WikiDer > GAMESS (США)

GAMESS (US)
ИГРЫ
Gamess small.png
Разработчики)Государственный университет Айовы Группа квантовой химии
изначальный выпуск1 октября 1977 г.; 43 года назад (1977-10-01)
Стабильный выпуск
20 апреля 2017 г. / 20 апреля 2017 г.; 3 года назад (2017-04-20)
Написано вFORTRAN 77, C
Операционная системаWindows; Unix, Unix-подобный: Linux, FreeBSD, Mac OS X
Доступно ванглийский
ТипВычислительная химия
ЛицензияПроприетарный бесплатное ПО
Интернет сайтwww.msg.chem.iastate.edu/ gamess

Общая система атомной и молекулярной электронной структуры (GAMESS (США)) компьютер программного обеспечения для вычислительная химия программа.[1][2][3][4][5] Первоначальный код был запущен 1 октября 1977 года как проект «Национальные ресурсы для вычислений в химии».[6] В 1981 году кодовая база разделилась на GAMESS (США) и GAMESS (Великобритания) варианты, которые сейчас существенно различаются. GAMESS (США) поддерживается членами Gordon Research Group в Государственный университет Айовы.[7] Исходный код GAMESS (США) доступен как исходный код бесплатное ПО, но не программное обеспечение с открытым исходным кодом, из-за лицензионных ограничений.

Способности

Краткое изложение некоторых базовых возможностей GAMESS (США)
C - обычное хранение интегралов
D - прямой атомная орбиталь (АО) интеграция
p - параллельное выполнение
F - Совместимость фрагментов MO
SCFTYP =RHFROHFУВЧGVBMCSCF
ЭнергияCDpFCDpFCDpFCDpCDpF
Аналитический градиентCDpFCDpFCDpFCDpCDpF
Числовой гессианCDpFCDpCDpCDpCDp
Аналитический гессенCDpFCDpFCDpFCDpДп
MP2 энергияCDpFCDpFCDpНетCDp
MP2 градиентCDpFДпCDpНетНет
CI энергияCDpFCDpНетCDpCDp
CI градиенткомпакт дискНетНетНетНет
CC энергияCDpFCDFНетНетНет
МНВ энергиякомпакт дисккомпакт дискНетНетНет
DFT энергияCDpFCDpCDpFНетНет
ДПФ градиентCDpFCDpCDpFНетНет
TD-DFT энергияCDpFНетCDpFНетНет
TDDFT градиентCDpFНетНетНетНет
MOPAC EnergyдадададаНет
MOPAC градиентдададаНетНет

GAMESS (США) может выполнять несколько общих вычислительная химия расчеты, в том числе Метод Хартри – Фока, теория функционала плотности (ДПФ), обобщенная валентная связь (GVB) и многоконфигурационное самосогласованное поле (MCSCF). Корреляционные поправки после этих расчетов SCF можно оценить следующим образом: конфигурационное взаимодействие (CI), второй порядок Теория возмущений Меллера – Плессе. (MP2) и связанный кластер (CC) теория. Эффект растворителя можно рассматривать с помощью квантовой механики и молекулярной механики с помощью дискретных эффективных потенциалов фрагментов или моделей континуума (таких как PCM). Можно вычислить релятивистские поправки, включая скалярные члены третьего порядка Дугласа-Кролла.

Пока программа напрямую не выполняет молекулярная механика, он может выполнять смешанные квантово-механические и молекулярно-механические расчеты через эффективные потенциалы фрагментов или через интерфейс с Тинкер код. В фрагмент молекулярной орбитали Метод может быть использован для обработки больших систем путем разделения их на фрагменты.

Он также может быть сопряжен с валентная связь Программы VB2000 и XMVB и Natural Bond Orbital (NBO) программа анализа населения.

