WikiDer > Посланник РНК
В молекулярная биология, информационная РНК (мРНК) является одноцепочечным молекула из РНК что соответствует генетическая последовательность из ген, и читается рибосома в процессе синтезирующий а белок.
В течение транскрипция, РНК-полимераза делает копию гена из ДНК к мРНК по мере необходимости. Этот процесс немного отличается от эукариоты и прокариоты, включая то, что прокариотическая РНК-полимераза связывается с ферментами, обрабатывающими ДНК во время транскрипции, так что процессинг может происходить во время транскрипции. Следовательно, это приводит к тому, что новая цепь мРНК становится двухцепочечный путем создания дополнительной нити, известной как тРНК прядь. Кроме того, РНК не может образовывать структуры в результате спаривания оснований. Более того, матрицей для мРНК является комплементарная цепь тРНК, которая идентична по последовательности антикодоновой последовательности, с которой связывается ДНК. Недолговечный, необработанный или частично переработанный продукт называется предшественник мРНК, или же пре-мРНК; после полной обработки он называется зрелая мРНК.
мРНК создается в процессе транскрипция, где фермент (РНК-полимераза) превращает ген в первичная стенограмма мРНК (также известная как пре-мРНК). Эта пре-мРНК обычно все еще содержит интроны, регионы, которые не будут кодировать в финале аминокислотная последовательность. Они удаляются в процессе Сплайсинг РНК, оставив только экзоны, регионы, которые будут кодировать белок. Эта последовательность экзона составляет зрелая мРНК. Затем зрелая мРНК считывается рибосомой и, используя аминокислоты принесенный переносить РНК (тРНК) рибосома создает белок. Этот процесс известен как перевод. Все эти процессы являются частью центральная догма молекулярной биологии, который описывает поток генетической информации в биологической системе.
Как в ДНК, генетическая информация в мРНК содержится в последовательности нуклеотиды, которые сгруппированы в кодоны состоящий из трех рибонуклеотиды каждый. Каждый кодон кодирует определенный аминокислота, кроме стоп-кодоны, которые прекращают синтез белка. Для трансляции кодонов в аминокислоты требуются два других типа РНК: транспортная РНК, которая распознает кодон и предоставляет соответствующую аминокислоту, и рибосомная РНК (рРНК), центральный компонент механизма производства белков рибосом.
О существовании мРНК впервые предположили Жак Моно и Франсуа Жакоб, и впоследствии был обнаружен Джейкобом, Сидней Бреннер и Мэтью Мезельсон на Калифорнийский технологический институт в 1961 г.[1]
Синтез, обработка и функция
Кратковременное существование молекулы мРНК начинается с транскрипции и в конечном итоге заканчивается деградацией. В течение своей жизни молекула мРНК также может обрабатываться, редактироваться и транспортироваться перед трансляцией. Молекулы мРНК эукариот часто требуют обширной обработки и транспорта, тогда как прокариотический Молекулы мРНК этого не делают. Молекула эукариотический мРНК и окружающие ее белки вместе называются посыльный РНП.
Транскрипция
Транскрипция - это когда РНК создается из ДНК. Во время транскрипции РНК-полимераза делает копию гена из ДНК в мРНК по мере необходимости. Этот процесс немного отличается у эукариот и прокариот. Однако одно заметное отличие состоит в том, что прокариотическая РНК-полимераза связывается с ферментами процессинга ДНК во время транскрипции, так что процессинг может происходить во время транскрипции. Следовательно, это приводит к тому, что новая цепь мРНК становится двухцепочечной за счет образования комплементарной цепи, известной как цепь тРНК, которая при объединении не может образовывать структуры из спаривания оснований. Более того, матрицей для мРНК является комплементарная цепь тРНК, которая идентична по последовательности антикодоновой последовательности, с которой связывается ДНК. Недолговечный, необработанный или частично переработанный продукт называется предшественник мРНК, или же пре-мРНК; после полной обработки он называется зрелая мРНК.
Обработка пре-мРНК эукариот
Обработка мРНК сильно различается между эукариоты, бактерии, и археи. Неэукариотическая мРНК, по сути, созревает после транскрипции и не требует обработки, за исключением редких случаев.[2] Однако эукариотическая пре-мРНК требует нескольких этапов обработки, прежде чем она будет доставлена в цитоплазму и ее трансляция рибосомой.
Сращивание
Обширный процессинг пре-мРНК эукариот, который приводит к зрелой мРНК, является основным Сплайсинг РНК, механизм, с помощью которого интроны или же Outrons (некодирующие области) удаляются и экзоны (кодирующие области) соединяются вместе.
