WikiDer > Майкл Штернберг

Michael Sternberg
Для Великого Магистра Тевтонских рыцарей см. Михаэль Кюхмайстер фон Штернберг.
Майк Штернберг
Родившийся
Майкл Джозеф Эзра Штернберг

(1951-06-24) 24 июня 1951 г. (69 лет)[1]
Альма-матер
Награды
Научная карьера
Поля
Учреждения
ТезисИсследования конформации белков (1977)
ДокторантДэвид Чилтон Филлипс[3]
Интернет сайтwww.imperial.ac.Великобритания/люди/ м.sternberg

Майкл Джозеф Эзра Штернберг (родился 24 июня 1951 г.)[1] это Профессор в Имперский колледж Лондон где он является директором Центра интегративной системной биологии и биоинформатики[4] и руководитель Структурная биоинформатика Группа.[2][5][6][7]

Образование

Штернберг получил образование в Средняя школа округа Хендон и Колледж Гонвилля и Кая, Кембридж где он был награжден Бакалавр искусств степень в области Естественные науки (теоретическая физика) в 1972 г.[1] Он продолжил Магистр естественных наук степень в области Вычисление в Имперский колледж Лондон за которым следует DPhil степень от Оксфордский университет (Вольфсон Колледж, Оксфорд) в 1978 году для исследований под руководством Дэвид Чилтон Филлипс.[3][8][9][10][11][12]

Карьера

После постдокторское исследование на Оксфордский университет, Штернберг стал Лектор в отделе Кристаллография в Биркбек-колледж, Лондон. Он продолжил работу в Императорский фонд исследования рака и поступил в Имперский колледж в 2001 году.[1][13][14][15][16] Он является директором Центра интегративной системной биологии и биоинформатики.[4] в Имперском колледже.

Исследование

Научные интересы Штернберга: предсказание структуры белка, прогноз функции белка, предсказание макромолекулярный док и взаимодействия, сетевое моделирование для системная биология и на основе логики дизайн лекарства.[13][17][18][19][20][21][22][23][24][25]

Он является автором или соавтором нескольких книг, в том числе От клеток к атомам: иллюстрированное введение в молекулярную биологию,[26] Белковая инженерия: практический подход[27] и Прогнозирование структуры белка: практический подход.[28]

Во время исследования в Оксфорде он работал с Джанет Торнтон и они предприняли некоторые из первых систематических анализов структура белка. Они определили, что бета-альфа-бета-единица в белках почти всегда правосторонняя, и это объяснило замечательное сходство между структурами белков.[нужна цитата]

Его группа, в частности Лоуренс Келли, разработала широко используемый веб-сервер Phyre / Phyre2.[29][30][31] для предсказания структуры белков. Этим веб-ресурсом воспользовались более 100 000 различных пользователей по всему миру.[нужна цитата]

Недавно его аспирант Крис Йейтс разработал SuSPect,[32] новый мощный метод прогнозирования фенотипических эффектов Однонуклеотидные полиморфизмы и другие аминокислота варианты.

Награды и награды

Штернберг был избран Член Королевского биологического общества (FRSB) и Сотрудник Института биологии (ФИБиол). Он является младшим редактором журнала Журнал молекулярной биологии.

