WikiDer > GlmY РНК

GlmY RNA
Glm Y РНК активатор мРНК glmS
RF00128.jpg
Идентификаторы
СимволGlmY_tke1
Альт. Символыtke1
РфамRF00128
Прочие данные
РНК типГен; мРНК
Домен (ы)Бактерии
ТАКТАК: 0000655
PDB структурыPDBe

В GlmY РНК (формально известный как tke1) семейство состоит из ряда бактериальных РНК гены длиной около 167 оснований. Ген GlmY РНК присутствует в кишечная палочка, Шигелла флекснери, Yersinia pestis и Сальмонелла видов, где он встречается между yfhK и изнаночная гены. Первоначально это было предсказано в биоинформатический экран для романа нкРНК в Кишечная палочка.[1]

Было показано, что мРНК GlmY активирует синтез GlmS.[2] Это достигается путем влияния на действие другой мРНК, называемой ГлмЗ иерархически.[3][4][5] GlmY действует как антиадаптер, он связывается с RapZ (адаптерным белком РНКазы для мРНК GlmZ), это связывание предотвращает связывание RapZ с GlmZ и его нацеливание на расщепление посредством РНКаза Э.[6]

Дальнейшие исследования показали, что мутанты GlmY чувствительны к клеточная оболочка стресс.[7]

Рекомендации

  1. ^ Ривас, Э; Klein RJ; Jones TA; Эдди SR (2001). «Вычислительная идентификация некодирующих РНК в E. coli с помощью сравнительной геномики». Curr Biol. 11 (17): 1369–1373. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00401-8. PMID 11553332.
  2. ^ Урбан Дж. Х., Папенфорт К., Томсен Дж., Шмитц Р. А., Фогель Дж. (2007). «Консервативная малая РНК способствует неравномерной экспрессии мРНК оперона glmUS для активации синтеза GlmS». Дж Мол Биол. 373 (3): 521–528. Дои:10.1016 / j.jmb.2007.07.035. PMID 17854828.
  3. ^ Райхенбах Б., Маес А., Каламорц Ф., Хайнсдорф Э., Гёрке Б. (2008). «Малая РНК GlmY действует выше мРНК GlmZ в активации экспрессии glmS и регулируется полиаденилированием в Escherichia coli». Нуклеиновые кислоты Res. 36 (8): 2570–2580. Дои:10.1093 / nar / gkn091. ЧВК 2377431. PMID 18334534.
  4. ^ Городской JH, Vogel J (2008). «Две, казалось бы, гомологичные некодирующие РНК действуют иерархически, активируя трансляцию мРНК glmS». PLoS Biol. 6 (3): e64. Дои:10.1371 / journal.pbio.0060064. ЧВК 2267818. PMID 18351803.
  5. ^ Гёрке Б, Фогель Дж (2008). «Контроль некодирующей РНК образования и разрушения сахаров». Genes Dev. 22 (21): 2914–2925. Дои:10.1101 / gad.1717808. PMID 18981470.
  6. ^ Göpel, Y; Папенфорт, К; Райхенбах, B; Vogel, J; Görke, B (1 марта 2013 г.). «Направленный распад регуляторной малой РНК адаптерным белком для РНКазы Е и противодействие анти-адаптерной РНК». Гены и развитие. 27 (5): 552–564. Дои:10.1101 / гад.210112.112. ЧВК 3605468. PMID 23475961.
  7. ^ Хоббс EC, Астарита JL, Сторц G (2010). «Малые РНК и малые белки, участвующие в устойчивости к стрессу клеточной оболочки и кислотному шоку у Escherichia coli: анализ коллекции мутантов со штрих-кодом». J Бактериол. 192 (1): 59–67. Дои:10.1128 / JB.00873-09. ЧВК 2798238. PMID 19734312.

внешняя ссылка