WikiDer > HLA-A31
HLA-A31 | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
(MHC Класс I, А антиген клеточной поверхности) | ||||||||||||||||
HLA-A31 | ||||||||||||||||
О | ||||||||||||||||
Протеин | трансмембранный рецептор/лиганд | |||||||||||||||
Структура | αβ гетеродимер | |||||||||||||||
Подразделения | HLA-A*3101, β2-микроглобулин | |||||||||||||||
Старые имена | A19 | |||||||||||||||
Подтипы | ||||||||||||||||
| ||||||||||||||||
Редкие аллели | ||||||||||||||||
| ||||||||||||||||
Ссылка на все аллели на IMGT / HLA база данных в EBI |
HLA-A31 (A31) - это человеческий лейкоцитарный антиген серотип в HLA-A группа серотипа. Серотип определяется по распознаванию антителом α31 подмножество α-цепей HLA-A. Для A31 альфа-цепь "A" кодируется HLA-A*31 аллельная группа и β-цепь кодируются B2M локус.[1] В настоящее время в этой группе преобладает A * 3101. A31 и A*31 практически синонимичны по значению. A31 - это расщепленный антиген из широкий антиген серотип A19. A31 - сестринский серотип A29, A30, A32, A33, иA74.
A31 чаще встречается в Южной и Центральной Америке.
Серотип
А * 31 | A31 | А19 | А30 | Образец |
аллель | % | % | % | размер (N) |
*3101 | 90 | 1 | 3 | 3517 |
*3102 | 100 | 0 | 0 | 11 |
Существует значительная ложная реакция A30 с A * 3101, в противном случае серологическая идентификация хороша.
Распределение
Изучение населения | Freq. (в %)[3] |
---|---|
США Нью-Мексико Canoncito… | 26.8 |
Аргентина Чиригуанос | 26.4 |
Аргентина Сальта Вичис | 23.7 |
Индия Тамил Наду Надар | 18.9 |
Мексика Мичоакан Тараско | 18.4 |
Бразилия Терена | 18.3 |
США Южная Дакота Лакота С… | 18.1 |
Мексика Сонора Сери | 15.2 |
Япония Хиого | 14.1 |
Колумбия Местисы | 13.3 |
Индия Андхра-Прадеш Голл… | 13.1 |
Мексика Teenek Huasteca Re… | 12.1 |
Япония Айну Хоккайдо | 12.0 |
Гватемала Майя | 10.9 |
Бразилия Parana Oriental | 10.6 |
Мексика штат Чиуауа Та… | 10.2 |
Перу Ламас Сити Лама | 10.2 |
Россия Тува (2) | 9.8 |
Китай тибетский | 9.2 |
Саудовская Аравия Гурайат и… | 8.7 |
Индия Керала Хинду Ежава | 8.3 |
Мексика Гвадалахара Местис… | 8.3 |
Япония Окинава Рюкюань | 8.1 |
США Уроженец Северной Америки… | 7.8 |
Япония Айти | 7.6 |
США Аризона Пима | 7.6 |
Монголия Бурят | 7.5 |
Китай Северная Хань | 7.1 |
Япония Центральная | 7.1 |
Монголия Халха | 7.0 |
Южная Африка Натал Тамил | 7.0 |
Мексика Zaptotec Oaxaca | 6.7 |
Монголия Хотон Тариалан | 6.5 |
Индия Хандеш Павра | 6.0 |
Монголия Оолд | 5.8 |
Саудовская Аравия | 5.7 |
Китай Внутренняя Монголия | 5.4 |
Южная Корея | 5.4 |
Папуа-Новая Гвинея Маданг | 5.1 |
Финляндия | 5.0 |
Чувашский | 4.9 |
США испаноязычный | 4.9 |
Юго-Восток Франции | 4.7 |
Сахалин Остров Нивхи | 4.7 |
Пакистанский синдхи | 4.4 |
Бельгия | 4.2 |
Пакистанские калаши | 4.2 |
Южная Португалия | 4.1 |
Бразилия | 4.0 |
Индия Джалпайгури Тото | 3.8 |
Испания Северный Кабуэрниго | 3.8 |
Швеция округ Упсала | 3.8 |
Китай Пекин | 3.7 |
Немецкий Эссен | 3.6 |
Шри-Ланка Коломбо Сингале… | 3.5 |
Замбия Лусака | 3.5 |
Испания Каталония Жирона | 3.4 |
Швеция Стокгольм | 3.4 |
Алжир1 | 3.0 |
Хорватия | 3.0 |
Индия Нью-Дели | 3.0 |
Папуа-Новая Гвинея Каримуи… | 3.0 |
Испания Баскский Гипускоа Pro… | 3.0 |
Суданский | 3.0 |
Уэльс | 3.0 |
Англия Шеффилд | 2.8 |
Китай Южный Хан | 2.8 |
Чехия | 2.8 |
Таиланд | 2.8 |
