WikiDer > Фондовый центр грибковой генетики

Fungal Genetics Stock Center
Fgsclogo360.jpg

Основанная в 1960 году, Фондовый центр грибковой генетики это главный открытый репозиторий для генетически характеризует грибы. FGSC является членом Всемирная федерация культурных коллекций и является ведущей коллекцией в Сеть по координации исследований сети коллекций культур США .

Холдинги

FGSC распространяет штаммы Нейроспора и Аспергиллы, а также ограниченное количество Фузариум, Magnaporthe и многие штаммы текущих грибковых геном проекты.[1]

В 1980-х и 1990-х годах FGSC добавила молекулярные материалы, включая клонированный гены, клонирование векторов и библиотеки генов в коллекцию.

По мере того как было секвенировано больше грибковых геномов, FGSC пересмотрел определение генетической системы. Это побудило их расширить коллекцию дополнительными материалами, включая штаммы из геномных программ.[2] и коллекции мутантов для таких организмов, как Neurospora crassa, Aspergillus nidulans, Криптококк neoformans, и грибковые микроорганизмы албиканс.

Как генетический репозиторий, FGSC всегда стремился представить разнообразие доступных генетических материалов. С этой целью они содержат большое количество штаммов нескольких различных видов. В частности, штаммы из 76 различных разновидность представляющих 23 различных роды. Из них существует более десяти штаммов только для девятнадцати различных видов. Эти штаммы были депонированы 310 различными людьми, 64 из которых депонировали только один штамм. FGSC также содержит ряд штаммов, не включенных в регистрацию, включая коллекцию штаммов дикого типа Д-р Дэвид Перкинс а также Нейроспора штаммы ряда других исследователей, вышедших на пенсию. Они хранятся с пониманием того, что они будут хранить их, пока есть свободное место. Они не курируются и доступны как есть. Другие коллекции штаммов включают Allomyces (pdf), Aspergillus niger, Ustilago madis и Штаммы Neurospora из исторической коллекции лаборатории Татума

Распределение

В период с января 1998 года по декабрь 2018 года FGSC распространил более 630 000 культур, включая почти 5 000 индивидуальных мутантов и более 20 000 мутантов с делецией генов, расположенных в 96-луночном формате. С момента разработки FGSC база данных в 1987 г. FGSC разослал более 650 000 штаммов.

История

FGSC был основан в 1960 г. Дартмутский колледж с грантом из США Национальный фонд науки. Доктор Р. Барратт был первым директором FGSC. С тех пор FGSC трижды переезжал и размещался по адресу Государственный университет Гумбольдта, то Медицинский центр Канзасского университета то Университет Миссури - Канзас-Сити, а с 2014 г. - Университет штата Канзас [1]. В медицинском центре KU доктор Дж. Кинси был директором и работал над генетикой метаболизма аминокислот, а позже определил транспозон «Тад» в Neurospora crassa штамм из Adiopodoume, Кот-д'Ивуар.[3] В UMKC директором был доктор Майкл Пламанн, который работал над динамикой цитоскелета.[4] С 2014 года директором является доктор Джон Лесли с кафедры патологии растений Канзасского государственного университета.

С момента основания у FGSC было три куратора. Уильям (Билл) Огата был первым куратором, который работал до выхода на пенсию в 1981 году. Его сменил Крейг Уилсон в Гумбольдте. Г-н Уилсон переехал с коллекцией в Канзас-Сити, где в 1995 году куратором стал доктор Кевин МакКласки. С 1995 года запасы FGSC выросли с 8 000 штаммов до более чем 25 000 штаммов.[5] Аналогичным образом стали доступны руководства по передовой практике для коллекций культур, которые были интегрированы в практику FGSC.[6]

Поддерживать

В течение многих лет FGSC поддерживался Национальным научным фондом США в рамках программы сбора живых запасов.[7] Начиная с 2015 года, FGSC получает поддержку Колледж сельского хозяйства Канзасского государственного университета и по сборы оплачивается клиентами.

Дополнительные услуги

Одна из основных целей FGSC - провести исследования мицелиальных грибов (плесень) доступнее. С этой целью на веб-сайте FGSC размещены обширные протоколы.[8] за Нейроспора и Аспергиллы. Другие материалы и услуги доступны в индивидуальном порядке.

Исследование

Большая часть исследовательской деятельности FGSC направлена ​​на добавление ценности материалам коллекции. Конкретные проекты включали улучшение штаммов, идентификацию неизвестных маркеров и производство штаммов с множественной маркировкой. Недавняя работа включает характеристику иначе анонимных чувствительных к температуре мутаций у Neurospora и характеристику иначе анонимных классических мутантов в сотрудничестве с JGI Министерства энергетики США.

FGSC был частью программы Neurospora Functional Genomics.[9] и зарегистрировали более 13000 мутантов с делециями генов, вместе составляющих набор делеций всего генома в период с 2006 по 2014 год.

Рекомендации

  1. ^ Штаммы из различных программ секвенирования генома
  2. ^ «Интернет-каталог FGSC».
  3. ^ Выделение подвижного элемента от Neurospora crassa
  4. ^ Генетические взаимодействия между цитоплазматическим динеином, динактином и мутантами по ядерному распределению Neurospora crassa
  5. ^ Маккласки, Кевин (2011). «От генетики к геномике: коллекции грибов в Фондовом центре грибковой генетики». Микология: 1–8. Дои:10.1080/21501203.2011.584575.
  6. ^ Лучшие практики для хранилищ грибковой зародышевой плазмы и перспективы их внедрения
  7. ^ Коллекции живого инвентаря (LSC)
  8. ^ Страница методов Центра генетической генетики грибов
  9. ^ Функциональный анализ модельного нитчатого гриба

внешняя ссылка