WikiDer > HLA-A31

HLA-A31
HLA-A31
(MHC Класс I, А антиген клеточной поверхности)
Иллюстрация HLA-A.png
HLA-A31
О
Протеинтрансмембранный рецептор/лиганд
Структураαβ гетеродимер
ПодразделенияHLA-A*3101, β2-микроглобулин
Старые именаA19
Подтипы
Подтип
аллель
Доступные конструкции
A31*3101
{{{cNick2}}}* 31 {{{cAllele2}}}
{{{cNick3}}}* 31 {{{cAllele3}}}
{{{cNick4}}}* 31 {{{cAllele4}}}
Редкие аллели
Подтип
аллель
Доступные конструкции
A31.2*3102
{{{rnick2}}}* 31 {{{rallele2}}}
{{{rnick3}}}* 31 {{{rallele3}}}
Ссылка на все аллели на IMGT / HLA база данных в EBI

HLA-A31 (A31) - это человеческий лейкоцитарный антиген серотип в HLA-A группа серотипа. Серотип определяется по распознаванию антителом α31 подмножество α-цепей HLA-A. Для A31 альфа-цепь "A" кодируется HLA-A*31 аллельная группа и β-цепь кодируются B2M локус.[1] В настоящее время в этой группе преобладает A * 3101. A31 и A*31 практически синонимичны по значению. A31 - это расщепленный антиген из широкий антиген серотип A19. A31 - сестринский серотип A29A30A32A33, иA74.

A31 чаще встречается в Южной и Центральной Америке.

Серотип

Распознавание A31 некоторых продуктов гена HLA A * 31[2]
А * 31A31А19А30Образец
аллель%%%размер (N)
*310190133517
*31021000011


Существует значительная ложная реакция A30 с A * 3101, в противном случае серологическая идентификация хороша.

Распределение

HLA A * 3101 частоты
Изучение населенияFreq.
 (в %)[3]
США Нью-Мексико Canoncito…26.8
Аргентина Чиригуанос26.4
Аргентина Сальта Вичис23.7
Индия Тамил Наду Надар18.9
Мексика Мичоакан Тараско18.4
Бразилия Терена18.3
США Южная Дакота Лакота С…18.1
Мексика Сонора Сери15.2
Япония Хиого14.1
Колумбия Местисы13.3
Индия Андхра-Прадеш Голл…13.1
Мексика Teenek Huasteca Re…12.1
Япония Айну Хоккайдо12.0
Гватемала Майя10.9
Бразилия Parana Oriental10.6
Мексика штат Чиуауа Та…10.2
Перу Ламас Сити Лама10.2
Россия Тува (2)9.8
Китай тибетский9.2
Саудовская Аравия Гурайат и…8.7
Индия Керала Хинду Ежава8.3
Мексика Гвадалахара Местис…8.3
Япония Окинава Рюкюань8.1
США Уроженец Северной Америки…7.8
Япония Айти7.6
США Аризона Пима7.6
Монголия Бурят7.5
Китай Северная Хань7.1
Япония Центральная7.1
Монголия Халха7.0
Южная Африка Натал Тамил7.0
Мексика Zaptotec Oaxaca6.7
Монголия Хотон Тариалан6.5
Индия Хандеш Павра6.0
Монголия Оолд5.8
Саудовская Аравия5.7
Китай Внутренняя Монголия5.4
Южная Корея5.4
Папуа-Новая Гвинея Маданг5.1
Финляндия5.0
Чувашский4.9
США испаноязычный4.9
Юго-Восток Франции4.7
Сахалин Остров Нивхи4.7
Пакистанский синдхи4.4
Бельгия4.2
Пакистанские калаши4.2
Южная Португалия4.1
Бразилия4.0
Индия Джалпайгури Тото3.8
Испания Северный Кабуэрниго3.8
Швеция округ Упсала3.8
Китай Пекин3.7
Немецкий Эссен3.6
Шри-Ланка Коломбо Сингале…3.5
Замбия Лусака3.5
Испания Каталония Жирона3.4
Швеция Стокгольм3.4
Алжир13.0
Хорватия3.0
Индия Нью-Дели3.0
Папуа-Новая Гвинея Каримуи…3.0
Испания Баскский Гипускоа Pro…3.0
Суданский3.0
Уэльс3.0
Англия Шеффилд2.8
Китай Южный Хан2.8
Чехия2.8
Таиланд2.8
США Сан-Антонио Кавказский…2.7
Италия Бергамо2.7
Бразилия Белу-Оризонти2.6
Ирландия Северная2.6
Англия Ливерпуль2.6
Китай Юньнань Ну2.5
Италия2.5
Оман2.5
Шотландия Оркнейские острова2.5
Уганда Кампала2.5
Англия Ньюкасл2.4
Мексика Местис2.4
Новая Каледония2.4
румынский2.3
Иран Белудж2.2
Южная Ирландия2.2
Марокко «Берберский» Надор Ме…2.1
Сербия2.1
Буркина-Фасо Фулани2.0
Грузия Сванети Сваны1.9
Россия Северо-Запад1.8
Болгария1.8
Грузия Тибилиси Курды1.7
Иордания Амман1.7
Греция Северная1.6
Тунис1.5
Тайланд Северо-Восток1.4
Испания Basque Arratia Vall…1.3
Афроамериканцы США1.3
Израиль Газа палестинцы1.2
Частоты аллелей представлены, только

