WikiDer > Лабораторная автоматизация
Лабораторная автоматизация представляет собой междисциплинарную стратегию исследования, разработки, оптимизации и использования лабораторных технологий, которые позволяют создавать новые и улучшенные процессы. Специалисты по автоматизации лабораторий - это академические, коммерческие и государственные исследователи, ученые и инженеры, которые проводят исследования и разрабатывают новые технологии для повышения производительности, повышения качества экспериментальных данных, сокращения продолжительности рабочего цикла лаборатории или проведения экспериментов, которые в противном случае были бы невозможны.
Наиболее широко известное применение технологии автоматизации лабораторий: лабораторная робототехника. В более общем плане, область лабораторной автоматизации включает множество различных автоматизированных лабораторий. инструменты, устройства (наиболее распространенные автосэмплеры), программные алгоритмы и методологии, используемые для включения, ускорения и увеличения эффективность и эффективность научных исследований в лабораториях.
Применение технологий в сегодняшних лабораториях необходимо для своевременного прогресса и сохранения конкурентоспособности. Лаборатории, посвященные таким видам деятельности, как высокопроизводительный скрининг, комбинаторная химия, автоматизированное клиническое и аналитическое тестирование, диагностика, крупномасштабные биорепозитории и многие другие не существовали бы без достижений в области автоматизации лабораторий.
Некоторые университеты предлагают целые программы, посвященные лабораторным технологиям. Например, Университет Индианы - Университет Пердью в Индианаполисе предлагает аспирантуру по лабораторной информатике. Так же Институт Кека в Калифорния предлагает ученую степень с акцентом на разработку анализов, инструментов и инструментов анализа данных, необходимых для клинической диагностики, высокопроизводительный скрининг, генотипирование, микрочип технологии, протеомика, визуализация и другие приложения.
История
По крайней мере, с 1875 года появились сообщения об автоматизированных устройствах для научных исследований.[1] Эти первые устройства были в основном построены самими учеными для решения задач в лаборатории. После Второй мировой войны компании начали поставлять автоматизированное оборудование все большей и большей сложности.
Автоматизация неуклонно распространялась в лабораториях в течение 20 века, но затем произошла революция: в начале 1980-х годов была открыта первая полностью автоматизированная лаборатория. Доктор Масахиде Сасаки.[2][3] В 1993 г. Доктор Род Маркин на Медицинский центр Университета Небраски создал одну из первых в мире клинических автоматизированных систем управления лабораториями.[4] В середине 1990-х он возглавлял группу стандартов под названием Руководящий комитет по стандартам автоматизации клинических испытаний (CTASSC) Американская ассоциация клинической химии,[5][6] который позже превратился в областной комитет Институт клинических и лабораторных стандартов.[7] В 2004 г. Национальные институты здоровья (NIH) и более 300 признанных на национальном уровне лидеров в научных кругах, промышленности, правительстве и общественности завершили Дорожная карта NIH для ускорения медицинских открытий для улучшения здоровья. В Дорожная карта NIH четко определяет развитие технологий как критически важный фактор в Группе внедрения молекулярных библиотек и изображений (см. первую тему - Новые пути к открытиям - на https://web.archive.org/web/20100611171315/http://nihroadmap.nih.gov/).
Несмотря на успех лаборатории доктора Сасаки и других подобных лабораторий, многомиллионная стоимость таких лабораторий препятствует их принятию небольшими группами.[8] Это все сложнее, потому что устройства разных производителей часто не могут взаимодействовать друг с другом. Однако недавние достижения, основанные на использовании языков сценариев, таких как Autoit сделали возможной интеграцию оборудования разных производителей.[9] Используя этот подход, многие недорогие электронные устройства, включая устройства с открытым исходным кодом,[10] становятся совместимыми с обычными лабораторными приборами.