США Сан-Антонио Кавказский… | 2.7 |
Италия Бергамо | 2.7 |
Бразилия Белу-Оризонти | 2.6 |
Ирландия Северная | 2.6 |
Англия Ливерпуль | 2.6 |
Китай Юньнань Ну | 2.5 |
Италия | 2.5 |
Оман | 2.5 |
Шотландия Оркнейские острова | 2.5 |
Уганда Кампала | 2.5 |
Англия Ньюкасл | 2.4 |
Мексика Местис | 2.4 |
Новая Каледония | 2.4 |
румынский | 2.3 |
Иран Белудж | 2.2 |
Южная Ирландия | 2.2 |
Марокко «Берберский» Надор Ме… | 2.1 |
Сербия | 2.1 |
Буркина-Фасо Фулани | 2.0 |
Грузия Сванети Сваны | 1.9 |
Россия Северо-Запад | 1.8 |
Болгария | 1.8 |
Грузия Тибилиси Курды | 1.7 |
Иордания Амман | 1.7 |
Греция Северная | 1.6 |
Тунис | 1.5 |
Тайланд Северо-Восток | 1.4 |
Испания Basque Arratia Vall… | 1.3 |
Афроамериканцы США | 1.3 |
Израиль Газа палестинцы | 1.2 |
Частоты аллелей представлены, только |
Гаплотипы
частота | ||
исх. | численность населения | (%) |
A31-B35 (A * 310102: Cw * 0401: B * 3501) | ||
Лакота Сиу (США) | 4.1 | |
Индиг-американец (США) | 3.7 | |
Метисы (Гуад. Мексика) | 1.5[4] | |
тибетский | 1.1 | |
Евреи (Англия) | 1.3 | |
тибетский | 1.1 | |
Итальянский | 0.6 | |
Японский | 0.5 | |
Французский | 0.5 | |
Чоушань (Китай) | 0.4 | |
Немецкий | 0.3 | |
A31-B39 (A * 310102: Cw * 0701: B * 3901) | ||
Mixtec (Оакс. Мексика) | 10.0 | |
Лакота Сиу (США) | 1.6 | |
Японский | 0.3 | |
Немецкий | 0.1 | |
A31-B48 (A * 310102: B * 4801) | ||
Орочон (Россия) | 6.0 | |
Майя (Гватемала) | 3.5 | |
Бурят | 3.4 | |
Японский | 0.3 | |
A31-B51 (A * 310102: B * 5101) | ||
Айну (Хоккайдо, Япония) | 8.9 | |
Индиг. Бразилия | 5.8 | |
Орочон (Россия) | 5.3 | |
Индиг-американец (США) | 4.3 | |
тибетский | 3.3 | |
Внутренний монгольский | 3.0 | |
Японский | 3.0 | |
португальский | 1.6 | |
Корейский | 1.2 | |
Итальянский | 0.9 | |
Французский | 0.5 | |
Немецкий | 0.3 | |
Чоушань (Китай) | 0.2 | |
(A * 310102: B * 5102) | ||
Тараумура (Мексика) | 5.7 | |
вьетнамский | 1.0 | |
A31-B60 (A * 310102: Cw * 0304: B * 4001) | ||
Лусака (Замбия) | 2.3 | |
Якуты (Россия) | 2.0 | |
Ирландский | 0.7 | |
Чоушань (Китай) | 0.7 | |
Япония | 0.6 | |
нидерландский язык | 0.6 | |
Немецкий | 0.4 | |
A31-B62 (A * 310102: B * 1501) | ||
Нивхи (Сакалин, Россия) | 12.5 | |
Якут (Россия) | 5.5 | |
Индиг. Бразилия | 4.1 | |
Маньчжурский | 1.1 | |
Япония | 0.4 | |
Немецкий | 0.2 | |
Чоушань (Китай) | 0.2 |
Исследование гаплотипов A31 обнаруживает возможную связь между северной Евразией в доисторический период. Частоты более «сказочных» гаплотипов (A31-B60, B61 и B62) падают с северо-востока на юго-запад Европы. Другие гаплотипы, по-видимому, распространились с Ближнего Востока (A31-B51 и A31-B35).
Рекомендации
- ^ Арсе-Гомес Б., Джонс Э.А., Барнстейбл С.Дж., Соломон Э., Бодмер В.Ф. (февраль 1978 г.). «Генетический контроль антигенов HLA-A и B в гибридах соматических клеток: потребность в бета2-микроглобулине». Тканевые антигены. 11 (2): 96–112. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1978.tb01233.x. PMID 77067.
- ^ Аллельная форма запроса IMGT / HLA - Европейский институт биоинформатики
- ^ Миддлтон, Д .; Menchaca, L .; Rood, H .; Комеровский, Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allelefrequencies.net». Тканевые антигены. 61 (5): 403–407. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2003.00062.x. PMID 12753660.
- ^ В * 3512