Гаплотипы

Частоты гаплотипа HLA A31
частота
исх.численность населения(%)
A31-B35
(A * 310102: Cw * 0401: B * 3501)
Лакота Сиу (США)4.1
Индиг-американец (США)3.7
Метисы (Гуад. Мексика)1.5[4]
тибетский1.1
Евреи (Англия)1.3
тибетский1.1
Итальянский0.6
Японский0.5
Французский0.5
Чоушань (Китай)0.4
Немецкий0.3
A31-B39
(A * 310102: Cw * 0701: B * 3901)
Mixtec (Оакс. Мексика)10.0
Лакота Сиу (США)1.6
Японский0.3
Немецкий0.1
A31-B48
(A * 310102: B * 4801)
Орочон (Россия)6.0
Майя (Гватемала)3.5
Бурят3.4
Японский0.3
A31-B51
(A * 310102: B * 5101)
Айну (Хоккайдо, Япония)8.9
Индиг. Бразилия5.8
Орочон (Россия)5.3
Индиг-американец (США)4.3
тибетский3.3
Внутренний монгольский3.0
Японский3.0
португальский1.6
Корейский1.2
Итальянский0.9
Французский0.5
Немецкий0.3
Чоушань (Китай)0.2
(A * 310102: B * 5102)
Тараумура (Мексика)5.7
вьетнамский1.0
A31-B60
(A * 310102: Cw * 0304: B * 4001)
Лусака (Замбия)2.3
Якуты (Россия)2.0
Ирландский0.7
Чоушань (Китай)0.7
Япония0.6
нидерландский язык0.6
Немецкий0.4
A31-B62
(A * 310102: B * 1501)
Нивхи (Сакалин, Россия)12.5
Якут (Россия)5.5
Индиг. Бразилия4.1
Маньчжурский1.1
Япония0.4
Немецкий0.2
Чоушань (Китай)0.2

Исследование гаплотипов A31 обнаруживает возможную связь между северной Евразией в доисторический период. Частоты более «сказочных» гаплотипов (A31-B60, B61 и B62) падают с северо-востока на юго-запад Европы. Другие гаплотипы, по-видимому, распространились с Ближнего Востока (A31-B51 и A31-B35).

Рекомендации

  1. ^ Арсе-Гомес Б., Джонс Э.А., Барнстейбл С.Дж., Соломон Э., Бодмер В.Ф. (февраль 1978 г.). «Генетический контроль антигенов HLA-A и B в гибридах соматических клеток: потребность в бета2-микроглобулине». Тканевые антигены. 11 (2): 96–112. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1978.tb01233.x. PMID 77067.
  2. ^ Аллельная форма запроса IMGT / HLA - Европейский институт биоинформатики
  3. ^ Миддлтон, Д .; Menchaca, L .; Rood, H .; Комеровский, Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net». Тканевые антигены. 61 (5): 403–407. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID 12753660.
  4. ^ В * 3512