Некоторые стартапы, такие как Изумрудная облачная лаборатория и Strateos предоставляют доступ к лабораториям по требованию и удаленный доступ в коммерческих масштабах. Исследование 2017 года показывает, что эти коммерческие, полностью интегрированные автоматизированные лаборатории могут улучшить воспроизводимость и прозрачность основных биомедицинских экспериментов, и что более девяти из десяти биомедицинских публикаций используют методы, доступные в настоящее время в этих группах.[11]
Недорогая автоматизация лабораторий
Большим препятствием для внедрения автоматизации в лабораториях была ее высокая стоимость. Многие лабораторные инструменты очень дороги. Во многих случаях это оправдано, поскольку такое оборудование может выполнять очень специфические задачи с использованием передовых технологий. Однако в лаборатории используются устройства, которые не являются высокотехнологичными, но все же очень дорогими. Так обстоит дело со многими автоматизированными устройствами, которые выполняют задачи, которые можно легко выполнить с помощью простых и недорогих устройств, таких как простые роботизированные руки,[12][13][14] универсальные (с открытым исходным кодом) электронные модули,[15][16][17][18][19] или же 3D принтеры.
До сих пор использование таких недорогих устройств вместе с лабораторным оборудованием считалось очень трудным. Однако было продемонстрировано, что такие недорогие устройства могут без проблем заменить стандартные машины, используемые в лаборатории.[12][20][21] Можно ожидать, что больше лабораторий воспользуются преимуществами этой новой реальности, поскольку недорогая автоматизация очень привлекательна для лабораторий.
Технология, которая позволяет интегрировать любую машину независимо от ее марки, - это создание сценариев, в частности сценариев, включающих управление щелчками мыши и вводом с клавиатуры, например AutoIt. Посредством синхронизации щелчков и ввода с клавиатуры можно идеально синхронизировать различные программные интерфейсы, управляющие разными устройствами.[9][22]
Рекомендации
- ^ Олсен, Кевин (2012-12-01). «Первые 110 лет технологий автоматизации лабораторий, приложений и творческих ученых». Журнал автоматизации лабораторий. 17 (6): 469–480. Дои:10.1177/2211068212455631. ISSN 2211-0682. PMID 22893633. S2CID 37758591.[постоянная мертвая ссылка]
- ^ Фелдер, Робин А. (01.04.2006). «Клинический химик: Масахиде Сасаки, доктор медицины, доктор философии (27 августа 1933 - 23 сентября 2005)». Клиническая химия. 52 (4): 791–792. Дои:10.1373 / Clinchem.2006.067686. ISSN 0009-9147.
- ^ Бойд, Джеймс (18 января 2002). «Автоматизация роботизированных лабораторий». Наука. 295 (5554): 517–518. Дои:10.1126 / science.295.5554.517. ISSN 0036-8075. PMID 11799250. S2CID 108766687.
- ^ "LIM Source, ресурс систем управления лабораторной информацией". В архиве из оригинала от 11.08.2009. Получено 2009-02-20.
- ^ "Клиническая химия 46, No. 5, 2000, pgs. 246–250 " (PDF). В архиве (PDF) из оригинала 2011-06-07. Получено 2009-02-20.
- ^ "Технологии управления здоровьем журнал, 1 октября 1995 г. ". В архиве из оригинала от 17.02.2012. Получено 2009-02-20.
- ^ «Институт клинических и лабораторных стандартов (ранее NCCLS)». Архивировано из оригинал на 2008-10-07. Получено 2009-02-20.
- ^ Фелдер, Робин А. (1998-12-01). «Модульные рабочие места: современные методы автоматизации лабораторий». Clinica Chimica Acta. 278 (2): 257–267. Дои:10.1016 / S0009-8981 (98) 00151-X. PMID 10023832.
- ^ а б Карвалью, Матеус К. (1 августа 2013 г.). «Интеграция аналитических приборов с компьютерным скриптингом». Журнал автоматизации лабораторий. 18 (4): 328–333. Дои:10.1177/2211068213476288. ISSN 2211-0682. PMID 23413273.