Добавление крышки 5 футов
А Крышка 5 футов (также называемый кэпом РНК, РНК 7-метилгуанозин cap, или РНК m7G cap) представляет собой модифицированный гуаниновый нуклеотид, который был добавлен на «лицевую» или 5 'конец эукариотической матричной РНК вскоре после начала транскрипции. 5'-кэп состоит из концевого остатка 7-метилгуанозина, который связан через 5'-5'-трифосфатную связь с первым транскрибированным нуклеотидом. Его наличие имеет решающее значение для признания рибосома и защита от РНКазы.
Добавление кэпа связано с транскрипцией и происходит совместно с транскрипцией, так что одно влияет на другое. Вскоре после начала транскрипции 5'-конец синтезируемой мРНК связывается синтезирующим кэп комплексом, связанным с РНК-полимераза. Этот ферментативный сложный катализирует химические реакции, необходимые для кэппинга мРНК. Синтез протекает как многоступенчатый биохимический реакция.
Редактирование
В некоторых случаях мРНК будет отредактировал, изменяя нуклеотидный состав этой мРНК. Примером у людей является аполипопротеин B мРНК, которая редактируется в одних тканях, но не в других. Редактирование создает ранний стоп-кодон, который после трансляции дает более короткий белок.
Полиаденилирование
Полиаденилирование - это ковалентное связывание полиаденилильного фрагмента с молекулой информационной РНК. В эукариотических организмах большинство молекул матричной РНК (мРНК) полиаденилировано на 3'-конце, но недавние исследования показали, что короткие участки уридина (олигоуридилирование) также обычны.[3] В поли (А) хвост и связанный с ним белок помогает защитить мРНК от разрушения экзонуклеазами. Полиаденилирование также важно для терминации транскрипции, экспорта мРНК из ядра и трансляции. мРНК также может быть полиаденилирована в прокариотических организмах, где поли (А) хвосты действуют скорее для облегчения, чем препятствия экзонуклеолитической деградации.
Полиаденилирование происходит во время и / или сразу после транскрипции ДНК в РНК. После завершения транскрипции цепь мРНК расщепляется под действием эндонуклеазного комплекса, связанного с РНК-полимеразой. После расщепления мРНК около 250 остатков аденозина добавляются к свободному 3'-концу в сайте расщепления. Эта реакция катализируется полиаденилат-полимеразой. Как и в альтернативное сращивание, может быть более одного варианта полиаденилирования мРНК.
Встречаются также мутации сайта полиаденилирования. Первичный транскрипт РНК гена расщепляется по сайту присоединения поли-А, и к 3’-концу РНК добавляются 100-200 A. Если этот сайт будет изменен, будет сформирована аномально длинная и нестабильная конструкция мРНК.
Транспорт
Еще одно различие между эукариотами и прокариотами - транспорт мРНК. Поскольку транскрипция и трансляция эукариот разделены по компартментам, мРНК эукариот должны быть экспортированы из ядро к цитоплазма- процесс, который может регулироваться разными сигнальными путями.[4] Зрелые мРНК распознаются по их процессированным модификациям и затем экспортируются через ядерная пора путем связывания с кэп-связывающими белками CBP20 и CBP80,[5] а также комплекс транскрипции / экспорта (TREX).[6][7] У эукариот идентифицированы множественные пути экспорта мРНК.[8]
В пространственно сложных клетках некоторые мРНК транспортируются в определенные субклеточные пункты назначения. В зрелом нейроны, определенные мРНК транспортируются из сома к дендриты. Один сайт трансляции мРНК находится в полирибосомах, избирательно локализованных под синапсами.[9] МРНК для Arc / Arg3.1 индуцируется синаптической активностью и селективно локализуется вблизи активных синапсов на основе сигналов, генерируемых рецепторами NMDA.[10] Другие мРНК также перемещаются в дендриты в ответ на внешние стимулы, такие как мРНК β-актина.[11] При экспорте из ядра мРНК актина связывается с ZBP1 и субъединица 40S. Комплекс связывается моторным белком и транспортируется к месту назначения (расширение нейрита) вдоль цитоскелета. В конечном итоге ZBP1 фосфорилируется с помощью Src, чтобы инициировать трансляцию.[12] В развивающихся нейронах мРНК также транспортируются в растущие аксоны и особенно в конусы роста. Многие мРНК помечены так называемыми «почтовыми индексами», которые нацелены на их транспортировку в определенное место.[13]
Перевод
Поскольку прокариотическая мРНК не нуждается в процессинге или транспортировке, трансляция осуществляется рибосома может начаться сразу после окончания транскрипции. Следовательно, можно сказать, что прокариотический перевод соединенный к транскрипции и происходит транскрипционно.
