WikiDer > HNF1A

HNF1A
HNF1A
Белок TCF1 PDB 1ic8.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыHNF1A, HNF-1A, HNF1, IDDM20, LFB1, MODY3, TCF-1, TCF1, HNF1 гомеобокс A, HNF4A
Внешние идентификаторыOMIM: 142410 MGI: 98504 ГомолоГен: 459 Генные карты: HNF1A
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение HNF1A
Геномное расположение HNF1A
Группа12q24.31Начните120,978,543 бп[1]
Конец121,002,512 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TCF1 210515 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

6927

21405

Ансамбль

ENSG00000135100

ENSMUSG00000029556

UniProt

P20823

P22361

RefSeq (мРНК)

NM_000545
NM_001306179

NM_009327

RefSeq (белок)

NP_000536
NP_001293108
NP_000536.5
NP_001293108.1

NP_033353

Расположение (UCSC)Chr 12: 120.98 - 121 МбChr 5: 114.95 - 114.97 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

HNF1 гомеобокс A (гомеобокс A ядерного фактора 1 гепатоцитов), также известный как HNF1A, это человек ген на хромосома 12.[5][6][7] Он повсеместно экспрессируется во многих тканях и типах клеток.[8] В белок кодируется этим геном фактор транскрипции который высоко экспрессируется в печени и участвует в регуляции экспрессии нескольких специфичных для печени генов.[9] Мутации в HNF1A ген, как известно, вызывает сахарный диабет.[10] В HNF1A ген также содержит один из 27 SNP связано с повышенным риском ишемическая болезнь сердца.[11]

Структура

Ген

В HNF1A ген находится на хромосоме 12 в полосе 12q24.2 и содержит 10[12] экзоны.[7] Этот ген производит 8 изоформы через альтернативное сращивание.[13]

Протеин

Этот белок принадлежит к HNF1. гомеобокс семья.[13] Он содержит 3 функциональных домена: N-концевой димеризация домен (остатки 1–32), двудольный ДНК-связывающий мотив, содержащий атипичный POU-гомеодомен (остатки 98–280), а C-терминал домен трансактивации (остатки 281–631).[14][15] Существует также гибкий линкер (остатки 33–97), который соединяет димеризационный и ДНК-связывающий домены.[15] Кристаллическая структура решена для области димеризации, которая образует четырехспиральный пучок, в котором два α спирали разделены поворотом; ДНК-связывающий мотив, который образует спираль-поворот-спираль структура; и POU-гомеодомен, который состоит из трех α-спиралей, содержащихся в мотиве. Этот гомеодомен считается атипичным из-за протяженной петли, вставленной между второй и третьей спиралями относительно канонической складки гомеодомена. Считается, что атипичная вставка стабилизирует интерфейс для улучшения транскрипционный эффективность.[14] Между тем, домен димеризации отвечает за гомо- и гетеродимеризацию HNF-1α. Полученный димер содержит жесткую «мини-молнию», состоящую из α-спиралей 1 и 1 ', соединенных неканоническим тугим поворотом с гибким С-концом, содержащим α-спирали 2 и 2'.[15]

Функция

HNF-1α является фактор транскрипции выражается в органах энтодерма происхождение, в том числе печень, почки, поджелудочная железа, кишечник, желудок, селезенка, вилочковая железа, яичко, и кератиноциты и меланоциты в человеческая кожа.[16] Было показано, что он влияет на кишечная эпителиальная клетка рост и клеточные линии дифференциация. Например, HNF1A является важным внутренним фактором транскрипции у взрослых B лимфопоэз.[17][18][19] Участие HNF-1α в метаболизм глюкозы и сахарный диабет сообщалось, включая участие в GLUT1 и GLUT2 экспрессия транспортера в β-клетки поджелудочной железы и ангиотензин-превращающий фермент 2 экспрессия гена в островки поджелудочной железы.[20][21] HNF-1α может способствовать транскрипции нескольких белков, участвующих в управлении сахарный диабет II типа в том числе дипептидилпептидаза-IV (DPP-IV / CD26).[22][23] HNF-1α также участвует в различных метаболических путях других органов, например, является регулятором транскрипции желчная кислота переносчики в кишечнике и почках.[24] HNF-1α участвует в продвижении транспортеров органических катионов в печени, которые поглощают определенные классы фармацевтических препаратов; следовательно, потеря его функции может привести к проблемам с метаболизмом лекарства.[25] Кроме того, HNF-1α регулирует экспрессию белки острой фазы, такие как фибриноген, С-реактивный белок, и рецептор интерлейкина 1, которые связаны с воспалением.[26] Более того, значительно более низкие уровни HNF-1α в опухоли поджелудочной железы и гепатоцеллюлярные аденомы чем в нормальных прилегающих тканях, что позволяет предположить, что HNF-1α может играть возможную роль супрессора опухолей.[27][28]

