WikiDer > Лиссавирус - Википедия

Лиссавирус
	Цветные трансмиссионная электронная микрофотография из Лиссавирус австралийских летучих мышей. Пулеподобные объекты - это вирионы, и некоторые из них отпочковываются из клетки.
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область:	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Негарнавирикота
Учебный класс:	Monjiviricetes
Заказ:	Mononegavirales
Семья:	Rhabdoviridae
Род:	Лиссавирус
Типовой вид
	Лиссавирус бешенства;
Разновидность
	Араванский лиссавирус; Лиссавирус австралийских летучих мышей; Лиссавирус летучих мышей Бокело; Лиссавирус Duvenhage; Европейская летучая мышь 1 лиссавирус; Европейская летучая мышь 2 лиссавирус; Ганнорува лиссавирус летучих мышей; Икома лиссавирус; Иркутский лиссавирус; Худжандский лиссавирус; Лиссавирус летучих мышей Коталахти; Лагосский лиссавирус летучих мышей; Лиссавирус летучих мышей Lleida; Мокола лиссавирус; Лиссавирус бешенства; Лиссавирус летучих мышей Шимони; Лиссавирус тайваньских летучих мышей; Лиссавирус западно-кавказских летучих мышей;

Lyssavirus - Wikipedia

Лиссавирус (от Греческий λύσσα Лисса "ярость, ярость, бешенство" и латинский вирус)^[1]^[2] это род РНК-вирусы в семье Rhabdoviridae, порядок Mononegavirales. Млекопитающие, включая человека, могут служить естественными хозяевами.^[3]^[4] Род Лиссавирус включает вирус бешенства традиционно ассоциируется с эта болезнь.

Таксономия

Род *Лиссавирус*: виды и их вирусы^[5]^[6]
Род	Филогруппа	Разновидность	Вирус (аббревиатура)
Лиссавирус	я	Араванский лиссавирус	Вирус Араван (ARAV)
		Лиссавирус австралийских летучих мышей	Австралийский лиссавирус летучих мышей (ABLV)
		Лиссавирус летучих мышей Бокело	Лиссавирус летучих мышей Бокело (BBLV)
		Лиссавирус Duvenhage	Вирус Duvenhage (DUVV)
		Европейская летучая мышь 1 лиссавирус	Лиссавирус европейских летучих мышей 1 (EBLV-1)
		Европейская летучая мышь 2 лиссавирус	Европейский лиссавирус летучих мышей 2 (EBLV-2)
		Ганнорува лиссавирус летучих мышей	Лиссавирус летучих мышей Ганнорува (GBLV)
		Иркутский лиссавирус	Иркут вирус (ИРКВ)
		Худжандский лиссавирус	Худжандский вирус (KHUV)
		Лиссавирус бешенства*	Вирус бешенства (RABV)
	II	Лагосский лиссавирус летучих мышей	Вирус летучих мышей Лагоса (LBV)
		Мокола лиссавирус	Вирус мокола (МОКВ)
		Лиссавирус летучих мышей Шимони	Вирус летучих мышей Шимони (SHIBV)
	III	Лиссавирус западно-кавказских летучих мышей	Вирус западно-кавказских летучих мышей (WCBV)
	IV	Икома лиссавирус	Икома лиссавирус (IKOV)
	IV	Лиссавирус летучих мышей Lleida	Лиссавирус летучих мышей Lleida (LLEBV)

Легенда таблицы: «*» обозначает типовой вид.

Вирусология

Структура

Лиссавирионы имеют обволакивающую форму с пулевидной формой. Эти вирионы имеют ширину около 75 нм и длину 180 нм.^[3] Лиссавирионы обладают спиральной симметрией, поэтому их инфекционные частицы имеют приблизительно цилиндрическую форму. Это типично для вирусов, поражающих растения. Вирионы вирусов, заражающих человека, чаще имеют кубическую симметрию и принимают форму, приближающуюся к правильные многогранники.

Структура состоит из шипованного внешнего конверт, средняя область, состоящая из матричного белка M, и внутреннего рибонуклеокапсид сложная область, состоящая из генома, связанного с другими белками.

Геном

Лиссавирус геномы состоят из отрицательного смысла, одноцепочечного РНК молекула, кодирующая пять вирусных белков: полимераза L, матрица белок М, фосфопротеин П, нуклеопротеин N и гликопротеин G. Геномы линейны, длиной около 11 килобайт.^[3]

