WikiDer > MHETase

MHETase
MHETase
MHETase tape diagram.png
Схема ленты MHETase (PDB: 6QGA). Домен гидролазы показан коричневым цветом, включая каталитические остатки пурпурным. Крышка показана синим цветом. Аналог субстрата моногидроксиэтилтерфталамид показан зеленым цветом.
Идентификаторы
Номер ЕС3.1.1.102
Альт. именаMHET гидролаза, моногидроксиэтил терефталат гидролаза
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum

В Фермент MHETase это гидролаза, который был обнаружен в 2016 году. Раскалывает Моно- (2-гидроксиэтил) терефталевая кислота, продукт разложения ПЭТ ПЭТаза, к этиленгликоль и терефталевая кислота.[1] Эта пара ферментов, ПЭТаза и МНЕТаза, позволяет бактерии Ideonella sakaiensis жить за счет пластикового ПЭТ в качестве единственного источника углерода.

Химическая реакция

Первый фермент пути деградации ПЭТ, ПЭТаза, раскалывает этот пластик на промежуточные соединения MHET (Моно- (2-гидроксиэтил) терефталевая кислота) и незначительные суммы BHET (Бис- (2-гидроксиэтил) терефталевая кислота). MHETase гидролизует сложноэфирную связь MHET, образуя терефталевая кислота и этиленгликоль.

Ферментативная деградация ПЭТ под действием ПЭТазы и MHETase

Помимо природного субстрата MHET, также хорошо гидролизуется хромогенный субстрат MpNPT, моно-п-нитрофенилтерефталат. Это можно использовать для измерения ферментативной активности и определения кинетических параметров. Эфиры ферулата и галлата, субстраты ближайших родственников семейства танназ, не превращаются. п-Нитрофениловый эфир алифатических монокарбоновых кислот, такой как широко используемый субстрат эстеразы п-нитрофенилацетат, также не гидролизуется.

Структура

Структура MHETase была решена в 2019 году.[2] Он показывает общую складку суперсемейство альфа / бета гидролаз. Согласно классификации в базе данных ESTHER, MHETase принадлежит к семейству танназы в блоке X.[3] Это семейство в основном содержит танназы и ферулоилэстеразы. Фермент состоит из двух доменов: домен гидролазы содержит каталитические остатки Ser225, His528 и Asp492; домен крышки составляет большую часть остатков сайта связывания субстрата.

MHETA связывается с MHETase. Короткие расстояния между негидролизуемым лигандом MHETA (моногидроксиэтилтерефталамид зеленого цвета) и каталитическими остатками Ser225, His528 и Asp492 (часть домена гидролазы коричневого цвета) или остатками связывания лиганда (часть домена крышки синего цвета) показаны как пунктирные линии. PDB: 6QGC

внешняя ссылка

Рекомендации

  1. ^ Йошида С., Хирага К., Такехана Т., Танигучи И., Ямаджи Х., Маэда Ю. и др. (Март 2016 г.). «Бактерия, которая разлагает и ассимилирует поли (этилентерефталат)». Наука. 351 (6278): 1196–9. Дои:10.1126 / science.aad6359. PMID 26965627.
  2. ^ Palm GJ, Reisky L, Böttcher D, Müller H, Michels EA, Walczak MC и др. (Апрель 2019 г.). «Структура разлагающей пластики MHETазы Ideonella sakaiensis, связанной с субстратом». Nature Communications. 10 (1): 1717. Дои:10.1038 / s41467-019-09326-3. ЧВК 6461665. PMID 30979881.
  3. ^ Renault L, Nègre V, Hotelier T, Cousin X, Marchot P, Chatonnet A (декабрь 2005 г.). «Новые удобные инструменты для пользователей ESTHER, базы данных альфа / бета-гидролазного суперсемейства белков». Химико-биологические взаимодействия. 157-158: 339–43. Дои:10.1016 / j.cbi.2005.10.100. PMID 16297901.