Эукариотическая мРНК, которая была обработана и транспортирована в цитоплазму (т.е. зрелая мРНК), затем может транслироваться рибосомой. Перевод может происходить в рибосомы свободно плавающие в цитоплазме или направленные к эндоплазматический ретикулум посредством частица распознавания сигнала. Следовательно, в отличие от прокариот, эукариотический перевод не является непосредственно связано с транскрипцией.[14] В некоторых случаях возможно даже, что снижение уровней мРНК сопровождается повышенными уровнями белка, как это наблюдалось для уровней мРНК / белка EEF1A1 при раке груди.[15]
Структура
Кодирующие регионы
Кодирующие области состоят из кодоны, которые расшифровываются и транслируются в белки рибосомой; у эукариот обычно на одну, а у прокариот обычно на несколько. Кодирующие области начинаются с стартовый кодон и закончить стоп-кодон. В общем, стартовый кодон представляет собой триплет AUG, а стоп-кодон - UAG («янтарь»), UAA («охра») или UGA («опал»). Кодирующие области обычно стабилизируются внутренними парами оснований, что препятствует деградации.[16][17] Помимо того, что они кодируют белок, части кодирующих областей могут служить регуляторными последовательностями в пре-мРНК в качестве энхансеры экзонного сплайсинга или же глушители для экзонной сварки.
Непереведенные регионы
Нетранслируемые области (UTR) - это участки мРНК перед стартовым кодоном и после стоп-кодона, которые не транслируются, называемые пять основных непереведенных регионов (5 'UTR) и три основных непереведенных региона (3 'UTR) соответственно. Эти области транскрибируются с кодирующей областью и, таким образом, являются экзонный поскольку они присутствуют в зрелой мРНК. Нетранслируемым областям приписывается несколько ролей в экспрессии генов, включая стабильность мРНК, локализацию мРНК и переводческая эффективность. Способность UTR выполнять эти функции зависит от последовательности UTR и может различаться между мРНК. Генетические варианты в 3 'UTR также участвуют в восприимчивости к болезням из-за изменения структуры РНК и трансляции белка.[18]
Стабильность мРНК может контролироваться с помощью 5 'UTR и / или 3' UTR из-за различного сродства к ферментам, разрушающим РНК, называемым рибонуклеазы и для вспомогательных белков, которые могут способствовать или ингибировать деградацию РНК. (Смотрите также, Элемент стабильности C-rich.)
Эффективность трансляции, включая иногда полное запрещение трансляции, можно контролировать с помощью UTR. Белки, которые связываются с 3 'или 5' UTR, могут влиять на трансляцию, влияя на способность рибосомы связываться с мРНК. МикроРНК привязанный к 3 'UTR также может влиять на эффективность трансляции или стабильность мРНК.
Считается, что цитоплазматическая локализация мРНК является функцией 3 'UTR. Белки, которые необходимы в определенной области клетки, также могут транслироваться туда; в таком случае 3'-UTR может содержать последовательности, которые позволяют локализовать транскрипт в этой области для трансляции.
Некоторые элементы, содержащиеся в непереведенных областях, образуют характерный вторичная структура при транскрибировании в РНК. Эти структурные элементы мРНК участвуют в регуляции мРНК. Некоторые, например Элемент SECIS, являются мишенями для связывания белков. Один класс элементов мРНК, рибопереключатели, напрямую связывают небольшие молекулы, изменяя их складку, чтобы изменить уровни транскрипции или трансляции. В этих случаях мРНК регулируется сама.
Поли (А) хвост
3 'поли (А) хвост представляет собой длинную последовательность аденин нуклеотидов (часто несколько сотен), добавленных к 3 'конец пре-мРНК. Этот хвост способствует экспорту из ядра и трансляции и защищает мРНК от деградации.
Моноцистронная мРНК против полицистронной
Молекула мРНК называется моноцистронной, если она содержит генетическую информацию для переведите только один белок цепь (полипептид). Так обстоит дело с большинством эукариотический мРНК.[19][20] С другой стороны, полицистронная мРНК несет несколько открытые рамки для чтения (ORF), каждая из которых транслируется в полипептид. Эти полипептиды обычно имеют родственную функцию (они часто являются субъединицами, составляющими конечный комплексный белок), и их кодирующая последовательность сгруппирована и регулируется вместе в регуляторной области, содержащей промоутер и оператор. Большая часть мРНК обнаружена в бактерии и археи полицистронный,[19] как и митохондриальный геном человека.[21] Дицистронная или бицистронная мРНК кодирует только два белки.
циркуляризация мРНК
У эукариот молекулы мРНК образуют кольцевые структуры из-за взаимодействия между eIF4E и поли (A) -связывающий белок, которые оба связаны с eIF4G, образуя мостик мРНК-белок-мРНК.[22] Считается, что циркуляризация способствует циклированию рибосом на мРНК, что приводит к эффективной по времени трансляции, а также может обеспечивать транслирование только интактной мРНК (для частично деградированной мРНК характерно отсутствие кэпа m7G или поли-А-хвоста).[23]
Существуют и другие механизмы циркуляризации, особенно в мРНК вируса. Полиовирус мРНК использует участок клеверного листа ближе к 5'-концу для связывания PCBP2, который связывает поли (A) -связывающий белок, образуя знакомый круг мРНК-белок-мРНК. Вирус желтого карлика ячменя имеет связывание между сегментами мРНК на 5'-конце и 3'-конце (так называемые петли «целующихся стволов»), что делает мРНК кольцевой без участия каких-либо белков.
Геномы РНК-вирусов (+ цепи которых транслируются как мРНК) также обычно подвергаются циркуляризации.[нужна цитата] Во время репликации генома циркуляризация увеличивает скорость репликации генома, циклически повторяя вирусную РНК-зависимую РНК-полимеразу так же, как предполагается, что рибосома циклизуется.
Деградация
Различные мРНК в одной и той же клетке имеют разное время жизни (стабильность). В бактериальных клетках отдельные мРНК могут выжить от секунд до более часа. Однако время жизни в среднем составляет от 1 до 3 минут, что делает бактериальную мРНК гораздо менее стабильной, чем мРНК эукариот.[24] В клетках млекопитающих время жизни мРНК колеблется от нескольких минут до дней.[25] Чем выше стабильность мРНК, тем больше белка может быть произведено из этой мРНК. Ограниченное время жизни мРНК позволяет клетке быстро изменять синтез белка в ответ на меняющиеся потребности. Существует множество механизмов, которые приводят к разрушению мРНК, некоторые из которых описаны ниже.
Прокариотическая деградация мРНК
В целом у прокариот время жизни мРНК намного короче, чем у эукариот. Прокариоты разрушают сообщения с помощью комбинации рибонуклеаз, включая эндонуклеазы, 3'-экзонуклеазы и 5'-экзонуклеазы. В некоторых случаях, небольшие молекулы РНК (мРНК) длиной от десятков до сотен нуклеотидов может стимулировать деградацию специфических мРНК за счет спаривания оснований с комплементарными последовательностями и облегчения расщепления рибонуклеазой за счет РНКаза III. Недавно было показано, что бактерии также обладают своего рода Крышка 5 футов состоящий из трифосфата на 5 'конец.[26] Удаление двух фосфатов оставляет 5'-монофосфат, в результате чего сообщение разрушается экзонуклеазой РНКазой J, которая разлагается с 5 'до 3'.
Оборот мРНК эукариот
Внутри эукариотических клеток существует баланс между процессами перевод и распад мРНК. Сообщения, которые активно переводятся, связаны рибосомы, то факторы инициации эукариот eIF-4E и eIF-4G, и поли (A) -связывающий белок. eIF-4E и eIF-4G блокируют расщепляющий фермент (DCP2), а поли (А) -связывающий белок блокирует экзосомальный комплекс, защищая концы сообщения. Баланс между трансляцией и распадом отражается в размере и количестве цитоплазматических структур, известных как П-тела[27] В поли (А) хвост мРНК укорачивается специализированными экзонуклеазами, которые нацелены на специфические информационные РНК посредством комбинации цис-регуляторных последовательностей на РНК и транс-действующих РНК-связывающих белков. Считается, что удаление поли (A) хвоста нарушает круговую структуру сообщения и дестабилизирует комплекс связывания крышки. В этом случае сообщение может ухудшиться либо экзосомальный комплекс или комплекс для снятия крышки. Таким образом, трансляционно неактивные сообщения могут быть быстро уничтожены, в то время как активные сообщения остаются нетронутыми. Механизм остановки трансляции и передачи сообщения комплексам распада в деталях не изучен.
Распад AU-богатых элементов
Наличие Элементы с высоким содержанием Австралии в некоторых мРНК млекопитающих имеет тенденцию дестабилизировать эти транскрипты за счет действия клеточных белков, которые связывают эти последовательности и стимулируют поли (А) удаление хвоста. Считается, что потеря поли (А) хвоста способствует деградации мРНК, облегчая атаку как экзосомальный комплекс[28] и комплекс для снятия крышки.[29] Быстрая деградация мРНК через Элементы с высоким содержанием Австралии является критическим механизмом для предотвращения перепроизводства мощных цитокинов, таких как фактор некроза опухоли (TNF) и фактор, стимулирующий колонии гранулоцитов-макрофагов (GM-CSF).[30] Богатые AU элементы также регулируют биосинтез протоонкогенных факторов транскрипции, таких как с-июн и c-Fos.[31]
Нонсенс-опосредованный распад
Эукариотические сообщения подлежат наблюдению со стороны бессмысленный распад (NMD), который проверяет наличие преждевременных стоп-кодонов (бессмысленных кодонов) в сообщении. Они могут возникнуть из-за неполного сращивания, V (D) J рекомбинация в адаптивная иммунная система, мутации в ДНК, ошибки транскрипции, негерметичное сканирование рибосомой, вызывающей сдвиг кадра, и другие причины. Обнаружение преждевременного стоп-кодона запускает деградацию мРНК с помощью 5 'декапирования, 3' поли (А) удаление хвоста, или эндонуклеолитическое расщепление.[32]
Малая интерферирующая РНК (миРНК)
В многоклеточные животные, малые интерферирующие РНК (миРНК) обрабатываются Дайсер включены в комплекс, известный как РНК-индуцированный комплекс сайленсинга или RISC. Этот комплекс содержит эндонуклеаза это расщепляет идеально комплементарные сообщения, с которыми связывается миРНК. Полученные фрагменты мРНК затем разрушаются экзонуклеазы. siRNA обычно используется в лабораториях для блокировки функции генов в культуре клеток. Считается, что он является частью врожденной иммунной системы и служит защитой от вирусов с двухцепочечной РНК.[33]
МикроРНК (miRNA)
МикроРНК (миРНК) представляют собой небольшие РНК, которые обычно частично комплементарны последовательностям информационных РНК многоклеточных животных.[34] Связывание miRNA с сообщением может подавлять трансляцию этого сообщения и ускорять удаление поли (A) хвоста, тем самым ускоряя деградацию мРНК. Механизм действия миРНК является предметом активных исследований.[35]
Другие механизмы распада
Есть и другие способы ухудшения качества сообщений, в том числе безостановочный распад и заглушить Piwi-взаимодействующая РНК (пиРНК) среди других.
терапия на основе мРНК
Полноразмерные молекулы мРНК предлагались в качестве терапевтических средств с самого начала биотехнологической эры, но до 2010-х гг. Moderna Therapeutics была основана и за первые три года сумела привлечь почти миллиард долларов венчурного финансирования.[36][37][38][39]
Теоретически введенная последовательность мРНК может заставить клетку вырабатывать белок, который, в свою очередь, может непосредственно лечить болезнь или функционировать как вакцина; более косвенно белок может управлять эндогенными стволовая клетка различать желаемым образом.[40][41]
Основные задачи РНК-терапии заключаются в доставке РНК в определенные клетки, а не в определении того, какую последовательность доставить.[37] Последовательности "голой" РНК после приготовления естественно разлагаться; они могут вызвать иммунная система атаковать их как захватчиков; и они являются непроницаемый к клеточная мембрана.[41] Оказавшись внутри клетки, они должны покинуть транспортный механизм клетки, чтобы начать действовать внутри клетки. цитоплазма, в котором находится рибосомы это прямое производство белки.[40]
Смотрите также
- GeneCalling, технология профилирования мРНК
- Миссенс мРНК
- отображение мРНК
- мРНК наблюдение
- Транскриптом, сумма всех РНК в клетке
Рекомендации
- ^ Кобб, Мэтью (29 июня 2015 г.). "Кто открыл информационную РНК?". Текущая биология. 25 (13): R526 – R532. Дои:10.1016 / j.cub.2015.05.032. PMID 26126273. Получено 2 июля 2020.
- ^ Уотсон, Джеймс Д. (22 февраля 2013 г.). Молекулярная биология гена, 7-е издание. Pearson Higher Ed USA. ISBN 9780321851499.
- ^ Choi et al. РНК. 2012. 18: 394–401.
- ^ Куарежма А.Дж., Сиверт Р., Никерсон Дж. А. (апрель 2013 г.). «Регулирование экспорта мРНК с помощью пути передачи сигнала киназы PI3 / AKT». Молекулярная биология клетки. 24 (8): 1208–1221. Дои:10.1091 / mbc.E12-06-0450. ЧВК 3623641. PMID 23427269.
- ^ Kierzkowski D, Kmieciak M, Piontek P, Wojtaszek P, Szweykowska-Kulinska Z, Jarmolowski A (сентябрь 2009 г.). «CBP20 Arabidopsis нацелен на связывающий кепку комплекс с ядром и стабилизируется CBP80». Журнал растений. 59 (5): 814–825. Дои:10.1111 / j.1365-313X.2009.03915.x. PMID 19453442.