На основании недавних филогенетических данных лиссавирусы были разделены на семь основных разновидность. Кроме того, недавно были обнаружены еще пять видов: вирус летучих мышей Западного Кавказа, вирус Араван, вирус Худжанда, вирус Иркут и вирус летучих мышей Шимони.^[7]^[8] Род лиссавирусов можно разделить на четыре филогруппы на основе гомологии последовательности ДНК. Филогруппа I включает вирусы, такие как вирус бешенства, вирус Duvenhage, лиссавирус европейских летучих мышей типов 1 и 2, австралийский лиссавирус летучих мышей, вирус Худжанда, лиссавирус летучих мышей Бокело, вирус Иркут и вирус Араван. Филогруппа II содержит вирус летучих мышей Лагоса, вирус Мокола и вирус летучих мышей Шимони. Лиссавирус западно-кавказских летучих мышей - единственный вирус, входящий в состав филогруппы III. Лиссавирус Ikoma и лиссавирус летучих мышей Lleida являются примерами филогруппы IV. Лиссавирус западно-кавказских летучих мышей был классифицирован в рамках своей собственной филогруппы, потому что это наиболее дивергентный лиссавирус из всех обнаруженных.^[9]

Род	Структура	Симметрия	Капсид	Геномное расположение	Геномная сегментация
Лиссавирус	Пулевидный		Окутанный	Линейный	Одночастный

Эволюция

Фитогенетические исследования предполагают, что первоначальными хозяевами этих вирусов были летучие мыши.^[10] Большее антигенное разнообразие лиссавирусов из Африка привело к предположению, что Африка была источником этих вирусов. Исследование 153 вирусов, собранных в период с 1956 по 2015 год в различных географических точках, вместо этого предложило Палеарктика происхождение (вероятность 85%) для этих вирусов.^[11] Оценки дат (вероятность 95%) для самого недавнего общего предка были очень широкими - от 3 995 до 166 820 лет до настоящего времени - что предполагает, что в этой области необходимо провести дополнительную работу. Хотя летучие мыши эволюционировали в Палеарктике,^[12] их происхождение предшествовало появлению ляссавирусов на миллионы лет, что свидетельствует против их совместного видообразования. Скорость эволюции гена N в линии передачи Africa 2 оценивается в 3,75 × 10⁻³ замен на сайт в год.^[13] Этот показатель аналогичен показателям других РНК-вирусов.

Жизненный цикл

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Проникновение в хозяйскую клетку достигается прикреплением вирусных G гликопротеинов к рецепторам хозяина, что опосредует клатрин-опосредованный эндоцитоз. Репликация следует модели репликации вируса с отрицательной цепной РНК. Транскрипция вируса с отрицательной цепью РНК с использованием полимеразное заикание, это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина за счет образования почки и движения вируса по канальцам. Дикие млекопитающие, особенно летучие мыши и некоторые плотоядные животные, служат естественными хозяевами. Пути передачи обычно через укушенные раны.^[3]

Род	Детали хоста	Тканевый тропизм	Детали входа	Детали выпуска	Сайт репликации	Сайт сборки	Передача инфекции
Лиссавирус	летучие мыши Crocidura землеройки и некоторые плотоядные животные	Нейроны	Клатрин-опосредованный эндоцитоз	Почкование	Цитоплазма	Цитоплазма	Укушенные раны

Тестирование

По состоянию на 2018 год прямое флуоресцентное антитело (DFA) тест по-прежнему является золотым стандартом для выявления лиссавирусной инфекции. С нового тысячелетия обратная транскрипция ПЦР (RT-PCR) тесты были разработаны для бешенства, но использовались только в качестве подтверждающего теста. ПЦР в реальном времениоснованные на тестах, которые имеют более высокую чувствительность и объективные диагностические пороги и позволяют хранить образцы при комнатной температуре, были многообещающими с 2005 года, но требуют установки ПЦР в реальном времени и квалифицированных специалистов с опытом молекулярной диагностики. В международной оценке единственная TaqMan Анализ LN34 может обнаруживать Lyssavirus с высокой чувствительностью (99,90%) по всему роду и высокой специфичностью (99,68%) по сравнению с тестом DFA. По возможности, он станет основным посмертным диагностическим тестом на бешенство.^[14]

Эпидемиология

Классический бешенство вирус, распространен во всем мире и может переноситься любым теплокровным млекопитающим. У других лиссавирусов гораздо меньшее разнообразие носителей. Только выберите хозяева может нести каждый из этих вирусные виды. Кроме того, эти другие виды характерны только для определенной географической области. Летучие мыши, как известно, животное вектор для всех идентифицированных лиссавирусов, кроме Вирус мокола.^[15]

