WikiDer > База данных генома человека GDB

GDB Human Genome Database
База данных генома человека GDB
Содержание
Типы данных
захвачен		Данные генетического картирования
ОрганизмыHomo sapiens
Контакт
Исследовательский центр
Основное цитированиеPMID 2041809
Дата выхода1989

В База данных генома человека GDB была собрана коллекцию человеческих геномный данные. Это была ключевая база данных в Проект "Геном человека"[1][2] Находился на вооружении с 1989 по 2008 год.

История

В 1989 г. Медицинский институт Говарда Хьюза предоставили финансирование для создания центрального хранилища человеческих генетическое картирование данные. В конечном итоге этот проект привел к созданию GDB базы данных генома человека в сентябре 1990 года.[3][4] Для обеспечения высокого уровня качества записи в GDB подвергались процессу курирования специалистами по генетике человека, включая Комитет по номенклатуре генов HUGO.[5]

Основанная под руководством Питера Пирсона и Дика Люсьера,[6] GDB получил финансовую поддержку от Министерство энергетики США и Национальные институты здоровья.[3] Расположен в Школа медицины Университета Джона Хопкинса, GDB стал источником высококачественных картографических данных, которые были доступны как в Интернете, так и в многочисленных печатных публикациях.[нужна цитата] Проект получил международную поддержку со стороны ЕС, Японии и других стран.

В свое время у GDB было несколько директоров. Питер Пирсон, Дэвид Т. Кингсбери, Стэнтли Летовски, Питер Ли и А. Джейми Кутиккья.[нужна цитата]

В 1998 году смена фокуса в проекте генома человека перенаправила средства Министерства энергетики США, которые ранее были доступны для GDB.[7] Однако в том же году А. Джейми Кутиккья получил финансирование из канадских государственных и частных источников для продолжения деятельности GDB. Хотя обработка данных продолжалась в Johns Hopkins, центральные операции GDB были перенесены в Больницу для больных детей (HSC) в Торонто, Онтарио, Канада.[8] В ноябре 2001 года HSC уволил Кутиккию из-за спора по поводу доменного имени веб-сайта GDB.[7]

В 2003 г. RTI International стал новым хостом для GDB, где он продолжал поддерживаться как общедоступный ресурс;[9] GDB был закрыт в 2008 году после того, как контроль над проектом вернулся к Джонсу Хопкинсу.[10]

Рекомендации

  1. ^ "Новости генома человека, сентябрь-декабрь 1995: 7 (3-4): 15". web.ornl.gov.
  2. ^ Guyer, M. S .; Коллинз, Ф. С. (21 ноября 1995 г.). «Как продвигается проект« Геном человека »и что мы узнали на данный момент?». Труды Национальной академии наук. 92 (24): 10841–10848. Дои:10.1073 / пнас.92.24.10841.
  3. ^ а б Кутиккья, А. Джейми; Fasman, Kenneth H .; Кингсбери, Дэвид Т .; Роббинс, Роберт Дж .; Пирсон, Питер Л. (1993). "База данных генома человека GDB TM за 1993 г.". Исследования нуклеиновых кислот. 21 (13): 3003–3006. Дои:10.1093 / nar / 21.13.3003. ЧВК 309725.
  4. ^ Кутиккья, А.Дж. (27 декабря 1999 г.). «Будущее видение базы данных генома человека GDB». Человеческая мутация. 15 (1): 62–67. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (200001) 15: 1 <62 :: AID-HUMU13> 3.0.CO; 2-R. PMID 10612824.
  5. ^ Летовский, С. (1 января 1998 г.). "GDB: База данных генома человека". Исследования нуклеиновых кислот. 26 (1): 94–99. Дои:10.1093 / nar / 26.1.94.
  6. ^ Пирсон, П. (25 апреля 1991 г.). «База данных генома (GDB) - репозиторий картирования генов человека». Исследования нуклеиновых кислот. 19 (доп.): 2237–2239. Дои:10.1093 / nar / 19.suppl.2237. ЧВК 331357.
  7. ^ а б Бонетта, Лаура (ноябрь 2001 г.). "Увольнения оставляют базу данных генов разваливающейся". Природа. 414 (6862): 384–384. Дои:10.1038/35106703.
  8. ^ "Новости генома человека, том 10, № 1-2, февраль 1999 г.". web.ornl.gov. Получено 3 сентября 2020.
  9. ^ Зеевальд, А. (2004). «Рейтинг BioMinT: исследование производительности, локальный поиск и распознавание омонимии». Материалы симпозиума по изучению знаний в области информатики наук о жизни (KELSI 2004).
  10. ^ Гальперин, М.Ю .; Кокрейн, Г. Р. (1 января 2009 г.). «Ежегодный выпуск базы данных по исследованию нуклеиновых кислот и онлайн-сборник базы данных NAR по молекулярной биологии в 2009 году». Исследования нуклеиновых кислот. 37 (База данных): D1 – D4. Дои:10.1093 / nar / gkn942.

внешняя ссылка