- ^ Стрэссер К., Масуда С., Мейсон П., Пфаннштиль Дж., Оппицци М., Родригес-Наварро С., Рондон А.Г., Агилера А., Штруль К., Рид Р., Hurt E (май 2002 г.). «TREX - это консервативный комплекс, связывающий транскрипцию с экспортом информационной РНК». Природа. 417 (6886): 304–308. Bibcode:2002Натура.417..304С. Дои:10.1038 / природа746. PMID 11979277. S2CID 1112194.
- ^ Катахира Дж., Йонеда Й. (27 октября 2014 г.). «Роли комплекса TREX в ядерном экспорте мРНК». РНК Биология. 6 (2): 149–152. Дои:10.4161 / rna.6.2.8046. PMID 19229134.
- ^ Ченик С., Чуа Х.Н., Чжан Х., Тарнавски С.П., Акеф А., Дерти А., Тасан М., Мур М.Дж., Палаццо А.Ф., Рот ФП (апрель 2011 г.). «Геномный анализ показывает взаимодействие между интронами 5'UTR и ядерным экспортом мРНК для секреторных и митохондриальных генов». PLOS Genetics. 7 (4): e1001366. Дои:10.1371 / journal.pgen.1001366. ЧВК 3077370. PMID 21533221.
- ^ Стюард О., Леви В. Б. (март 1982 г.). «Преимущественная локализация полирибосом под основанием дендритных шипов в гранулярных клетках зубчатой извилины». Журнал неврологии. 2 (3): 284–291. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.02-03-00284.1982. ЧВК 6564334. PMID 7062109.
- ^ Стюард О., Уорли П.Ф. (апрель 2001 г.). «Селективное нацеливание вновь синтезированной мРНК Arc на активные синапсы требует активации рецептора NMDA». Нейрон. 30 (1): 227–240. Дои:10.1016 / s0896-6273 (01) 00275-6. PMID 11343657. S2CID 13395819.
- ^ Работа C, Eberwine J (декабрь 2001 г.). «Локализация и трансляция мРНК в дендритах и аксонах». Обзоры природы. Неврология. 2 (12): 889–898. Дои:10.1038/35104069. PMID 11733796. S2CID 5275219.
- ^ Пространственная регуляция жирной трансляции бета-актина посредством Src-зависимого фосфорилирования ZBP1 Природа04115.
- ^ Эйнгер К., Авосса Д., Диана А.С., Барри С., Барбарезе Е., Карсон Дж. Х. (сентябрь 1997 г.). «Транспорт и элементы локализации в мРНК основного белка миелина». Журнал клеточной биологии. 138 (5): 1077–1087. Дои:10.1083 / jcb.138.5.1077. ЧВК 2136761. PMID 9281585.
- ^ Сомали
- ^ Лин CY, Beattie A, Baradaran B, Dray E, Duijf PH (сентябрь 2018 г.). «Противоречивая мРНК и неправильная экспрессия белка EEF1A1 в протоковой карциноме молочной железы из-за регуляции клеточного цикла и клеточного стресса». Научные отчеты. 8 (1): 13904. Bibcode:2018НатСР ... 813904Л. Дои:10.1038 / с41598-018-32272-х. ЧВК 6141510. PMID 30224719.
- ^ Шабалина С.А., Огурцов А.Ю., Спиридонов Н.А. (2006). «Периодический паттерн вторичной структуры мРНК, созданный генетическим кодом». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (8): 2428–2437. Дои:10.1093 / nar / gkl287. ЧВК 1458515. PMID 16682450.
- ^ Katz L, Burge CB (сентябрь 2003 г.). «Широко распространенный отбор на локальную вторичную структуру РНК в кодирующих областях бактериальных генов». Геномные исследования. 13 (9): 2042–2051. Дои:10.1101 / гр.1257503. ЧВК 403678. PMID 12952875.
- ^ Лу Ю.Ф., Маугер Д.М., Гольдштейн Д.Б., Городской Т.Дж., Недели КМ, Брэдрик С.С. (ноябрь 2015 г.). «Структура мРНК IFNL3 реконструирована функциональным некодирующим полиморфизмом, связанным с клиренсом вируса гепатита C». Научные отчеты. 5: 16037. Bibcode:2015НатСР ... 516037Л. Дои:10.1038 / srep16037. ЧВК 4631997. PMID 26531896.
- ^ а б Козак М. (март 1983 г.). «Сравнение инициирования синтеза белка в прокариотах, эукариотах и органеллах». Микробиологические обзоры. 47 (1): 1–45. Дои:10.1128 / MMBR.47.1.1-45.1983. ЧВК 281560. PMID 6343825.