Клиническое значение

Мутации HNF1A могут вызывать зрелый диабет у молодых людей 3 типа, одна из форм «моногенного диабета»,[6] а также гепатоцеллюлярная аденома. Белок HNF-1 присутствует в светлоклеточной карциноме яичника. [29][30]

У людей мутации в HNF1A вызывают диабет, который реагирует на низкие дозы препаратов сульфонилмочевины.[31] Выявление крайней чувствительности к сульфонилмочевине у пациентов с сахарным диабетом из-за гетерозиготных мутаций в HNF1A представляет собой четкий пример значимости HNF1A у пациентов с диабетом и того, как фармакогенетика может способствовать уходу за пациентами.[32] Например, пациенты со зрелым диабетом у молодых людей из-за мутаций в HNF1A (что составляет ~ 3% всех случаев сахарного диабета, диагностированных в возрасте до 30 лет) чрезвычайно чувствительны к лечению сульфонилмочевиной и могут успешно отказаться от лечения инсулином.[10] Точно так же пациенты с диабетом, вызванным мутациями в гене HNF1A, были описаны как чувствительные к гипогликемическим эффектам сульфонилмочевины. Причина гипергликемии, по-видимому, изменяет реакцию на гипогликемические препараты. Соответственно, диабет, индуцированный HNF-1α, имеет выраженную чувствительность к сульфонилмочевине. Этот фармакогенетический эффект согласуется с моделями дефицита HNF-1α, и генетическая основа гипергликемии может иметь значение для ведения пациентов.[10] Общий генетическая вариация внутри HNF1A также связан с риском развития диабет 2 типа и увеличился пенетрантность раннего диабета[33]

Клинический маркер

Мультилокусное исследование генетической шкалы риска, основанное на комбинации 27 локусов, включая ген HNF1A, выявило лиц с повышенным риском как инцидентной, так и рецидивирующей болезни коронарной артерии, а также усиление клинической пользы от терапии статинами. Исследование было основано на когортном исследовании сообщества (исследование Malmo Diet and Cancer) и четырех дополнительных рандомизированных контролируемых исследованиях когорт первичной профилактики (JUPITER и ASCOT) и когорт вторичной профилактики (CARE и PROVE IT-TIMI 22).[11]

Взаимодействия

Было показано, что HNF1A взаимодействовать с:

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000135100 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029556 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Шпирер К., Ривьер М., Кортезе Р., Накамура Т., Ислам MQ, Леван Г., Шпирер Дж. (Июнь 1992 г.). «Хромосомная локализация у человека и крысы генов, кодирующих обогащенные печенью факторы транскрипции C / EBP, DBP и HNF1 / LFB-1 (CEBP, DBP и фактор транскрипции 1, TCF1, соответственно) и фактор роста гепатоцитов / ген фактора рассеяния (HGF) ». Геномика. 13 (2): 293–300. Дои:10.1016 / 0888-7543 (92) 90245-Н. PMID 1535333.
  6. ^ а б Vaxillaire M, Boccio V, Philippi A, Vigouroux C, Terwilliger J, Passa P, Beckmann JS, Velho G, Lathrop GM, Froguel P (апрель 1995 г.). «Ген диабета у молодых людей в зрелом возрасте (MODY) отображается на хромосоме 12q». Природа Генетика. 9 (4): 418–23. Дои:10.1038 / ng0495-418. PMID 7795649. S2CID 665243.
  7. ^ а б "HNF1A HNF1 гомеобокс A [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2016-10-11.
  8. ^ «BioGPS - ваша система генного портала». biogps.org. Получено 2016-10-11.
  9. ^ Куртуа Дж., Морган Дж. Дж., Кэмпбелл Л. А., Фурель Дж., Крэбтри Г. Р. (октябрь 1987 г.). «Взаимодействие печеночно-ядерного фактора с промоторами фибриногена и альфа-1-антитрипсина». Наука. 238 (4827): 688–92. Bibcode:1987Sci ... 238..688C. Дои:10.1126 / science.3499668. PMID 3499668.
  10. ^ а б c Pearson ER, Starkey BJ, Powell RJ, Gribble FM, Clark PM, Hattersley AT (октябрь 2003 г.). «Генетическая причина гипергликемии и ответ на лечение диабета». Ланцет. 362 (9392): 1275–81. Дои:10.1016 / S0140-6736 (03) 14571-0. PMID 14575972. S2CID 34914098.
  11. ^ а б Mega JL, Stitziel NO, Smith JG, Chasman DI, Caulfield MJ, Devlin JJ, Nordio F, Hyde CL, Cannon CP, Sacks FM, Poulter NR, Sever PS, Ridker PM, Braunwald E, Melander O, Kathiresan S, Sabatine MS (Июнь 2015 г.). «Генетический риск, события ишемической болезни сердца и клиническая польза от терапии статинами: анализ испытаний первичной и вторичной профилактики». Ланцет. 385 (9984): 2264–71. Дои:10.1016 / S0140-6736 (14) 61730-X. ЧВК 4608367. PMID 25748612.
  12. ^ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NG_011731.2?report=genbank&to=30767
  13. ^ а б «HNF1A - ядерный фактор гепатоцитов 1-альфа - Homo sapiens (Человек) - ген и белок HNF1A». www.uniprot.org. Получено 2016-10-11.
  14. ^ а б Чи Й.И., Франц Д.Д., О.Б.К., Хансен Л., Де-Паганон С., Шоелсон С.Е. (ноябрь 2002 г.). «Диабетические мутации определяют атипичный домен POU в HNF-1альфа». Молекулярная клетка. 10 (5): 1129–37. Дои:10.1016 / с1097-2765 (02) 00704-9. PMID 12453420.
  15. ^ а б c Нараяна Н., Филлипс Н. Б., Хуа QX, Цзя В., Вайс Массачусетс (сентябрь 2006 г.). «Сахарный диабет из-за неправильной укладки фактора транскрипции бета-клеток: стереоспецифическая фрустрация мотива Шеллмана в HNF-1альфа». Журнал молекулярной биологии. 362 (3): 414–29. Дои:10.1016 / j.jmb.2006.06.086. PMID 16930618.
  16. ^ Реал Эрнандес LM, Fan J, Johnson MH, Gonzalez de Mejia E (01.01.2015). «Ягодные фенольные соединения увеличивают экспрессию ядерного фактора гепатоцитов-1α (HNF-1α) в клетках Caco-2 и нормальных клетках толстой кишки из-за высокого сродства с доменами транскрипции и димеризации HNF-1α». PLOS ONE. 10 (9): e0138768. Bibcode:2015PLoSO..1038768R. Дои:10.1371 / journal.pone.0138768. ЧВК 4587667. PMID 26413797.
  17. ^ Люсье ЧР, Бриал Ф., Рой С.А., Ланглуа М.Дж., Верду Э.Ф., Ривард Н., Перро Н., Будро Ф. (01.01.2010). «Потеря влияния гепатоцитарного ядерного фактора-1альфа на рост эпителиальных клеток кишечника взрослых мышей и дифференцировку клеточных клонов». PLOS ONE. 5 (8): e12378. Bibcode:2010PLoSO ... 512378L. Дои:10.1371 / journal.pone.0012378. ЧВК 2927538. PMID 20808783.
  18. ^ Д'Анджело А., Блюто О, Гарсия-Гонсалес М.А., Греш Л., Дуайен А., Гарбай С., Робин С., Понтольо М. (май 2010 г.). «Ядерный фактор гепатоцитов 1альфа и бета контролируют терминальную дифференцировку и предопределение судьбы клеток в эпителии кишечника». Разработка. 137 (9): 1573–82. Дои:10.1242 / dev.044420. PMID 20388655.
  19. ^ фон Внак Липински К., Саттлер К., Петерс С., Веске С., Кеул П., Кламп Х., Хойш Г., Гетерт Дж. Р., Левкау Б. (февраль 2016 г.). «Ядерный фактор гепатоцитов 1A является внутренним фактором транскрипции клеток, необходимым для дифференцировки и развития В-клеток у мышей». Журнал иммунологии. 196 (4): 1655–65. Дои:10.4049 / jimmunol.1500897. PMID 26800876.
  20. ^ Луни С., Март Дж. Д., Дойл Ф. Дж. (01.01.2012). «Компьютерное моделирование транспорта глюкозы в β-клетках поджелудочной железы определяет пороги метаболизма и терапевтические цели при диабете». PLOS ONE. 7 (12): e53130. Bibcode:2012PLoSO ... 753130L. Дои:10.1371 / journal.pone.0053130. ЧВК 3531366. PMID 23300881.
  21. ^ Педерсен КБ, Чхабра К.Х., Нгуен В.К., Ся Х., Лазартиг Э. (ноябрь 2013 г.). «Фактор транскрипции HNF1α индуцирует экспрессию ангиотензинпревращающего фермента 2 (ACE2) в островках поджелудочной железы из эволюционно законсервированных промоторных мотивов». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - механизмы регуляции генов. 1829 (11): 1225–35. Дои:10.1016 / j.bbagrm.2013.09.007. ЧВК 3838857. PMID 24100303.
  22. ^ Гу Н, Адачи Т., Мацунага Т., Такеда Дж., Цудзимото Дж., Исихара А., Ясуда К., Цуда К. (август 2006 г.). «Мутантный HNF-1alpha и мутантный HNF-1beta, идентифицированные в MODY3 и MODY5, подавляют экспрессию гена DPP-IV в клетках Caco-2». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 346 (3): 1016–23. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.06.010. PMID 16781669.
  23. ^ Гу Н, Цуда М., Мацунага Т., Адачи Т., Ясуда К., Исихара А., Цуда К. (декабрь 2008 г.). «Глюкозная регуляция экспрессии гена дипептидилпептидазы IV опосредуется ядерным фактором-1альфа гепатоцитов в эпителиальных клетках кишечника». Клиническая и экспериментальная фармакология и физиология. 35 (12): 1433–9. Дои:10.1111 / j.1440-1681.2008.05015.x. PMID 18671716. S2CID 24464350.
  24. ^ Ши Д.К., Буссен М., Сехайек Э., Анантанараянан М., Шнейдер Б.Л., Сухи Ф.Дж., Шефер С., Боллилени Д.С., Гонсалес Ф.Дж., Бреслоу Д.Л., Стоффель М. (апрель 2001 г.). «Ядерный фактор гепатоцитов-1альфа является важным регулятором метаболизма желчных кислот и холестерина в плазме». Природа Генетика. 27 (4): 375–82. Дои:10.1038/86871. PMID 11279518. S2CID 22640762.
  25. ^ О'Брайен В.П., Бокельманн К., Рамирес Дж., Йобст К., Ратаин М.Дж., Брокмеллер Дж., Цветков М.В. (октябрь 2013 г.). «Ядерный фактор 1 гепатоцитов регулирует экспрессию переносчика 1 органических катионов посредством связывания с эволюционно консервативной областью в интроне 1 гена OCT1». Журнал фармакологии и экспериментальной терапии. 347 (1): 181–92. Дои:10.1124 / jpet.113.206359. ЧВК 3781413. PMID 23922447.
  26. ^ Армендарис А.Д., Краусс Р.М. (апрель 2009 г.). «Ядерный фактор печени 1-альфа: воспаление, генетика и атеросклероз». Текущее мнение в липидологии. 20 (2): 106–11. Дои:10,1097 / моль. 0b013e3283295ee9. PMID 19280766. S2CID 85192269.
