WikiDer > Полиомавирус KI - Википедия

KI polyomavirus - Wikipedia
Полиомавирус человека 3
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Моноднавирия
Королевство:Shotokuvirae
Тип:Cossaviricota
Учебный класс:Papovaviricetes
Заказ:Сеполивиралес
Семья:Polyomaviridae
Род:Бетаполиомавирус
Разновидность:
Полиомавирус человека 3

Полиомавирус KI (также известен как KI вирус, KIPyV, или же Полиомавирус человека 3) это вирус семьи Polyomaviridae. Он был обнаружен в 2007 году в хранимых образцах выделений из дыхательных путей человека, собранных Каролинский институт, в честь которого назван вирус.[1]

Открытие

Вирус KI был обнаружен в 2007 году в образцах выделений из дыхательных путей человека, которые систематически исследовались в рамках программы по идентификации новых вирусов человека. Это было идентифицировано гомология последовательностей к известным полиомавирусам человека BK вирус и JC вирус, обезьяний полиомавирус SV40.[1] Вирус KI был третьим описанным полиомавирусом человека и первым обнаруженным со времен BK и JC в 1971 году.[2] Очень похожий респираторный вирус, WU вирус, также сообщалось позже, в 2007 году.[3]

Геном

Структура генома WU вирус.[3] Вирус KI имеет почти идентичную структуру с немного другой длиной 5040 пар оснований.[1]

Полный геном вируса KI секвенировали и обнаружили, что двухцепочечная ДНК геном 5040 пар оснований содержащий генетический материал, характерный для полиомавирусов, кодирующий пять вирусные белки: три капсид составные части, главный капсидный белок VP1, VP2 и VP3; и два дополнительных белка, участвующих в репликации, большой опухолевый антиген и небольшой опухолевый антиген.[1]

Распространенность

Распространенность вируса KI, определяемая по присутствию его ДНК в образцах человека, обычно оценивается в диапазоне 1-5% в различных местах и ​​популяциях с некоторыми признаками возрастной зависимости.[4] Вирус был обнаружен в респираторных секретах детей с респираторными инфекциями во многих местах.[5][6] Напротив, в одном исследовании 2009 г. серологическая распространенность - то есть преобладание антитела против вируса (в данном случае белка оболочки VP1) - достигает 55% среди взрослого населения Америки и 56% среди населения Америки детей.[7] Другое исследование 2009 года выявило около 70% распространенности серотипов среди взрослых, при этом возрастные особенности указывают на то, что младенцы могут наследовать материнские антитела против WU и KI.[8] Исследование серологической распространенности полиомавируса в 2016 году обнаружило вирус WU в 91,3% образцов из другой американской популяции.[9] Считается, что первичная инфекция возникает в детстве.[9]

Ассоциация болезней

Вирус KI, как и его близкий родственник вирус WU, не связан с какими-либо клиническими заболеваниями, несмотря на его присутствие в респираторных секретах.[10] Частота коинфекции другими респираторными вирусами высока, поэтому трудно определить причинность вируса KI даже при наличии клинических симптомов.[4] Некоторые полиомавирусы хорошо известны как канцерогенный, включая полиомавирус человека Полиомавирус клеток Меркеля, но вирус KI также не был связан с раком.[11] Хотя четкой связи с клиническими симптомами не выявлено, имеется слабое свидетельство того, что вирусы WU и KI могут иметь патогенный потенциал в с ослабленным иммунитетом пациенты.[12]

Номенклатура и классификация

Вирус KI получил свое название от Каролинский институт, институциональная принадлежность исследователей, которые обнаружили и сообщили о вирусе.[1]

Среди полиомавирусов человека KI наиболее похож на WU вирус. Предложенная в 2010 году классификация рекомендовала разделить полиомавирусы на три рода, включая один род вирусов птиц и два вируса млекопитающих; один из последних был назначен Вукиполёмовирус чтобы указать двух его членов-основателей.[13] В обновленной системе классификации семейства полиомавирусов, предложенной в 2016 г., вирус WU классифицируется как член род Бетаполиомавирус вместе с BK, JC и KI.[2]

