WikiDer > IDH3G

IDH3G
IDH3G
Идентификаторы
ПсевдонимыIDH3G, H-IDHG, изоцитратдегидрогеназа 3 (NAD (+)) гамма, изоцитратдегидрогеназа (NAD (+)) 3 гамма, изоцитратдегидрогеназа (NAD (+)) 3 некаталитическая субъединица гамма
Внешние идентификаторыOMIM: 300089 MGI: 1099463 ГомолоГен: 55803 Генные карты: IDH3G
Расположение гена (человек)
Х-хромосома (человек)
Chr.Х-хромосома (человек)[1]
Х-хромосома (человек)
Геномное расположение IDH3G
Геномное расположение IDH3G
ГруппаXq28Начинать153,785,766 бп[1]
Конец153,794,523 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE IDH3G 214333 x at fs.png

PBB GE IDH3G 202471 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_174869
NM_004135

NM_008323
NM_001356356

RefSeq (белок)

NP_004126
NP_777358

NP_032349
NP_001343285

Расположение (UCSC)Chr X: 153,79 - 153,79 МбChr X: 73,78 - 73,79 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Изоцитратдегидрогеназа [НАД] субъединица гамма, митохондриальная является фермент что у людей кодируется IDH3G ген.[5][6]

Изоцитратдегидрогеназы (IDH) катализировать окислительный декарбоксилирование из изоцитрат к 2-оксоглутарат. Эти ферменты принадлежат к двум разным подклассам, один из которых использует НАД(+) как акцептор электронов а другой НАДФ (+). Сообщается о пяти изоцитратдегидрогеназах: о трех НАД (+) - зависимых изоцитратдегидрогеназах, которые локализуются в митохондриальном матриксе, и о двух. НАДФ(+) - зависимые изоцитратдегидрогеназы, одна из которых митохондриальный а другой преимущественно цитозольный. НАД (+) - зависимые изоцитратдегидрогеназы катализируют аллостерически регулируемый ограничивающий шаг из цикл трикарбоновых кислот. Каждый изофермент представляет собой гетеротетрамер который состоит из двух альфа подразделения, одна бета-субъединица и одна гамма-субъединица. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой гамма-субъединицу одного изофермента НАД (+) - зависимой изоцитратдегидрогеназы. Этот ген является геном-кандидатом в перивентрикулярный гетеротопия. Описано несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскрипта этого гена, но определена лишь часть их полноразмерной природы. [предоставлено RefSeq, июль 2008 г.][6]

Структура

IDH3 - один из трех изоферментов изоцитратдегидрогеназы, два других - IDH1 и IDH2, и кодируется одним из пяти генов изоцитратдегидрогеназы, которые IDH1, IDH2, IDH3A, IDH3B, и IDH3G.[7] Гены IDH3A, IDH3B, и IDH3G кодируют субъединицы IDH3, который является гетеротетрамер состоит из двух α-субъединиц 37 кДа (IDH3α), одной β-субъединицы 39 кДа (IDH3β) и одной γ-субъединицы 39 кДа (IDH3γ), каждая из которых имеет отдельные изоэлектрические точки.[8][9][10] Выравнивание их аминокислотные последовательности выявляет ~ 40% идентичности между IDH3α и IDH3β, ~ 42% идентичности между IDH3α и IDH3γ и еще более близкую идентичность 53% между IDH3β и IDH3γ, что составляет 34% идентичности и 23% сходства для всех трех типов субъединиц.[9][10][11][12] В частности, Arg88 в IDH3α имеет важное значение для каталитической активности IDH3, тогда как эквивалентные Arg99 в IDH3β и Arg97 в IDH3γ в значительной степени участвуют в аллостерической регуляции фермента с помощью ADP и NAD.[11] Таким образом, возможно, что эти субъединицы произошли от дупликация гена общего предкового гена и исходного каталитического Arg остаток были адаптированы к аллостерическим функциям в β- и γ-субъединицах.[9][11] Так же, Жерех181 в IDH3α необходим для катализа, в то время как эквивалентные Asp192 в IDH3β и Asp190 в IDH3γ усиливают НАД- и Mn2+-обвязка.[9] Поскольку окислительное декарбоксилирование, катализируемое IDH3, требует связывания НАД, Mn2+, а субстрат isocitrate, все три субъединицы участвуют в каталитической реакции.[10][11] Более того, исследования фермента в сердце свиньи показывают, что димеры αβ и αγ составляют два сайта связывания для каждого из его лиганды, в том числе изоцитрат, Mn2+и НАД в одном тетрамере IDH3.[9][10]

Функция

Как изоцитратдегидрогеназа, IDH3 катализирует обратимое окислительное декарбоксилирование изоцитрата с образованием α-кетоглутарат (α-KG) и CO2 как часть Цикл TCA в метаболизме глюкозы.[8][9][10][11][13] Этот шаг также учитывает сопутствующие снижение NAD + в NADH, который затем используется для генерации АТФ сквозь электронная транспортная цепь. Примечательно, что IDH3 полагается на NAD + в качестве своего акцептор электронов, в отличие от NADP +, такого как IDH1 и IDH2.[8][9] Активность IDH3 регулируется потребностями клетки в энергии: когда клетке требуется энергия, IDH3 активируется АДФ; а когда энергия больше не требуется, IDH3 ингибируется АТФ и NADH.[9][10] Эта аллостерическая регуляция позволяет IDH3 функционировать как лимитирующая ступень в цикле TCA.[13][14] Внутри клеток было обнаружено, что IDH3 и его субъединицы локализовать к митохондрии.[9][10][13]

Клиническое значение

В IDH3G ген может быть вовлечен в лекарственную устойчивость у рак желудка.[15]

Интерактивная карта проезда

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. [§ 1]

[[Файл:
TCACycle_WP78перейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти в HMDBперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти в HMDBперейти к статьеперейти к статьеперейти в HMDBперейти к статьеперейти к статьеперейти в HMDBперейти к статьеперейти к статьеперейти в HMDBперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти на WikiPathwaysперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статье
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
TCACycle_WP78перейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти в HMDBперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти в HMDBперейти к статьеперейти к статьеперейти в HMDBперейти к статьеперейти к статьеперейти в HMDBперейти к статьеперейти к статьеперейти в HMDBперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти на WikiPathwaysперейти к статьеперейти к статьеперейти к статьеперейти к статье
| {{{bSize}}} px | alt = Цикл TCA редактировать]]
  1. ^ Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: "TCACycle_WP78".