  27. ^ Ло З, Ли И, Ван Х, Флеминг Дж, Ли М, Кан И, Чжан Р., Ли Д. (01.01.2015). «Ядерный фактор гепатоцитов 1A (HNF1A) как возможный опухолевый супрессор при раке поджелудочной железы». PLOS ONE. 10 (3): e0121082. Bibcode:2015PLoSO..1021082L. Дои:10.1371 / journal.pone.0121082. ЧВК 4368635. PMID 25793983.
  28. ^ Блуто О, Жанно Э, Биулак-Сейдж П., Маркиз Дж. М., Блан Дж. Ф., Буй Х, Бодуан Дж. К., Франко Д., Балабо С., Лоран-Пуч П., Цукман-Росси Дж. (Октябрь 2002 г.). «Биаллельная инактивация TCF1 при аденомах печени». Природа Генетика. 32 (2): 312–5. Дои:10,1038 / ng1001. PMID 12355088. S2CID 11919671.
  29. ^ Köbel M, Kalloger SE, Carrick J, Huntsman D, Asad H, Oliva E, Ewanowich CA, Soslow RA, Gilks ​​CB (январь 2009 г.). «Ограниченный набор иммуномаркеров может надежно отличить светлоклеточный рак яичника от серозной карциномы высокой степени». Американский журнал хирургической патологии. 33 (1): 14–21. Дои:10.1097 / PAS.0b013e3181788546. PMID 18830127. S2CID 19610205.
  30. ^ Offman SL, Longacre TA (сентябрь 2012 г.). «Светлоклеточный рак женских половых путей (не все так однозначно, как кажется)». Достижения в анатомической патологии. 19 (5): 296–312. Дои:10.1097 / PAP.0b013e31826663b1. PMID 22885379. S2CID 33159622.
  31. ^ Оуэн К.Р. (июнь 2016 г.). «Лечение молодых людей с диабетом 2 типа или моногенным диабетом». Лучшие практики и исследования. Клиническая эндокринология и метаболизм. 30 (3): 455–67. Дои:10.1016 / j.beem.2016.05.002. PMID 27432078.
  32. ^ Чжоу К., Педерсен Х.К., Давид А.Ю., Пирсон ER (июнь 2016 г.). «Фармакогеномика при сахарном диабете: понимание действия лекарств и открытие лекарств» (PDF). Обзоры природы. Эндокринология. 12 (6): 337–46. Дои:10.1038 / nrendo.2016.51. PMID 27062931. S2CID 20405132.
  33. ^ «Общий вариант HNF1A I27L является модификатором возраста при диагностике диабета у людей с HNF1A-MODY»
  34. ^ а б c d Сотоглоу Э., Папафотиу Г., Катракили Н., Талианидис I (апрель 2000 г.). «Активация транскрипции ядерным фактором-1 гепатоцитов требует синергизма между множественными белками-коактиваторами». Журнал биологической химии. 275 (17): 12515–20. Дои:10.1074 / jbc.275.17.12515. PMID 10777539.
  35. ^ Бан Н, Ямада Й, Сомея Й, Мияваки К., Ихара Й, Хосокава М., Тойокуни С., Цуда К., Сейно Й (май 2002 г.). «Ядерный фактор гепатоцита-1альфа привлекает коактиватор транскрипции p300 на промоторе гена GLUT2». Сахарный диабет. 51 (5): 1409–18. Дои:10.2337 / диабет.51.5.1409. PMID 11978637.
  36. ^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3: 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.
  37. ^ Sourdive DJ, Transy C, Garbay S, Yaniv M (апрель 1997 г.). «Бифункциональный белок DCOH связывается с HNF1 независимо от его активности 4-альфа-карбиноламиндегидратазы». Исследования нуклеиновых кислот. 25 (8): 1476–84. Дои:10.1093 / nar / 25.8.1476. ЧВК 146627. PMID 9092652.
  38. ^ Хайнс Р.Н., Луо З., Крестейл Т., Динг Икс, Прото Р.А., Фицпатрик Дж. Л., Рипп С.Л., Фолкнер К.С., Ге Н.Л., Левин А., Элферинк С.Дж. (май 2001 г.). «Молекулярная регуляция генов, кодирующих ферменты, метаболизирующие ксенобиотики: механизмы с участием эндогенных факторов». Метаболизм и утилизация лекарств. 29 (5): 623–33. PMID 11302926.
  39. ^ Руфибах Л.Е., Дункан С.А., Батл М., Диб СС (июль 2006 г.). «Регуляция транскрипции промотора гена печеночной липазы (LIPC)». Журнал липидных исследований. 47 (7): 1463–77. Дои:10.1194 / мл. M600082-JLR200. PMID 16603721.
  40. ^ а б Булла Г.А., Краус Д.М. (декабрь 2004 г.). «Диссоциация фенотипа печени от экспрессии HNF4 и HNF1alpha». Отчеты по бионауке. 24 (6): 595–608. Дои:10.1007 / s10540-005-2794-8. PMID 16158197. S2CID 55553843.

дальнейшее чтение