- ^ Нирс С., Поллет Н. (декабрь 1999 г.). «Группы синэкспрессии у эукариот». Природа. 402 (6761): 483–487. Bibcode:1999Натура 402..483Н. Дои:10.1038/990025. PMID 10591207. S2CID 4349134.
- ^ Мерсер Т.Р., Неф С., Динджер М.Э., Кроуфорд Дж., Смит М.А., Ширвуд А.М., Хауген Э., Бракен С.П., Рэкхэм О, Стаматояннопулос Ж.А., Филиповская А., Маттик Дж. С. (август 2011 г.). «Митохондриальный транскриптом человека». Клетка. 146 (4): 645–658. Дои:10.1016 / j.cell.2011.06.051. ЧВК 3160626. PMID 21854988.
- ^ Wells SE, Hillner PE, Vale RD, Sachs AB (июль 1998 г.). «Циркуляризация мРНК эукариотическими факторами инициации трансляции» (ш). Молекулярная клетка. 2 (1): 135–140. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80122-7. PMID 9702200.
- ^ Лопес-Ластра М., Ривас А., Баррия М.И. (2005). «Синтез белка в эукариотах: растущая биологическая значимость кэп-независимой инициации трансляции». Биологические исследования. 38 (2–3): 121–146. Дои:10.4067 / S0716-97602005000200003. PMID 16238092.
- ^ Гены Левина X. Левин, Бенджамин., Кребс, Джоселин Э., Килпатрик, Стивен Т., Голдштейн, Эллиот С., Левин, Бенджамин. (10-е изд.). Садбери, штат Массачусетс: Джонс и Бартлетт. 2011 г. ISBN 9780763766320. OCLC 456641931.CS1 maint: другие (связь)
- ^ Ю. Дж., Рассел Дж. Э. (сентябрь 2001 г.). «Структурный и функциональный анализ комплекса мРНП, который обеспечивает высокую стабильность мРНК человеческого бета-глобина». Молекулярная и клеточная биология. 21 (17): 5879–5888. Дои:10.1128 / mcb.21.17.5879-5888.2001. ЧВК 87307. PMID 11486027.
- ^ Деана А., Селесник Х, Беласко Дж. Г. (январь 2008 г.). «Бактериальный фермент RppH запускает деградацию информационной РНК за счет удаления 5 'пирофосфата». Природа. 451 (7176): 355–358. Bibcode:2008Натура.451..355D. Дои:10.1038 / природа06475. PMID 18202662. S2CID 4321451.
- ^ Паркер Р., Шет У. (март 2007 г.). «P-тельца и контроль трансляции и деградации мРНК». Молекулярная клетка. 25 (5): 635–646. Дои:10.1016 / j.molcel.2007.02.011. PMID 17349952.
- ^ Chen CY, Gherzi R, Ong SE, Chan EL, Raijmakers R, Pruijn GJ, Stoecklin G, Moroni C, Mann M, Karin M (ноябрь 2001 г.). «Связывающие белки AU рекрутируют экзосому для разрушения мРНК, содержащих ARE». Клетка. 107 (4): 451–464. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID 11719186. S2CID 14817671. Архивировано из оригинал на 2011-09-17. Получено 2009-02-01.
- ^ Fenger-Grøn M, Fillman C, Norrild B, Lykke-Andersen J (декабрь 2005 г.). «Множественные процессинговые факторы организма и ARE-связывающий белок TTP активируют декапирование мРНК» (PDF). Молекулярная клетка. 20 (6): 905–915. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.10.031. PMID 16364915. Архивировано из оригинал (PDF) на 2011-06-06.
- ^ Шоу Г., Камен Р. (август 1986 г.). «Консервативная последовательность AU из 3'-нетранслируемой области мРНК GM-CSF опосредует селективную деградацию мРНК». Клетка. 46 (5): 659–667. Дои:10.1016/0092-8674(86)90341-7. PMID 3488815. S2CID 40332253.
- ^ Chen CY, Shyu AB (ноябрь 1995 г.). «Богатые AU элементы: характеристика и важность в деградации мРНК». Тенденции в биохимических науках. 20 (11): 465–470. Дои:10.1016 / S0968-0004 (00) 89102-1. PMID 8578590.
- ^ Искен О., Макват Л.Е. (август 2007 г.). «Контроль качества мРНК эукариот: защита клеток от аномальной функции мРНК». Гены и развитие. 21 (15): 1833–1856. Дои:10.1101 / gad.1566807. PMID 17671086.
