WikiDer > Микобиом

Mycobiome

В микобиом, микобиота или грибок микробиом, это грибковый сообщества внутри и на организме.[1][2][3]

Существует небольшое количество грибов, связанных с большинством участков тела человека, таких как желудочно-кишечный тракт, где грибы обычно составляют всего 0,001–0,1% микробного сообщества.[4][5] Однако грибы составляют значительную часть микробиома в некоторых местах, например, в слуховом проходе.[6]

Микобиом имеет отношение к физиологии человека, поскольку грибы могут играть важную роль в поддержании структуры микробного сообщества, метаболической функции и иммунного примирования.[7][8] Мутуализм между людьми и грибами еще недостаточно изучен, и еще многое предстоит узнать о том, как грибы взаимодействуют с нефунговыми составляющими микробиома.

Болезни человека

Многие болезни человека, в том числе гепатит, кистозный фиброз, ожирение, и воспалительное заболевание кишечника были связаны с изменениями в микобиоме человека[9][10], и было высказано предположение, что любая грибковая колонизация желудочно-кишечного тракта является признаком заболевания.[4]

Присутствие грибковой биоты

Вагинальный микобиом

  • Candida (16 таксономических единиц)
  • Аскомикота
  • Saccharomycetales
  • Ascomycota Davidiellaceae
  • Кладоспорий
  • Евротия
  • Альтернариоз
  • Basidomycota Rhodotorula

Кишечный микобиом[11]

(Младенцы) Кишечный микобиом

  • Saccharomycetales (младенец)
  • Кладоспорий
  • Криптококк
  • Saccharomyces cerevisiae
  • Malasseziales
  • Евротиалы
  • Botryosphaeriales
  • Филобазидиальные[12]

Оральный микобиом

  • Candida
  • Сахаромицеты
  • Пенициллий
  • Аспергиллы
  • Скопуляриопсис
  • Genotrichum[13][14][15][16]
  • Криптококк
  • Гистоплазма
  • Мукор[17]
  • Кладоспорий
  • Фузариум
  • Альтернариоз[18]
  • Malassezia
  • Эпикокк
  • Ауреобазидиум
  • Ирпекс
  • Цитоспора
  • Lenziles
  • Спороболомицеты
  • Dothioraceae
  • Тератосфария
  • Гломус[19][18]
  • Пичиа

Микобиом легких

  • Аспергиллы
  • Пенициллий
  • Davidiellaceae
  • Candida[20]

