ {*}}$ обозначает комплексное сопряжение. Выражая ${ Displaystyle I ( mathbf {q})}$ как сферические гармоники серии, получается

${ Displaystyle I ( mathbf {q}) = sum _ {l = 0} ^ { infty} sum _ {m = -l} ^ {l} I_ {lm} (q) Y_ {l} ^ {м} ( theta _ {q}, phi _ {q})}$

Корреляция средней угловой интенсивности, полученная из многих дифракционных изображений ${ displaystyle J_ {k} (q, phi _ {q})}$ затем

${ displaystyle C_ {2} (q, q ', Delta phi _ {q}) = { frac {1} {2 pi N}} sum _ {Nimages} int _ {0} ^ { 2 pi} J_ {k} (q, phi _ {q}) J_ {k} (q ', phi _ {q} + Delta phi _ {q}) d phi _ {q}}$

Можно показать, что

${ displaystyle C_ {2} (q, q ', Delta phi _ {q}) = sum _ {l} B_ {l} (q, q') P_ {l} ( cos ( theta _ {q}) cos ( theta _ {q '}) + sin ( theta _ {q}) sin ( theta _ {q'}) cos [ Delta phi _ {q}]) }$

куда

${ displaystyle theta _ {q} = arccos ({ frac {q lambda} {4 pi}})}$

с ${ displaystyle lambda}$ равна используемой длине волны рентгеновского излучения, и

${ displaystyle B_ {l} (q, q ') = sum _ {m = -l} ^ {l} I_ {lm} (q) I_ {lm} ^ {*} (q')}$

${ Displaystyle P_ {l} ( cdot)}$ это Legendre Polynome. Набор ${ Displaystyle B_ {l} (д, д ')}$ кривые могут быть получены с помощью конечного преобразования Лежандра из наблюдаемых автокорреляционных ${ Displaystyle C_ {2} (q, q ', Delta phi _ {q})}$ и, таким образом, напрямую связаны со структурой ${ displaystyle rho ( mathbf {r})}$ через приведенные выше выражения.

Дополнительные соотношения можно получить, получив автокорреляцию реального пространства ${ displaystyle gamma ( mathbf {r})}$ плотности:

${ Displaystyle гамма ( mathbf {r}) = int _ {V} rho (u) rho ( mathbf {r} - mathbf {u}) d mathbf {u}}$

Последующее расширение ${ displaystyle gamma ( mathbf {r})}$ в сферические гармоники ряд, приводит к коэффициентам радиального расширения, которые связаны с функцией интенсивности через Преобразование Ганкеля

${ displaystyle I_ {lm} (q) = int _ {0} ^ { infty} gamma _ {lm} (r) j_ {l} (qr) r ^ {2} dr}$

Краткий обзор этих отношений был опубликован в другом месте.^[1][3]

Основные отношения

Обобщенный закон Гинье, описывающий поведение данных с низким разрешением, может быть получен из приведенных выше выражений:

${ displaystyle log B_ {l} (q) -2l log q приблизительно log B_ {l} ^ {*} - { frac {2q ^ {2} R_ {l} ^ {2}} {2l +3}}}$

Ценности ${ displaystyle B_ {l} ^ {*}}$ и ${ displaystyle R_ {l}}$ могут быть получены с помощью анализа данных с низким разрешением методом наименьших квадратов.^[3]

Падение данных при более высоком разрешении регулируется законами Порода. Это можно показать^[3] что и здесь действуют законы Porod, полученные для данных SAXS / WAXS, что в конечном итоге приводит к:

${ displaystyle B_ {l} (q) propto q ^ {- 8}}$

для частиц с четко определенными границами раздела.

Определение структуры из данных FXS

В настоящее время существует три способа определения молекулярной структуры на основе соответствующих данных FXS.

Алгебраическая фазировка

Предполагая конкретную симметричную конфигурацию окончательной модели, отношения между коэффициентами расширения, описывающими картину рассеяния нижележащих частиц, можно использовать для определения дифракционной картины, согласующейся с данными корреляции измерений. Было показано, что такой подход применим для икосаэдра.^[9] и винтовые модели.^[10]

Обратный Монте-Карло

Представляя структуру, подлежащую определению, в виде набора независимых вокселей рассеяния, определение структуры из данных FXS преобразуется в глобальная оптимизация проблема и может быть решена с помощью моделирования отжига.^[3]

Многоуровневое итеративное фазирование

Многоуровневый итеративный алгоритм фазирования (M-TIP) преодолевает проблемы сходимости, связанные с обратной процедурой Монте-Карло, и устраняет необходимость использования или вывода определенных ограничений симметрии, необходимых для алгебраического метода. Алгоритм M-TIP использует нетривиальные проекции, которые изменяют набор факторов структуры испытания. ${ Displaystyle А ( mathbf {q})}$ такой, что соответствующий ${ Displaystyle B_ {l} (д, д ')}$ соответствуют наблюдаемым значениям. Изображение в реальном космосе ${ displaystyle rho ( mathbf {r})}$, как получено преобразованием Фурье ${ Displaystyle А ( mathbf {q})}$ впоследствии модифицируется для обеспечения симметрии, положительности и компактности. Процедура M-TIP может начинаться со случайной точки и имеет хорошие свойства сходимости.^[11]

Рекомендации