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000067829 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002010 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Бреннер В., Ньякатура Г., Розенталь А., Платцер М. (ноябрь 1997 г.). «Геномная организация двух новых генов на человеческом Xq28: компактное расположение IDH гамма и TRAP дельта голова к голове сохраняется у крысы и мыши». Геномика. 44 (1): 8–14. Дои:10.1006 / geno.1997.4822. PMID 9286695.
  6. ^ а б «Ген Entrez: IDH3G изоцитратдегидрогеназа 3 (NAD +) гамма».
  7. ^ Димитров Л., Хонг С.С., Ян С., Чжуан З., Хейсс Д.Д. (2015). «Новые разработки в патогенезе и терапевтическом воздействии мутации IDH1 в глиоме». Международный журнал медицинских наук. 12 (3): 201–13. Дои:10.7150 / ijms.11047. ЧВК 4323358. PMID 25678837.
  8. ^ а б c Цзэн, Л; Моринибу, А; Кобаяши, М; Чжу, Y; Ван, Х; Гото, Y; Йом, CJ; Чжао, Т; Хирота, К; Шиномия, К; Итасака, S; Йошимура, М; Guo, G; Hammond, EM; Хираока, М. Харада, H (3 сентября 2015 г.). «Аберрантная экспрессия IDH3α способствует росту злокачественной опухоли путем индукции HIF-1-опосредованного метаболического перепрограммирования и ангиогенеза». Онкоген. 34 (36): 4758–66. Дои:10.1038 / onc.2014.411. PMID 25531325.
  9. ^ а б c d е ж грамм час я Бзымек, КП; Колман, РФ (8 мая 2007 г.). «Роль альфа-Asp181, бета-Asp192 и гамма-Asp190 в отличительных субъединицах человеческой НАД-специфической изоцитратдегидрогеназы». Биохимия. 46 (18): 5391–7. Дои:10.1021 / bi700061t. PMID 17432878.
  10. ^ а б c d е ж грамм Soundar, S; О'хаган, М; Фомулу, KS; Колман, РФ (28 июля 2006 г.). «Идентификация Mn2 + -связывающих аспартатов из альфа, бета и гамма субъединиц NAD-зависимой изоцитратдегидрогеназы человека». Журнал биологической химии. 281 (30): 21073–81. Дои:10.1074 / jbc.m602956200. PMID 16737955.
  11. ^ а б c d е Soundar, S; Парк, JH; Ха, TL; Колман, РФ (26 декабря 2003 г.). «Оценка с помощью мутагенеза важности 3 аргининов в альфа, бета и гамма субъединицах НАД-зависимой изоцитратдегидрогеназы человека». Журнал биологической химии. 278 (52): 52146–53. Дои:10.1074 / jbc.m306178200. PMID 14555658.
  12. ^ Данге, М; Колман, РФ (2 июля 2010 г.). «Каждый консервативный тир активного сайта в трех субъединицах изоцитратдегидрогеназы человека выполняет разные функции». Журнал биологической химии. 285 (27): 20520–5. Дои:10.1074 / jbc.m110.115386. ЧВК 2898308. PMID 20435888.
  13. ^ а б c Huh TL, Kim YO, Oh IU, Song BJ, Inazawa J (май 1997). «Отнесение человеческого митохондриального NAD + -специфического гена альфа-субъединицы изоцитратдегидрогеназы (IDH3A) к 15q25.1 → q25.2 посредством гибридизации in situ». Геномика. 32 (2): 295–6. Дои:10.1006 / geno.1996.0120. PMID 8833160.
  14. ^ Йошими, N; Футамура, Т; Берген, ЮВ; Иваяма, Y; Ишима, Т; Селлгрен, С; Экман, CJ; Якобссон, Дж; Pålsson, E; Какумото, К; Охги, Y; Йошикава, Т; Landén, M; Хашимото, К. (19 января 2016 г.). «Метаболомика спинномозговой жидкости определяет ключевую роль изоцитратдегидрогеназы в биполярном расстройстве: доказательства в поддержку гипотезы митохондриальной дисфункции». Молекулярная психиатрия. Дои:10.1038 / mp.2015.217. ЧВК 5078854. PMID 26782057.
  15. ^ Чжоу, Дж; Йонг, WP; Яп, CS; Виджаярагхаван, А; Синха, РА; Сингх, Б. К.; Xiu, S; Манеш, S; Нго, А; Lim, A; Ang, C; Се, С; Вонг, ФГ; Lin, SJ; Ван, WK; Тан, И.Б .; Flotow, H; Tan, P; Lim, KH; Йена, PM; Го, Л.К. (апрель 2015 г.). «Интегративный подход выявил гены, связанные с лекарственным ответом при раке желудка». Канцерогенез. 36 (4): 441–51. Дои:10.1093 / carcin / bgv014. PMID 25742747.

дальнейшее чтение