Рекомендации

  1. ^ Цуй, Лицзя; Моррис, Элисон; Гедин, Элоди (2013). «Микобиом человека в здоровье и болезнях». Геномная медицина. 5 (7): 63. Дои:10,1186 / г 467. ЧВК 3978422. PMID 23899327.
  2. ^ Ганнум, Махмуд (1 февраля 2016 г.). «Микобиом». Ученый. Получено 5 февраля, 2016.
  3. ^ Suhr, M.J; Халлен-Адамс, Х.Е. (2015). «Микобиом кишечника человека: подводные камни и возможности - взгляд микологов». Микология. 107 (6): 1057–73. Дои:10.3852/15-147. PMID 26354806. S2CID 16731371.
  4. ^ а б Auchtung, TA; Фофанова Т.Ю .; Стюарт CJ; Наш АК; Вонг MC; Gesell JR; Auchtung JM; Аджами Нью-Джерси; Петросино Ю.Ф. (2018). «Исследование колонизации здорового взрослого желудочно-кишечного тракта грибами». мСфера. 3 (2): e00092–18. Дои:10.1128 / мСфера.00092-18. ЧВК 5874442. PMID 29600282.
  5. ^ Цинь, Цзюньцзе; Ли, Жуйцян; Раес, Джерун; Арумугам, Маниможиян; Бургдорф, Кристоффер Сольвстен; Manichanh, Chaysavanh; Нильсен, Трина; Понс, Николас; Левенес, Флоренция; Ямада, Такудзи; Mende, Daniel R; Ли, Цзюньхуа; Сюй, Цзюньминь; Ли, Шаочуань; Ли, Дунфан; Цао, Цзяньцзюнь; Ван, Бо; Лян, Хуэйцин; Чжэн, Хуйсун; Се, Иньлун; Тап, Жюльен; Лепаж, Патрисия; Берталан, Марсело; Батто, Жан-Мишель; Хансен, Торбен; Ле Пелье, Дени; Линнеберг, Аллан; Нильсен, Х. Бьёрн; Пеллетье, Эрик; и другие. (2010). «Каталог микробных генов кишечника человека, созданный с помощью метагеномного секвенирования». Природа. 464 (7285): 59–65. Bibcode:2010Натура 464 ... 59.. Дои:10.1038 / природа08821. ЧВК 3779803. PMID 20203603.
  6. ^ О, Дж; Берд А.Л .; Парк М; Программа сравнительного секвенирования NISC; Kong HH; Сегре Я.А. (2016). «Временная стабильность микробиома кожи человека». Клетка. 165 (4): 854–66. Дои:10.1016 / j.cell.2016.04.008. ЧВК 4860256. PMID 27153496.
  7. ^ Сид, П. С. (2014). «Микобиом человека». Перспективы Колд-Спринг-Харбор в медицине. 5 (5): a019810. Дои:10.1101 / cshperspect.a019810. ЧВК 4448585. PMID 25384764.
  8. ^ Pflughoeft, Kathryn J; Версалович, Джеймс (2012). «Микробиом человека в здоровье и болезнях». Ежегодный обзор патологии: механизмы заболевания. 7: 99–122. Дои:10.1146 / annurev-pathol-011811-132421. PMID 21910623.
  9. ^ Mar Rodríguez, M; Перес, Даниэль; Хавьер Чавес, Фелипе; Эстев, Эдуардо; Марин-Гарсия, Пабло; Ксифра, Джемма; Вендрелл, Джоан; Хове, Мариона; Памплона, Рейнальд; Рикарт, Вифредо; Портеро-Отин, Мануэль; Чакон, Матильда Р.; Фернандес Реаль, Хосе Мануэль (2015). «Ожирение изменяет микобиом кишечника человека». Научные отчеты. 5: 14600. Bibcode:2015НатСР ... 514600М. Дои:10.1038 / srep14600. ЧВК 4600977. PMID 26455903.
  10. ^ Акерман, А. Ленор; Андерхилл, Дэвид М (2017). «Микобиом мочевыводящих путей человека: потенциальная роль грибков в урологии». Анналы трансляционной медицины. 5 (2): 31. Дои:10.21037 / атм.2016.12.69. ЧВК 5300854. PMID 28217696.
  11. ^ Нэш, АК; Auchtung TA; Вонг MC; Смит Д. П.; Gesell JR; Росс MC; Стюарт CJ; Меткалф GA; Музный ДМ; Гиббс Р.А.; Аджами Нью-Джерси; Петросино Ю.Ф. (2017). «Микобиом кишечника здоровой когорты Проекта микробиома человека». Микробиом. 5 (1): 153. Дои:10.1186 / s40168-017-0373-4. ЧВК 5702186. PMID 29178920.
  12. ^ Латуга, Мариам Сьюзан; Эллис, Джозеф Кристофер; Коттон, Чарльз Майкл; Гольдберг, Рональд Н; Винн, Джеймс Л; Джексон, Роберт Б; Сид, Патрик С. (2011). «Помимо бактерий: исследование консорциума кишечных микробов у младенцев с крайне низкой массой тела при рождении». PLOS ONE. 6 (12): e27858. Bibcode:2011PLoSO ... 627858L. Дои:10.1371 / journal.pone.0027858. ЧВК 3234235. PMID 22174751.
  13. ^ Уильямс, DW; Льюис, MAO (2008). «Микробиология полости рта: выделение и идентификация кандиды из полости рта». Оральные заболевания. 6 (1): 3–11. Дои:10.1111 / j.1601-0825.2000.tb00314.x. PMID 10673781.
  14. ^ Шустер, Г. С (1999). «Флора ротовой полости и патогенные организмы». Клиники инфекционных болезней Северной Америки. 13 (4): 757–74, т. Дои:10.1016 / s0891-5520 (05) 70107-0. PMID 10579107.
  15. ^ Salonen, J.H; Ричардсон, доктор медицины; Галлахер, К; Issakainen, J; Helenius, H; Lehtonen, O.-P; Никоскелайнен, J (2000). «Грибковая колонизация гематологических больных, получающих цитотоксическую химиотерапию: появление азол-резистентных Сахаромицеты cerevisiae ". Журнал госпитальной инфекции. 45 (4): 293–301. Дои:10.1053 / jhin.1999.0718. PMID 10973747.
  16. ^ Джабра-Ризк, М. А; Феррейра, С. М. С; Сабет, М; Falkler, W.A; Merz, W. G; Мейллер, Т. Ф (2001). «Восстановление Candida dubliniensis и других дрожжей от поражений пародонта, связанных с вирусом иммунодефицита человека». Журнал клинической микробиологии. 39 (12): 4520–2. Дои:10.1128 / JCM.39.12.4520-4522.2001. ЧВК 88577. PMID 11724873.
  17. ^ Ятта, Роберта; Наполи, Кристиан; Борги, Элиза; Монтанья, Мария Тереза ​​(2009). «Редкие микозы полости рта: эпидемиологический обзор литературы». Хирургия полости рта, стоматология, патология полости рта, радиология полости рта и эндодонтия. 108 (5): 647–55. Дои:10.1016 / j.tripleo.2009.07.010. PMID 19836721.
  18. ^ а б Ганнум, Махмуд А; Юревич, Ричард Дж; Mukherjee, Pranab K; Цуй, Фань; Сикаруди, Масуме; Накви, Аммар; Жиллеве, Патрик М (2010). «Характеристика микробиома оральных грибов (микобиома) у здоровых людей». Патогены PLOS. 6 (1): e1000713. Дои:10.1371 / journal.ppat.1000713. ЧВК 2795202. PMID 20072605.
  19. ^ Дюпуи, Аманда К.; Дэвид, Марика С; Ли, Лу; Хайдер, Томас Н; Петерсон, Джейсон Д; Монтано, Элизабет А; Донгари-Багцоглу, Анна; Диас, Патрисия I; Strausbaugh, Линда D (2014). «Новое определение орального микобиома человека с помощью улучшенных методов таксономии на основе ампликонов: открытие Malassezia как выдающегося комменсала». PLOS ONE. 9 (3): e90899. Bibcode:2014PLoSO ... 990899D. Дои:10.1371 / journal.pone.0090899. ЧВК 3948697. PMID 24614173.
  20. ^ Чарлсон, Эмили С; Даймонд, Джошуа М; Биттингер, Кайл; Фитцджеральд, Аянна С; Ядав, Анджана; Хаас, Эндрю Р.; Бушмен, Фредерик Д.; Коллман, Рональд Дж. (2012). «Обогащенные легкими организмы и аберрантная бактериальная и грибковая респираторная микробиота после трансплантации легких». Американский журнал респираторной медицины и реанимации. 186 (6): 536–45. Дои:10.1164 / rccm.201204-0693OC. ЧВК 3480531. PMID 22798321.