Рекомендации

  1. ^ а б c d е Алландер, Тобиас; Андреассон, Калле; Гупта, Шавон; Бьеркнер, Аннели; Богданович, Гордана; Persson, Mats A. A .; Далианис, Тина; Рамквист, Торбьорн; Андерссон, Бьорн (2007-04-01). «Выявление третьего полиомавируса человека». Журнал вирусологии. 81 (8): 4130–4136. Дои:10.1128 / JVI.00028-07. ISSN 0022-538X. ЧВК 1866148. PMID 17287263.
  2. ^ а б Группа по изучению полиомавирусов Международного комитета по таксономии вирусов; Кальвиньяк-Спенсер, S; Фельткамп, MC; Догерти, доктор медицины; Moens, U; Рамквист, Т; Johne, R; Элерс, Б. (июнь 2016 г.). «Обновление таксономии семейства Polyomaviridae». Архив вирусологии. 161 (6): 1739–50. Дои:10.1007 / s00705-016-2794-у. PMID 26923930.
  3. ^ а б Гейнор, AM; Nissen, MD; В то время как DM; Маккей, И. М.; Lambert, SB; Wu, G; Бреннан, округ Колумбия; Сторч, Джорджия; Слоты, TP; Ван, Д. (4 мая 2007 г.). «Выявление нового полиомавируса у пациентов с острыми респираторными инфекциями». PLoS Патогены. 3 (5): e64. Дои:10.1371 / journal.ppat.0030064. ЧВК 1864993. PMID 17480120.
  4. ^ а б Абеди Киасари, B; Валлели, П.Дж.; Корлесс, CE; Аль-Хаммади, М. Клаппер, ЧП (сентябрь 2008 г.). «Возрастная картина полиомавирусной инфекции KI и WU». Журнал клинической вирусологии. 43 (1): 123–5. Дои:10.1016 / j.jcv.2008.05.003. ЧВК 7108349. PMID 18573691.
  5. ^ Юань, XH; Джин, Й; Xie, ZP; Гао, ХК; Сюй, ZQ; Чжэн, LS; Чжан, РФ; Песня, младший; Hou, YD; Дуань, З. Дж. (Октябрь 2008 г.). «Распространенность полиомавирусов KI и WU человека у детей с острой респираторной инфекцией в Китае». Журнал клинической микробиологии. 46 (10): 3522–5. Дои:10.1128 / jcm.01301-08. ЧВК 2566089. PMID 18667596.
  6. ^ Бялашевич, S; В то время как DM; Lambert, SB; Wang, D; Nissen, MD; Sloots, TP (сентябрь 2007 г.). «Недавно зарегистрированный полиомавирус человека, вирус KI, присутствует в дыхательных путях австралийских детей». Журнал клинической вирусологии. 40 (1): 15–8. Дои:10.1016 / j.jcv.2007.07.001. ЧВК 7172449. PMID 17706457.
  7. ^ Кин, JM; Рао, S; Ван, М; Гарси, Р.Л. (март 2009 г.). «Сероэпидемиология полиомавирусов человека». PLoS Патогены. 5 (3): e1000363. Дои:10.1371 / journal.ppat.1000363. ЧВК 2655709. PMID 19325891.
  8. ^ Nguyen, Nang L .; Ле, Бинь Минь; Ван, Дэвид (2009-08-01). «Серологические свидетельства частого инфицирования людей полиомавирусами WU и KI». Возникающие инфекционные заболевания. 15 (8): 1199–1205. Дои:10.3201 / eid1508.090270. ISSN 1080-6059. ЧВК 2815979. PMID 19751580.
  9. ^ а б Госсай, А; Waterboer, T; Нельсон, HH; Мишель, А; Willhauck-Fleckenstein, M; Фарзан, СФ; Hoen, AG; Кристенсен, Британская Колумбия; Келси, KT; Marsit, CJ; Павлита, М; Карагас, М.Р. (1 января 2016 г.). «Сероэпидемиология полиомавирусов человека в популяции США». Американский журнал эпидемиологии. 183 (1): 61–9. Дои:10.1093 / aje / kwv155. ЧВК 5006224. PMID 26667254.
  10. ^ Norja, P; Убиллос, I; Темплтон, К; Симмондс, П. (декабрь 2007 г.). «Нет доказательств связи между инфекциями полиомавирусами WU и KI и респираторными заболеваниями». Журнал клинической вирусологии. 40 (4): 307–11. Дои:10.1016 / j.jcv.2007.09.008. ЧВК 7172997. PMID 17997354.
  11. ^ Далианис, Т; Hirsch, HH (15 марта 2013 г.). «Полиомавирусы человека при болезнях и раках». Вирусология. 437 (2): 63–72. Дои:10.1016 / j.virol.2012.12.015. PMID 23357733.
  12. ^ Бабакир-Мина, М; Чиккоцци, М; Perno, CF; Чиотти, М. (август 2013 г.). «Полиомавирусы человека KI и WU: вирусологические предпосылки и клинические последствия». APMIS. 121 (8): 746–54. Дои:10.1111 / apm.12091. PMID 23782405.
  13. ^ Johne, R; Бак, CB; Allander, T; Этвуд, WJ; Гарсиа, Р.Л .; Империале, MJ; Майор, ЭО; Рамквист, Т; Норкин, Л.С. (сентябрь 2011 г.). «Таксономические изменения в семействе Polyomaviridae». Архив вирусологии. 156 (9): 1627–34. Дои:10.1007 / s00705-011-1008-х. ЧВК 3815707. PMID 21562881.