Рекомендации

  1. ^ а б c d "ШТЕРНБЕРГ, проф. Майкл Джозеф Эзра". Кто есть кто. ukwhoswho.com. 2014 (онлайн Oxford University Press ред.). A&C Black, отпечаток Bloomsbury Publishing plc. (подписка или Членство в публичной библиотеке Великобритании требуется) (требуется подписка)
  2. ^ а б Майкл Штернберг публикации, проиндексированные Google ученый Отредактируйте это в Викиданных
  3. ^ а б Штернберг, Майкл Джозеф Эзра (1977). Исследования конформации белков (Докторская диссертация). Оксфордский университет.
  4. ^ а б http://www3.imperial.ac.uk/cisbio
  5. ^ Публикации Михаэля Штернберга индексируется Scopus библиографическая база данных. (требуется подписка)
  6. ^ Майкл Дж. Э. Стернберг в DBLP Сервер библиографии Отредактируйте это в Викиданных
  7. ^ Список публикаций из Microsoft Academic
  8. ^ Cohen, F.E .; Sternberg, M. J .; Филлипс, Д. С .; Kuntz, I.D .; Коллман, П. А. (1980). «Модель диффузии-столкновения-адгезии для кинетики рефолдинга миоглобина». Природа. 286 (5773): 632–4. Дои:10.1038 / 286632a0. PMID 7402344.
  9. ^ Artymiuk, P.J .; Blake, C.C .; Грейс, Д. Э .; Oatley, S.J .; Филлипс, Д. С .; Штернберг, М. Дж. (1979). «Кристаллографические исследования динамических свойств лизоцима». Природа. 280 (5723): 563–8. Дои:10.1038 / 280563a0. PMID 460438.
  10. ^ Sternberg, M. J .; Грейс, Д. Э .; Филлипс, Д. К. (1979). «Динамическая информация из кристаллографии белков. Анализ температурных факторов уточнения структуры лизоцима куриного яйца и белка». Журнал молекулярной биологии. 130 (3): 231–52. Дои:10.1016/0022-2836(79)90539-4. PMID 469942.
  11. ^ Филлипс, Д.С.; Штернберг, М. Дж.; Торнтон, Дж. М.; Уилсон, И. А. (1978). «Анализ структуры триозофосфатизомеразы и ее сравнение с лактатдегидрогеназой». Журнал молекулярной биологии. 119 (2): 329–51. Дои:10.1016/0022-2836(78)90440-0. PMID 633372.
  12. ^ Филлипс, Д. С .; Риверс, П. С .; Sternberg, M. J .; Thornton, J.M .; Уилсон, И. А. (1977). «Анализ трехмерной структуры куриной триозофосфат-изомеразы». Сделки Биохимического Общества. 5 (3): 642–7. Дои:10.1042 / bst0050642. PMID 902882.
  13. ^ а б Майкл Штернберг, Имперский колледж Лондона
  14. ^ Штернберг, М. Дж.; Торнтон, Дж. М. (1978). «Прогнозирование структуры белка по аминокислотной последовательности». Сделки Биохимического Общества. 6 (6): 1119–23. Дои:10.1042 / bst0061119. PMID 744369.
  15. ^ Штернберг, М. Дж.; Торнтон, Дж. М. (1978). «Прогнозирование структуры белка по аминокислотной последовательности». Природа. 271 (5640): 15–20. Дои:10.1038 / 271015a0. PMID 342964.
  16. ^ Бланделл, Т.; Sibanda, B.L .; Штернберг, М. Дж.; Торнтон, Дж. М. (1987). «Основанное на знаниях предсказание белковых структур и дизайн новых молекул». Природа. 326 (6111): 347–52. Дои:10.1038 / 326347a0. PMID 3550471.
  17. ^ Wass, M. N .; Barton, G .; Штернберг, М. Дж. Э. (2012). "Гребень Func: Прогнозирование функции белков с использованием разнородных источников данных ". Исследования нуклеиновых кислот. 40 (Проблема с веб-сервером): W466 – W470. Дои:10.1093 / нар / gks489. ЧВК 3394346. PMID 22641853.
  18. ^ Kelley, L.A .; MacCallum, R.M .; Штернберг, М. Дж. Э. (2000). «Расширенная аннотация генома с использованием структурных профилей в программе 3D-PSSM». Журнал молекулярной биологии. 299 (2): 501–522. Дои:10.1006 / jmbi.2000.3741. PMID 10860755.
  19. ^ Gabb, H.A .; Джексон, Р. М .; Штернберг, М. Дж. Э. (1997). «Моделирование стыковки белков с использованием комплементарности форм, электростатики и биохимической информации». Журнал молекулярной биологии. 272 (1): 106–20. Дои:10.1006 / jmbi.1997.1203. PMID 9299341.