Смотрите также

Вирус, переносимый летучими мышами

дальнейшее чтение

Байнард, Эшли С.; Hayman, D .; Johnson, N .; McElhinney, L .; Фукс, А. (2011). «Летучие мыши и лиссавирусы». В Джексоне, Алан К. (ред.). Успехи исследований бешенства. Достижения в вирусных исследованиях. 79. Эльзевир. ISBN 978-0-12-387040-7.
Ботвинкин; Полещук, Э. М .; Кузьмин, И. В .; Борисова, Т. И .; Газарян, С.В .; Ягер, П .; Рупрехт, К. Э. (2003). «Новые лиссавирусы, выделенные от летучих мышей в России». Возникающие инфекционные заболевания. 9 (12): 1623–1625. Дои:10.3201 / eid0912.030374. ЧВК 3034350. PMID 14720408.
Араи; Кузьмин, И. В .; Kameoka, Y .; Ботвинкин, А. Д. (2003). "Новый генотип лиссавируса малой мышиноухой летучей мыши (Myotis blythi), Кыргызстан". Возникающие инфекционные заболевания. 9 (3): 333–337. Дои:10.3201 / eid0903.020252. ЧВК 2958534. PMID 12643828.
Всемирная организация здравоохранения (2005 г.). Консультация экспертов ВОЗ по бешенству (PDF). Серия технических отчетов ВОЗ. Женева, Швейцария: Всемирная организация здравоохранения. ISBN 978-92-4-120931-1.

внешняя ссылка

[1] λύσσα. Лидделл, Генри Джордж; Скотт, Роберт; Греко-английский лексикон на Проект Персей.

[2] вирус. Чарльтон Т. Льюис и Чарльз Шорт. Латинский словарь на Проект Персей.

[ViralZone-3] а ^б ^c ^d «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.

[ICTV-4] ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.». Получено 15 июн 2015.

[5] Афонсу, Клаудио Л .; Amarasinghe, Gaya K .; Баньяи, Кристиан; Бао, Иминь; Basler, Christopher F .; Бавари, Сина; Бежерман, Николас; Blasdell, Kim R .; Бриан, Франсуа-Ксавье (1 августа 2016 г.). «Таксономия отряда Mononegavirales: обновление 2016 г.». Архив вирусологии. 161 (8): 2351–2360. Дои:10.1007 / s00705-016-2880-1. ISSN 1432-8798. ЧВК 4947412. PMID 27216929.

[ICTV18-6] "Род: Лиссавирус". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Получено 18 декабря 2018.

[7] Таксономия вирусов: выпуск 2013 г.. ictvonline.org

[8] Кузьмин, И .; Hughes, G .; Ботвинкин, А .; Orciari, L .; Рупрехт, К. (2005). «Филогенетические взаимоотношения вирусов иркутских и западно-кавказских летучих мышей в пределах рода и предложены количественные критерии, основанные на последовательности гена N для определения генотипа лиссавируса». Вирусные исследования. 111 (1): 28–43. Дои:10.1016 / j.virusres.2005.03.008. PMID 15896400.

[9] Gould, Allan R .; Kattenbelt, Jacqueline A .; Гамли, Сара Дж .; Лант, Росс А. (октябрь 2002 г.). «Характеристика австралийского варианта лиссавируса летучих мышей, выделенного из насекомоядных летучих мышей». Вирусные исследования. 89 (1): 1–28. Дои:10.1016 / S0168-1702 (02) 00056-4. PMID 12367747.

[Banyard2011-10] Banyard AC, Hayman D, Johnson N, McElhinney L, Fooks AR (2011). Летучие мыши и лиссавирусы. Adv. Вирус Res. Достижения в вирусных исследованиях. 79. С. 239–89. Дои:10.1016 / B978-0-12-387040-7.00012-3. ISBN 9780123870407. PMID 21601050.

[Hayman2016-11] Hayman, DT; Fooks, AR; Марстон, Д.А.; Гарсия-Р., JC (2016). «Глобальная филогеография лиссавирусов - опровержение гипотезы« Из Африки »». PLoS Negl Trop Dis. 10 (12): e0005266. Дои:10.1371 / journal.pntd.0005266. ЧВК 5231386. PMID 28036390.

[Teeling2005-12] Teeling, EC; Springer, MS; Мэдсен, О; Бейтс, П; О'Брайен, SJ; Мерфи, WJ (2005). «Молекулярная филогения летучих мышей проливает свет на биогеографию и летопись окаменелостей». Наука. 307 (5709): 580–584. Bibcode:2005Наука ... 307..580Т. Дои:10.1126 / science.1105113. PMID 15681385.

[He2017-13] Хэ В, Чжан Х, Чжан И, Ван Р, Лу С, Джи И, Лю Ц, Юань П, Су С (2017). «Ошибка использования кодонов в гене N вируса бешенства». Заразить. Genet. Evol. 54: 458–465. Дои:10.1016 / j.meegid.2017.08.012. PMID 28818621.

[14] Gigante CM, Dettinger L, Powell JW, Seiders M, Condori REC, Griesser R и др.Многосайтовая оценка анализа RT-PCR в реальном времени панлиссавируса LN34 для посмертной диагностики бешенства PLoS ONE 13 (5): e0197074. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0197074

[15] Составление карты Рабнета ВОЗ / CDC (2008 г.). «Бешенство, страны или регионы риска». Всемирная организация здоровья. Архивировано из оригинал 9 октября 2010 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

Navigation