WikiDer > NDUFA12

NDUFA12
NDUFA12
Идентификаторы
ПсевдонимыNDUFA12, B17.2, DAP13, NADH: субъединица A12 убихинон оксидоредуктазы, MC1DN23
Внешние идентификаторыOMIM: 614530 MGI: 1913664 ГомолоГен: 10314 Генные карты: NDUFA12
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение NDUFA12
Геномное расположение NDUFA12
Группа12q22Начинать94,897,055 бп[1]
Конец95,003,748 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NDUFA12 gnf1h00318 в формате fs.png

PBB GE NDUFA12 gnf1h00316 s в формате fs.png

PBB GE NDUFA12 gnf1h00315 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_018838
NM_001258338

NM_025551
NM_001364691

RefSeq (белок)

NP_001245267
NP_061326

NP_079827
NP_001351620

Расположение (UCSC)Chr 12: 94.9 - 95 МбChr 10: 94,2 - 94,22 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Субъединица 12 альфа-субкомплекса НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 является фермент что у людей кодируется NDUFA12 ген.[5][6][7] Белок NDUFA12 является субъединицей НАДН-дегидрогеназа (убихинон), который находится в митохондриальная внутренняя мембрана и является крупнейшим из пяти комплексов электронная транспортная цепь.[8][9] Мутации в субъединицах НАДН-дегидрогеназы (убихинона), также известной как Комплекс I, часто приводят к сложным нейродегенеративным заболеваниям, таким как Синдром Ли которые являются результатом дефицита митохондриального комплекса I.[7]

Структура

Ген NDUFA12 расположен на q-плече хромосома 12 в положении 22 и охватывает 32 386 пар оснований.[7] Ген производит белок 17 кДа, состоящий из 145 аминокислоты.[10][11] NDUFA12 - субъединица фермента НАДН-дегидрогеназа (убихинон), самый крупный из респираторных комплексов. Конструкция Г-образная с длинным, гидрофобный трансмембранный домен и гидрофильный домен для периферического плеча, который включает все известные окислительно-восстановительные центры и сайт связывания NADH.[8] Было отмечено, что N-концевой гидрофобный домен может быть свернут в альфа спираль охватывающий внутренний митохондриальная мембрана с C-терминал гидрофильный домен, взаимодействующий с глобулярными субъединицами Комплекса I. консервированный двухдоменная структура предполагает, что эта особенность имеет решающее значение для функции белка и что гидрофобный домен действует как якорь для НАДН-дегидрогеназа (убихинон) комплекс на внутренней митохондриальной мембране. NDUFA12 является одной из примерно 31 гидрофобной субъединицы, которая формирует трансмембранную область Комплекса I, но это дополнительная субъединица, которая, как полагают, не участвует в катализе.[12] Предсказанный вторичная структура в первую очередь представляет собой альфа-спираль, но карбоксиконцевая половина белка имеет высокий потенциал для принятия формы спиральной спирали. Аминоконцевая часть содержит предполагаемый бета-лист, богатый гидрофобными аминокислотами, которые могут служить сигналом импорта в митохондрии.[7][9][13]

Функция

Ген NDUFA12 человека кодирует субъединицу Комплекс I из дыхательная цепь, который переносит электроны из НАДН к убихинон.[7] НАДН связывается с комплексом I и переносит два электрона на изоаллоксазиновое кольцо из флавинмононуклеотид (ФМН) протез руки с образованием ФМНГ2. Электроны передаются через серию железо-серные (Fe-S) кластеры в протезе руки и, наконец, до коэнзима Q10 (CoQ), который восстанавливается до убихинол (CoQH2). Поток электронов изменяет окислительно-восстановительное состояние белка, что приводит к конформационному изменению и pK сдвиг ионизируемой боковой цепи, который выкачивает четыре иона водорода из митохондриального матрикса.[8]

Клиническое значение

Мутации в NDUFA12 не часто вызывают дефицит комплекса I. NDUFA12 является дополнительной субъединицей, и комплекс все еще может быть собран и ферментативно активен в его отсутствие, хотя и в уменьшенных количествах и активности. Тем не менее, мутация цитозина в тирозин в положении 178, которая приводит к преждевременному стоп-кодону, была обнаружена вместо аргинин на аминокислоте 60, что приводит к задержке раннего развития, потере двигательных способностей и поражениям базальных ганглиев, типичным для Синдром Ли.[14]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000184752 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000020022 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Triepels R, Smeitink J, Loeffen J, Smeets R, Trijbels F, van den Heuvel L (апрель 2000 г.). «Характеристика человеческого комплекса I NDUFB7 и кДНК 17,2 кДа и мутационный анализ 19 генов фракции HP у пациентов с комплексом I-дефицитных». Генетика человека. 106 (4): 385–391. Дои:10.1007 / s004390000278. PMID 10830904. S2CID 1036688.
  6. ^ Скехел Дж. М., Фернли И. М., Уокер Дж. Э. (ноябрь 1998 г.). «НАДН: убихинон оксидоредуктаза из митохондрий бычьего сердца: последовательность новой субъединицы 17,2 кДа». Письма FEBS. 438 (3): 301–305. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 01317-9. PMID 9827566. S2CID 23466378.
  7. ^ а б c d е «Ген Entrez: NDUFA12 NADH дегидрогеназа (убихинон) 1 альфа-субкомплекс, 12».
  8. ^ а б c Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). «Глава 18». Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. С. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7.
  9. ^ а б Emahazion T, Beskow A, Gyllensten U, Brookes AJ (ноябрь 1998 г.). "Радиационное гибридное картирование на основе интронов 15 комплексных генов I цепи транспорта электронов человека". Цитогенетика и клеточная генетика. 82 (1–2): 115–9. Дои:10.1159/000015082. PMID 9763677. S2CID 46818955.
  10. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК 4076475. PMID 23965338.
  11. ^ "NDUFA12 - NADH дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа субъединица 12". Атлас кардиоорганических белков (COPaKB).
  12. ^ «НДУФА12». UniProt.org. Консорциум UniProt.
  13. ^ Тон С., Хван Д.М., Демпси А.А., Лью С.К. (декабрь 1997 г.). «Идентификация и первичная структура пяти субъединиц НАДН-убихинон оксидоредуктазы». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 241 (2): 589–94. Дои:10.1006 / bbrc.1997.7707. PMID 9425316.
  14. ^ Остергаард Э., Роденбург Р. Дж., Ван ден Бранд М., Томсен Л. Л., Дуно М., Батбейли М., Вибранд Ф., Нийтманс Л. (ноябрь 2011 г.). «Дефицит комплекса I дыхательной цепи из-за мутаций NDUFA12 как новая причина синдрома Ли». Журнал медицинской генетики. 48 (11): 737–40. Дои:10.1136 / jmg.2011.088856. PMID 21617257. S2CID 33078321.

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.