WikiDer > Геномная организация - Википедия

Genomic organization - Wikipedia
Размеры генома и соответствующий состав шести основных модельных организмов в виде круговых диаграмм. Увеличение геном размер коррелирует с обширным расширением некодирующих (т.е. интронных, межгенных и чередующихся повторяющихся последовательностей) и повторения ДНК (например, спутник, ЛИНИИ, короткий вкрапленный ядерный элемент (SINE), ДНК (Последовательность Alu), красным цветом) последовательности в более сложных многоклеточных организмах. Это расширение сопровождается увеличением количества эпигенетический механизмы (особенно репрессивные), регулирующие геном. Расширение генома также коррелирует с увеличением размера и сложности единиц транскрипции, за исключением растений. P = Промоутер Элемент ДНК.

В наследственный материал т.е. ДНК (дезоксирибонуклеиновая кислота) организма состоит из последовательности четырех нуклеотиды в определенном шаблоне, который кодирует информацию в зависимости от их порядка. Под геномной организацией понимается линейный порядок элементов ДНК и их разделение на хромосомы. «Организация генома» может также относиться к 3D структура хромосом и расположение последовательностей ДНК в ядре.

Описание

Организмы имеют множество способов, которыми их соответствующие геномы организованы. Сравнение геномной организации шести основных модельных организмов показывает увеличение размеров с увеличением сложность организма. Существует более чем 300-кратная разница между размерами генома дрожжи и млекопитающие, но лишь небольшое увеличение в 4–5 раз общего ген номер (см. рисунок справа). Однако соотношение кодирующих, некодирующих и повторяющихся последовательностей указывает на сложность генома: в основном "открытые" геномы одноклеточный грибы иметь относительно мало некодирования ДНК по сравнению с очень гетерохроматический геномы многоклеточный организмы.[нужна цитата]

В частности, у млекопитающих накоплено значительное количество повторяющихся элементов и некодирующих областей, на которые приходится большая часть их последовательностей ДНК (52% некодирующих и 44% повторяющаяся ДНК).[1][2] Таким образом, только 1,2% генома млекопитающих кодирует белок функция. Такое массовое распространение повторяющихся и некодирующих последовательностей в многоклеточных организмах, скорее всего, связано с включением инвазивных элементов, таких как ДНК. транспозоны, ретротранспозоны, и другие повторяющиеся элементы.[3] Расширение повторяющихся элементов (таких как Последовательности Alu) даже проник в транскрипционный единиц генома млекопитающих. Это приводит к единицам транскрипции, которые часто намного больше (30–200 т.п.н.), обычно содержат несколько промоторов и повторы ДНК в нетранслируемых интроны.[нужна цитата]

Обширное расширение генома за счет некодирующей и повторяющейся ДНК в высших эукариоты подразумевает более обширный эпигенетический механизмы глушителя. Считается, что исследования геномной организации - это будущее геномной лекарство, что даст возможность персонализированного прогнозы в клиниках.[4]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Вентер Дж. И др., The Sequence of the Human Genome Science (2001) 291. pp1304-51
  2. ^ Р. А. Харрис и др., Специфические для человека изменения структуры генома, обнаруженные наукой о геномной триангуляции (2007), 316.5822, стр. 235-7
  3. ^ Хейг Х. Казазян младший. Мобильные элементы: движущие силы науки об эволюции генома, март 2004 г .; 303: 1626-32
  4. ^ Вест М. и др., Освоение сложности геномных данных для персонализированной медицины Genome Res. (2006) 16: 559-66