- ^ Obbard DJ, Гордон К. Х., Бак А. Х., Джиггинс FM (январь 2009 г.). «Эволюция РНКи как защиты от вирусов и мобильных элементов». Философские труды Лондонского королевского общества. Серия B, Биологические науки. 364 (1513): 99–115. Дои:10.1098 / rstb.2008.0168. ЧВК 2592633. PMID 18926973.
- ^ Бреннеке Дж., Старк А., Рассел Р. Б., Коэн С. М. (март 2005 г.). «Принципы распознавания микроРНК-мишеней». PLOS Биология. 3 (3): e85. Дои:10.1371 / journal.pbio.0030085. ЧВК 1043860. PMID 15723116.
- ^ Eulalio A, Huntzinger E, Nishihara T, Rehwinkel J, Fauser M, Izaurralde E (январь 2009 г.). «Деаденилирование - широко распространенный эффект регуляции miRNA». РНК. 15 (1): 21–32. Дои:10.1261 / rna.1399509. ЧВК 2612776. PMID 19029310.
- ^ Грегори Хуанг (6 декабря 2012 г.). «Moderna, буксировка на 40 миллионов долларов, надеется заново изобрести биотехнологию с помощью« Сделай свой собственный препарат »"". Xconomy.
- ^ а б Качмарек Й.К., Ковальски П.С., Андерсон Д.Г. (июнь 2017 г.). «Достижения в области доставки РНК-терапии: от концепции к клинической реальности». Геномная медицина. 9 (1): 60. Дои:10.1186 / s13073-017-0450-0. ЧВК 5485616. PMID 28655327.
- ^ Crow D (7 сентября 2017 г.). «Обязательство Moderna заставляет инвесторов биться быстрее; Biotech Group обещает переписать правила разработки лекарств - хотя скептики говорят, что оценка в 5 млрд долларов незаслуженная». Financial Times.
- ^ Адамс Б. (14 сентября 2017 г.). «Moderna меняет модель исследований и разработок, публикует сообщения о раке, обновляет данные клинических испытаний». FierceBiotech.
- ^ а б Хадж К.А., Уайтхед К.А. (12 сентября 2017 г.). «Инструменты для перевода: невирусные материалы для терапевтической доставки мРНК». Nature Reviews Материалы. 2 (10): 17056. Bibcode:2017НатРМ ... 217056H. Дои:10.1038 / натревмац.2017.56.
- ^ а б Гуссейнов Э., Козлов М., Сканлан Ц. (15 сентября 2015 г.). «Терапия и вакцины на основе РНК». Новости генной инженерии.
дальнейшее чтение
- Alsaweed M, Lai CT, Hartmann PE, Geddes DT, Kakulas F (февраль 2016 г.). «МикроРНК грудного молока в основном происходят из молочной железы, что приводит к уникальным профилям миРНК фракционированного молока». Научные отчеты. 6 (1): 20680. Bibcode:2016НатСР ... 620680А. Дои:10.1038 / srep20680. ЧВК 4745068. PMID 26854194.
- Lillycrop KA, Burdge GC (октябрь 2012 г.). «Эпигенетические механизмы, связывающие раннее питание с долгосрочным здоровьем». Лучшие практики и исследования. Клиническая эндокринология и метаболизм. 26 (5): 667–676. Дои:10.1016 / j.beem.2012.03.009. PMID 22980048.
- Мельник BC, Какулас Ф., Геддес Д.Т., Хартманн П.Е., Джон С.М., Каррера-Бастос П., Кордайн Л., Шмитц Г. (21 июня 2016 г.). «МикроРНК молока: простые питательные вещества или системные функциональные регуляторы?». Питание и обмен веществ. 13 (1): 42. Дои:10.1186 / s12986-016-0101-2. ЧВК 4915038. PMID 27330539.
- Vickers MH (июнь 2014 г.). «Питание в раннем возрасте, эпигенетика и программирование болезней более позднего возраста». Питательные вещества. 6 (6): 2165–2178. Дои:10.3390 / nu6062165. ЧВК 4073141. PMID 24892374.
- Чжоу Ц., Ли М, Ван Х, Ли Ц., Ван Т, Чжу Ц., Чжоу Х, Ван Х, Гао Х, Ли Х (2012). «Связанные с иммунитетом микроРНК в изобилии присутствуют в экзосомах грудного молока». Международный журнал биологических наук. 8 (1): 118–123. Дои:10.7150 / ijbs.8.118. ЧВК 3248653. PMID 22211110.
внешняя ссылка
Викискладе есть медиафайлы по теме мРНК. |
- Жизнь мРНК Flash анимация
- Атлас РНКи: база данных библиотек РНКи и результатов их целевого анализа
- miRSearch: Инструмент для поиска микроРНК, нацеленных на мРНК
- Как кодируется мРНК?: YouTube видео
[1]: Новостная статья