WikiDer > HIF3A

HIF3A
HIF3A
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыHIF3A, HIF-3A, IPAS, MOP7, PASD7, bHLHe17, HIF3-alpha-1, субъединица альфа фактора 3, индуцируемого гипоксией, субъединица фактора 3, индуцируемого гипоксией
Внешние идентификаторыOMIM: 609976 MGI: 1859778 ГомолоГен: 9646 Генные карты: HIF3A
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение HIF3A
Геномное расположение HIF3A
Группа19q13.32Начинать46,297,046 бп[1]
Конец46,343,433 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE HIF3A 222123 s в формате fs.png

PBB GE HIF3A 219319 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_022462
NM_152794
NM_152795
NM_152796

NM_001162950
NM_016868

RefSeq (белок)

NP_071907
NP_690007
NP_690008
NP_690009

NP_001156422
NP_058564

Расположение (UCSC)Chr 19: 46,3 - 46,34 МбChr 7: 17.03 - 17,06 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор, индуцируемый гипоксией 3 альфа это белок что у людей кодируется HIF3A ген.[5][6][7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой альфа-3-субъединицу одной из нескольких альфа / бета-субъединиц. гетеродимерный факторы транскрипции которые регулируют многие адаптивные реакции на низкое давление кислорода (гипоксия). В субъединице альфа-3 отсутствует домен трансактивации, обнаруживаемый в факторах, содержащих субъединицы альфа-1 или альфа-2. Считается, что факторы, содержащие субъединицу альфа-3, являются негативными регуляторами экспрессии генов, индуцируемых гипоксией. Для этого гена были обнаружены по крайней мере три варианта транскрипта, кодирующие три разные изоформы.[7]

У крыс он играет отрицательную роль в адаптации к гипоксии, поскольку подавление экспрессии HIF-3α приводит к увеличению физической выносливости.[8]

Клиническое значение

Метилирование ДНК в интроны HIF3A связан с ИМТ ожирение.[9]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000124440 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004328 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Хара С., Хамада Дж., Кобаяши К., Кондо Й., Имура Н. (сентябрь 2001 г.). «Экспрессия и характеристика фактора, индуцируемого гипоксией (HIF) -3альфа в почках человека: подавление HIF-опосредованной экспрессии гена с помощью HIF-3альфа». Biochem Biophys Res Commun. 287 (4): 808–13. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5659. PMID 11573933.
  6. ^ Макино Ю., Цао Р., Свенссон К., Бертилссон Г., Асман М., Танака Х, Цао И., Беркенстам А., Поллингер Л. (декабрь 2001 г.). «Белок ингибирующего домена PAS является негативным регулятором экспрессии генов, индуцируемых гипоксией». Природа. 414 (6863): 550–4. Bibcode:2001Натура.414..550М. Дои:10.1038/35107085. PMID 11734856. S2CID 4389117.
  7. ^ а б «Ген Entrez: фактор 3, индуцируемый гипоксией HIF3A, альфа-субъединица».
  8. ^ Древицкая Т., Гавенаускас Б., Дроздовская С., Носар В., Досенко В., Маньковская И. (2012). «Изменения экспрессии мРНК HIF-3α в различных тканях и их роль в адаптации к перемежающейся гипоксии и физическим нагрузкам». Патофизиология. 19 (3): 205–14. Дои:10.1016 / j.pathophys.2012.06.002. PMID 22884965.
  9. ^ Dick KJ, Nelson CP, Tsaprouni L, Sandling JK, Aïssi D, Wahl S, Meduri E, Morange PE, Gagnon F, Grallert H, Waldenberger M, Peters A, Erdmann J, Hengstenberg C, Cambien F, Goodall AH, Ouwehand WH , Шункерт Х., Томпсон Дж. Р., Спектор Т. Д., Гигер С., Трегуэ Д. А., Делукас П., Самани Нью-Джерси (2014). «Метилирование ДНК и индекс массы тела: полногеномный анализ». Ланцет. 383 (9933): 1990–1998. Дои:10.1016 / S0140-6736 (13) 62674-4. PMID 24630777. S2CID 18026508.

дальнейшее чтение