WikiDer > LSID
Идентификаторы наук о жизни[1][2] являются способом называть и находить фрагменты информации в сети. По сути, LSID - это уникальный идентификатор для некоторых данных, а протокол LSID определяет стандартный способ поиска данных (а также стандартный способ описания этих данных). Они немного похожи DOI используется многими издателями.
LSID представлен как единое имя ресурса (URN) в следующем формате:
- урна: lsid:
: : [: ]
В lsid: пространство имен, однако, не зарегистрировано в Управление по присвоению номеров в Интернете (IANA), поэтому это не строго URN или URI.[3]
LSID могут быть разрешены в URL-адресах, например http://zoobank.org/urn:lsid:zoobank.org:pub:CDC8D258-8F57-41DC-B560-247E17D3DC8C
Споры по поводу использования LSID
LSID вызвали большой интерес как в биоинформатика и биоразнообразие сообщества, причем последние продолжают использовать их как способ определения видов в глобальных каталогах.[4] Однако в последнее время, когда понимание того, как HTTP URI может выполнять аналогичную задачу по именованию,[5][6] критиковалось использование LSID в качестве идентификаторов[7] как нарушение хорошей практики веб-архитектуры повторного использования существующих схем URI.[8] Тем не менее, явное отделение данных от метаданных; спецификация метода для обнаружения нескольких мест для поиска данных; и способность обнаруживать несколько независимых источников метаданных для любого идентифицированного объекта были ключевыми частями LSID и его спецификации разрешения, которые не были успешно воспроизведены подходом, основанным только на HTTP.
В Всемирная сеть обеспечивает глобально распределенную структуру коммуникации, которая необходима практически для любого научного сотрудничества, включая биоинформатику. Однако считалось, что существует несколько ограничений и недостатков, одним из которых была неспособность программно идентифицировать объекты с локальными именами, которые могут широко распространяться по сети. Этот предполагаемый недостаток ограничил бы нашу способность интегрировать несколько баз знаний, каждая из которых дает частичную информацию об общем домене, как это обычно наблюдается в биоинформатике. Идентификатор естествознания (LSID) и система разрешения LSID (LSRS) были разработаны для предоставления простых и элегантных решений этой проблемы, совместимых с решениями следующего поколения. Семантическая сеть и семантическая сетка, основанный на расширении существующих интернет-технологий. Однако недавно было указано, что некоторые из этих предполагаемых недостатков не присущи HTTP URI, и большая часть (хотя и не все) функциональных возможностей, предоставляемых LSID, может быть получена с использованием правильно созданных HTTP URI.[5]
Смотрите также
- Структура описания ресурсов
- MicroArray и экспрессия генов
- ЗооБанк
- MycoBank
- URI MIRIAM
- Международный номер географического образца
- SciCrunch
Заметки
- ^ Кларк Т., Мартин С., Лифельд Т. Брифинги по биоинформатике 5.1: 59-70, 1 марта 2004 г.
- ^ Технологический отчет по спецификации идентификаторов наук о жизни OMG (LSID)
- ^ "GitHub - tdwg / wiki-archive: Архив вики TDWG". 2018-11-15.
- ^ Эндрю С. Джонс, Ричард Дж. Уайт и Юэн Рорм, Определение и соотнесение биологических концепций в каталоге жизни. Журнал биомедицинской семантики 2011, 2: 7
- ^ а б Бут, Дэвид: «Преобразование новых схем URI или субсхем URN в HTTP»
- ^ Томпсон, Генри С .: «Прецедент, предлагающий компромисс для лучших практик SWHCLS IG», публично заархивированное электронное сообщение
- ^ Мендельсон, Ноа: «Мой разговор с Шоном Мартином о LSID», общедоступное электронное письмо в список рассылки W3C TAG 25 июля 2006 г.
- ^ W3C Архитектура всемирной паутины
внешние ссылки
- Проект разрешения LSID
- Полномочия по назначению и разрешению LSID от Техасского университета в Остине
- Позиция по LSID - Размышления кого-то, кто участвует в реализации и развертывании LSID