Входные файлы используют схему на основе ключевых слов. Например, $ CONTRL SCFTYP = ROHF MAXIT = 30 $ END, который указывает, что часть кода SCF должна выполнять ограниченная открытая оболочка Хартри – Фока (ROHF) вычисление и завершение, если результат не сходится за 30 итераций. Вывод находится в текстовом файле на английском языке.[8]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ Янг, Дэвид С. (2001). «Приложение A. A.2.3 GAMESS». Вычислительная химия: практическое руководство по применению методов решения реальных проблем. Wiley-Interscience. п. 335. Дои:10.1002/0471220655. ISBN 978-0-471-33368-5.
  2. ^ Шмидт, Майкл В .; Болдридж, Ким К .; Боатц, Джерри А .; Элберт, Стивен Т .; Гордон, Марк С .; Дженсен, Ян Х .; Косеки, Сиро; Мацунага, Никита; Nguyen, Kiet A .; Су, Шуджун; Windus, Theresa L .; Дюпюи, Мишель; Монтгомери, Джон А. (1993). «Общая система электронного строения атомов и молекул». Журнал вычислительной химии. 14 (11): 1347–1363. Дои:10.1002 / jcc.540141112. Это одна из самых цитируемых статей по химии. В архиве 2011-11-04 на Wayback Machine
  3. ^ Гордон, Марк С .; Шмидт, Майкл В. (2005). «Успехи в теории электронной структуры: GAMESS десятилетие спустя» (PDF). In Dykstra, C.E .; Frenking, G .; Lim, K. S .; Scusaria, G.E. (ред.). Теория и приложения вычислительной химии, первые 40 лет. Амстердам: Эльзевир. С. 1167–1189. Дои:10.1016 / B978-044451719-7 / 50084-6. ISBN 978-0-444-51719-7.
  4. ^ Шмидт, Майкл В .; Болдридж, Ким К .; Боатц, Джерри А .; Дженсен, Ян Х .; Косеки, Сиро; Гордон, Марк С .; Nguyen, Kiet A .; Windus, Theresa L .; Эльберт, Стивен Т. (1990). "Общая система атомной и молекулярной электронной структуры (GAMESS)". Бюллетень QCPE. 10: 52–54. ISSN 0889-7514. OCLC 7963600.
  5. ^ По состоянию на декабрь 2014 года в коде GAMESS перечислены его участники как: Майкл В. Шмидт, Кимберли К. Болдридж, Джерри А. Ботц, Стивен Т. Элберт, Марк С. Гордон, Ян Х. Дженсен, Широ Косеки, Никита Мацунага, Кьет А. Нгуен, Шуджун Дж. Су, Тереза ​​Л. Виндус, Мишель Дюпюи, Джон А. Монтгомери, Ивана Адамович, Кристин Эйкенс, Юрий Алексеев, Пуджа Арора, Андрей Асадчев, Роб Белл, Прадипта Бандйопадхьяй, Джонатан Бенц, Бретт Боде, Курт Брорсен, Калеб Карлин, Галина Чабан, Вей Чен, Чхол Хо Чой, Пол Дэй, Альберт Дефуско, Нуван Десилва, Тим Дадли, Дмитрий Федоров, Грэм Флетчер, Марк Фрайтаг, Курт Глеземанн, Дэн Кемп, Грант Меррилл, Нориюки Минезава, Джонатан Маллин, Такеши Нагата, Шон Недд, Хизер Нецлофф, Босилька Нджегич, Райан Олсон,Майкл Пак, Спенсер Прюитт, Люк Роскоп, Джим Шумейкер, Людмила Слипченко, Тони Смит, Саром Сок, Джи Сон, Тэцуя Такецугу, Саймон Уэбб, Пэн Сюй, Сухенг Ю, Федерико Захариев, Джо Иваник, Аарберг Уэст, Лаймутис Кимаус Ритауэтик, Хирао, Такахито Накадзима, Такао Цунеда, Мунеаки Камия, Сусуму Янагисава, Киёси Яги, Махито Чиба, Сейкен Токура, Наоаки Каваками, Фрэнк Дженсен, Висвалдас Кайрис, Хуэй Ли, Уолт Стивенси, Давид Джакнэпо, Бенедетс, Генри Гармер Пракашан Корамбат, Тоби Зенг, Мариуш Клобуковски, Марк Спакман, Хироаки Умеда, Казуо Китаура, Кароль Ковальски, Марта Влох, Джеффри Гур, Джесси Лутц, Вей Ли, Петр Пьекух, Моника Мусиаль, Станислав Кухарски, Оливье Кине, Бенуа Шампань, Бернар Киртман, Казуя Ишимура, Мичио Катуда, Сигеру Нагасе, Анна Помогаева, Дэн Чипман, Харуюки Накано, Фен Лонг Гу, Яцек Корчовец, Марцин Маковтошиц, Марчин Маковтошо Эйсаку Миёси, Цветелин Иорданов, Чет Свалина, Джонатан Скоун, Шэрон Хаммес-Шиффер, Масато Кобаяши, Томоко Акама, Цугуки Тома, Такеши Йошикавам Ясухиро Икабата, Хироми Накаи, Шухгеуа Ли, Пейфенгэн Ли, Роберто Певерати, Ким Болдридж, Мария Бариш, Каспер Штайнманн, Хироя Наката, Йошио Нисимото, Стефан Ирле.
  6. ^ Gordon Research Group. «Руководство GAMESS (Введение)» (PDF).
  7. ^ "Gordon Group / Домашняя страница GAMESS". www.msg.chem.iastate.edu.
  8. ^ Gordon Research Group. "Руководство по GAMESS (ввод)" (PDF).

внешние ссылки