WikiDer > Модель перехода спираль – спираль - Википедия
Модели перехода спираль – катушка формализованные техники в статистическая механика разработан для описания конформации линейных полимеры в растворе. Модели обычно, но не исключительно, применяются к полипептиды как мера относительной доли молекулы в альфа спираль конформация против повернуть или же случайный катушки. Главная достопримечательность в расследовании альфа спираль формация состоит в том, что можно встретить многие особенности сворачивание белка но в их простейшем варианте.[1] Большинство моделей спираль-спираль содержат параметры вероятности спирали. зарождение от области спирали и распространение спирали вдоль последовательности после зарождения; потому что полипептиды являются направленными и имеют четкие N-концевой и C-терминал заканчивается, параметры распространения могут отличаться в каждом направлении.
Два государства
- состояние спирали: характеризуется общим узором вращения, удерживаемым вместе водородные связи, (видеть альфа-спираль).
- состояние клубка: конгломерат случайно упорядоченной последовательности атомов (см. случайный катушки).
Общие модели перехода включают Модель Зимма – Брэгга и Модель Лифсона – Ройга, а также их расширения и варианты.
Энергия полиаланиновой спирали хозяина в водном растворе:
куда м - количество остатков в спирали.[2]
Рекомендации
- ^ Дойг AJ (2008). «Альфа-спираль как простейшая модель белка: теория спирали-спирали, стабильность и дизайн». В Муньос V (ред.). Сворачивание, неправильная укладка и агрегация белков: классические темы и новые подходы. Королевское химическое общество.
- ^ Чакрабартти А., Болдуин Р.Л. (1995). «Устойчивость альфа-спиралей». Adv Protein Chem. Успехи в химии белков. 46: 141–176. Дои:10.1016 / S0065-3233 (08) 60334-4. ISBN 9780120342464. PMID 7771317.
 | Этот физика-связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |