WikiDer > MeRIPseq

MeRIPseq

MeRIPseq [1] означает метилированный Иммунопреципитация РНК секвенирование, которое является методом обнаружения посттранскрипционных РНК модификации. Его также называют m6A-seq.[2]

Вариант метода MerIP-seq был изобретен Бенджамином Делатте и его коллегами в 2016 году. Этот вариант, называемый hMerIP-seq (иммунопреципитация гидроксиметилцитозиновой РНК), использует антитело, которое специфически распознает 5-гидроксиметилцитозин, модифицированное основание РНК, влияющее на in vitro перевод и развитие мозга у дрозофилы.[3]

Рекомендации

  1. ^ Мейер, Кейт Д .; Салюторе, Йогеш; Зумбо, Пол; Элементо, Оливье; Мейсон, Кристофер Э .; Джеффри, Сэми Р. (31 мая 2012 г.). «Комплексный анализ метилирования мРНК выявляет обогащение в 3 'UTRs и около стоп-кодонов». Клетка. 149 (7): 1635–1646. Дои:10.1016 / j.cell.2012.05.003. ЧВК 3383396. PMID 22608085.
  2. ^ Dominissini, Dan; Мошич-Мошковиц, Шарон; Шварц, Шрага; Лосось-Дивон, Мали; Унгар, Лиор; Осенберг, Сиван; Чесаркас, Карен; Якоб-Хирш, Жасмин; Амариглио, Нинетта; Купец, Мартин; Сорек, Ротем; Рехави, Гидеон (28 апреля 2012 г.). «Топология метиломов РНК m6A человека и мыши, выявленная с помощью m6A-seq». Природа. 485 (7397): 201–206. Bibcode:2012Натура.485..201Д. Дои:10.1038 / природа11112. PMID 22575960. S2CID 3517716.
  3. ^ Делат, Бенджамин (2016). «Распределение и функция РНК гидроксиметилцитозина по всему транскриптому». Наука. 351 (6270): 282–285. Bibcode:2016Научный ... 351..282D. Дои:10.1126 / science.aac5253. PMID 26816380.