  20. ^ Barton, G.J .; Штернберг, М. Дж. (1987). «Стратегия быстрого множественного выравнивания белковых последовательностей. Уровни достоверности из сравнений третичной структуры». Журнал молекулярной биологии. 198 (2): 327–37. Дои:10.1016/0022-2836(87)90316-0. PMID 3430611.
  21. ^ Zvelebil, M.J .; Barton, G.J .; Taylor, W. R .; Штернберг, М. Дж. (1987). «Прогнозирование вторичной структуры белка и активных сайтов с использованием выравнивания гомологичных последовательностей». Журнал молекулярной биологии. 195 (4): 957–61. Дои:10.1016/0022-2836(87)90501-8. PMID 3656439.
  22. ^ Кинг, Р. Д.; Штернберг, М. Дж. Э. (1996). «Выявление и применение концепций, важных для точного и надежного предсказания вторичной структуры белка». Белковая наука. 5 (11): 2298–2310. Дои:10.1002 / pro.5560051116. ЧВК 2143286. PMID 8931148.
  23. ^ Lewis, T. E .; Силлитоэ, I; Андреева А; Blundell, T. L .; Buchan, D. W .; Chothia, C; Cozzetto, D; Dana, J.M .; Филиппис, I; Гоф, Дж.; Джонс, Д. Т .; Kelley, L.A .; Клейвегт, Г. Дж.; Minneci, F; Мистри, Дж; Мурзин, А.Г .; Очоа-Монтаньо, B; Oates, M.E .; Пунта, М; Rackham, O.J .; Stahlhacke, J; Штернберг, М. Дж.; Веланкар, S; Оренго, К. (2015). «Genome3D: использование структуры, чтобы помочь пользователям понять свои последовательности». Исследования нуклеиновых кислот. 43 (Выпуск базы данных): D382–6. Дои:10.1093 / нар / gku973. ЧВК 4384030. PMID 25348407.
  24. ^ Radivojac, P .; Clark, W. T .; Oron, T. R .; Schnoes, A. M .; Wittkop, T .; Соколов, А .; Graim, K .; Funk, C .; Verspoor, K .; Бен-Гур, А .; Pandey, G .; Yunes, J.M .; Talwalkar, A. S .; Репо, С .; Souza, M. L .; Piovesan, D .; Casadio, R .; Wang, Z .; Cheng, J .; Fang, H .; Gough, J .; Koskinen, P .; Törönen, P .; Nokso-Koivisto, J .; Holm, L .; Cozzetto, D .; Buchan, D. W. A .; Bryson, K .; Джонс, Д. Т .; и другие. (2013). «Масштабная оценка предсказания вычислительной функции белка». Методы природы. 10 (3): 221–227. Дои:10.1038 / число 2340. ЧВК 3584181. PMID 23353650.
  25. ^ Lewis, T. E .; Силлитоэ, I; Андреева А; Blundell, T. L .; Buchan, D. W .; Chothia, C; Манжета, А; Dana, J.M .; Филиппис, I; Гоф, Дж.; Хантер, S; Джонс, Д. Т .; Kelley, L.A .; Клейвегт, Г. Дж.; Minneci, F; Митчелл, А; Мурзин, А.Г .; Очоа-Монтаньо, B; Rackham, O.J .; Смит, Дж; Штернберг, М. Дж.; Веланкар, S; Йейтс, С; Оренго, К. (2013). «Genome3D: совместный британский проект по аннотированию геномных последовательностей с предсказанными трехмерными структурами на основе доменов SCOP и CATH». Исследования нуклеиновых кислот. 41 (Выпуск базы данных): D499–507. Дои:10.1093 / нар / гкс1266. ЧВК 3531217. PMID 23203986.
  26. ^ От клеток к атомам: иллюстрированное введение в молекулярную биологию ISBN 0632008881
  27. ^ Белковая инженерия: практический подход ISBN 0199631387
  28. ^ Прогнозирование структуры белка: практический подход ISBN 0199634963|
  29. ^ Kelley, L.A .; Штернберг, М. Дж. Э. (2009). «Прогнозирование структуры белка в Интернете: пример использования сервера Phyre». Протоколы природы. 4 (3): 363–71. Дои:10.1038 / nprot.2009.2. HDL:10044/1/18157. PMID 19247286.
  30. ^ Bennett-Lovsey, R.M .; Герберт, А.Д .; Sternberg, M. J. E .; Келли, Л. А. (2007). «Изучение крайностей пространства последовательностей / структур с распознаванием ансамблевых складок в программе Phyre». Белки: структура, функции и биоинформатика. 70 (3): 611–625. Дои:10.1002 / prot.21688. PMID 17876813.
  31. ^ http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre
  32. ^ Yates, C.M .; Филиппис, I; Kelley, L.A .; Штернберг, М. Дж. (2014). «SuSPect: Улучшенное предсказание фенотипа варианта одной аминокислоты (SAV) с использованием сетевых функций». Журнал молекулярной биологии. 426 (14): 2692–701. Дои:10.1016 / j.jmb.2014.04.026. ЧВК 4087249. PMID 24810707.