- ^ Пирс, Джошуа М. (01.01.2014). Глава 1 - Введение в оборудование с открытым исходным кодом для науки. Бостон: Эльзевир. С. 1–11. Дои:10.1016 / b978-0-12-410462-4.00001-9. ISBN 9780124104624.
- ^ Groth, P .; Кокс, Дж. (2017). «Показатели использования роботизированных лабораторий в фундаментальных биомедицинских исследованиях: анализ литературы». PeerJ. 5: e3997. Дои:10.7717 / peerj.3997. ЧВК 5681851. PMID 29134146.
- ^ а б Carvalho, Matheus C .; Эйр, Брэдли Д. (01.12.2013). «Недорогой, простой в сборке, портативный и универсальный автосамплер для жидкостей». Методы океанографии. 8: 23–32. Дои:10.1016 / j.mio.2014.06.001.
- ^ Чиу, Ши-Хао; Урбан, Павел Л. (2015). «Платформа для масс-спектрометрического анализа с помощью робототехники на базе электроники с открытым исходным кодом». Биосенсоры и биоэлектроника. 64: 260–268. Дои:10.1016 / j.bios.2014.08.087. PMID 25232666.
- ^ Чен, Чи-Линь; Чен, Тинг-Ру; Чиу, Ши-Хао; Урбан, Павел Л. (2017). Линия по производству «двойной роботизированной руки» «масс-спектрометрический анализ под управлением нескольких микроконтроллеров типа Arduino». Датчики и исполнительные механизмы B: химические. 239: 608–616. Дои:10.1016 / j.snb.2016.08.031.
- ^ Урбан, Павел Л. (2015). «Универсальная электроника для миниатюрных и автоматизированных химических анализов». Аналитик. 140 (4): 963–975. Bibcode:2015Ана ... 140..963U. Дои:10.1039 / C4AN02013H. PMID 25535820. В архиве из оригинала 2018-11-06. Получено 2018-12-15.
- ^ Урбан, Павел (2016-04-20). «Открытое оборудование: лабораторное оборудование собственного изготовления стимулирует творчество». Природа. 532 (7599): 313. Bibcode:2016Натура.532..313U. Дои:10.1038 / 532313d. PMID 27127816.
- ^ Байларджон П., Спайсер Т.П., Скампавия Л. (2019). «Приложения для осветительных панелей с открытым исходным кодом, совместимых с микропланшетами». J Vis Exp (152). Дои:10.3791/60088. PMID 31633701.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- ^ Байларджон П., Косс-Флорес К., Сингера Ф., Шумате Дж., Уильямс Х., ДеЛука Л.; и другие. (2019). «Дизайн панелей освещения, совместимых с микропланшетами, для полуавтоматической настольной системы дозирования». SLAS Technol. 24 (4): 399–407. Дои:10.1177/2472630318822476. PMID 30698997. S2CID 73412170.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- ^ Иглхарт Б. (2018). «Платформа автоматизации MVO: удовлетворение неудовлетворенных потребностей клинических лабораторий с помощью микроконтроллеров, 3D-печати и оборудования / программного обеспечения с открытым исходным кодом». SLAS Technol. 23 (5): 423–431. Дои:10.1177/2472630318773693. PMID 29746790. S2CID 13671203.
- ^ Карвалью, Матеус. «Auto-HPGe, автоматический пробоотборник для гамма-спектроскопии с использованием детекторов из высокочистого германия (HPGe) и тяжелых экранов». ОборудованиеX.
- ^ Карвалью, Матеус (2018). "Osmar, автоматический пробоотборник для микрошприцев с открытым исходным кодом". ОборудованиеX. 3: 10–38. Дои:10.1016 / j.ohx.2018.01.001.
- ^ Карвалью, Матеус (2017). Практическая автоматизация лаборатории: стало проще с AutoIt. Wiley VCH. ISBN 978-3-527-34158-0.