WikiDer > NDUFA9
Субъединица 9 альфа субкомплекса НАДН дегидрогеназа [убихинон] 1 является фермент что у людей кодируется NDUFA9 ген.[5][6][7] Белок NDUFA9 является субъединицей НАДН: убихинон оксидоредуктаза (Комплекс I электронная транспортная цепь), который находится в митохондриальная внутренняя мембрана и является крупнейшим из пяти комплексов электронно-транспортной цепи.[8][9] Мутации в НАДН-дегидрогеназе (убихиноне), также известной как Комплекс I, часто приводят к сложным нейродегенеративным заболеваниям, таким как Синдром Ли. В случае NDUFA9 мутация MT-ND3 ген может прервать их взаимодействие и образование субкомплексов, нарушая Комплекс I функция и приводит к болезни.[10]
Структура
Ген NDUFA9 расположен на p-плече хромосома 12 в положении 13.3 и охватывает 45 222 пары оснований.[5] Ген продуцирует белок 42,5 кДа, состоящий из 377 аминокислоты.[11][12] NDUFA9 - субъединица фермента НАДН-дегидрогеназа (убихинон), самый крупный из респираторных комплексов. Конструкция Г-образная с длинным, гидрофобный трансмембранный домен и гидрофильный домен для периферического плеча, который включает все известные окислительно-восстановительные центры и сайт связывания NADH.[8] Было отмечено, что N-концевой гидрофобный домен может быть свернут в альфа спираль охватывающий внутренний митохондриальная мембрана с C-терминал гидрофильный домен, взаимодействующий с глобулярными субъединицами Комплекса I. консервированный двухдоменная структура предполагает, что эта особенность имеет решающее значение для функции белка и что гидрофобный домен действует как якорь для НАДН-дегидрогеназа (убихинон) комплекс в внутренняя митохондриальная мембрана. NDUFA9 является одной из примерно 31 гидрофобной субъединицы, которая формирует трансмембранную область Комплекса I, но это дополнительная субъединица, которая, как полагают, не участвует в катализе.[13] Предсказанный вторичная структура в первую очередь альфа спираль, но карбокси-концевая половина белка имеет высокий потенциал принять форму спиральной спирали. Аминоконцевая часть содержит предполагаемый бета-лист, богатый гидрофобными аминокислотами, которые могут служить сигналом импорта в митохондрии.[5][9][14]
Функция
Ген NDUFA9 человека кодирует субъединицу Комплекс I из дыхательная цепь, который переносит электроны из НАДН к убихинон.[5] НАДН связывается с комплексом I и переносит два электрона на изоаллоксазиновое кольцо из флавинмононуклеотид (ФМН) протез руки с образованием ФМНГ2. Электроны передаются через серию железо-серные (Fe-S) кластеры в протез руки и, наконец, Коэнзим Q10 (CoQ), который сводится к убихинол (CoQH2). Поток электронов изменяет окислительно-восстановительное состояние белка, что приводит к конформационному изменению и pK сдвиг ионизируемой боковой цепи, который выкачивает четыре иона водорода из митохондриальный матрикс.[8]
Клиническое значение
Снижение экспрессии NDUFA9 связано с Синдром Ли, тяжелое неврологическое расстройство, которое обычно возникает в первый год жизни, характеризуется прогрессирующей потерей умственных и двигательных способностей и обычно приводит к смерти в течение нескольких лет, обычно из-за нарушение дыхания. Мутация в MT-ND3 ген (тирозин к цитозин в позиции 10191) приводит к замене серин за пролин, что может внести нестабильность Комплекс I из-за неспособности образовывать подкомплексы между MT-ND3 и NDUFA9. Однако такая генетическая идентификация может не подходить для пренатальное тестирование из-за возраста мутации и тканевой зависимости.[10]
Взаимодействия
NDUFA9 имеет 135 двоичных белок-белковые взаимодействия включая 112 ко-комплексных взаимодействий. NDUFA9, похоже, взаимодействует с BLOC1S1, NDUFS1, NOA1, CYSRT1, KRTAP6-2, CIAO1, MT-ND3, TSC22D1, DNAJA3, SIRT3, MAGED1, и SSR1.[15]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000139180 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000399 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б c d «Ген Entrez: NDUFA9 NADH дегидрогеназа (убихинон) 1 альфа субкомплекс, 9».
- ^ Баенс М., Чаффанет М., Кассиман Дж. Дж., Ван ден Берге Х., Маринен П. (апрель 1993 г.). «Создание и оценка библиотеки hncDNA транскрибированных последовательностей 12p человека, полученных из гибрида соматических клеток». Геномика. 16 (1): 214–8. Дои:10.1006 / geno.1993.1161. PMID 8486360.
- ^ Перссон Б., Каллберг И., Брей Дж. Э., Бруфорд Е., Деллапорта С. Л., Фавиа А. Д., Дуарте Р. Г., Йорнвалл Х., Кавана К. Л., Кедишвили Н., Кисиела М., Мазер Е., Минднич Р., Орчард С., Пеннинг TM, Торнтон Д. М., Адамски Дж. , Oppermann U (март 2009 г.). «Инициатива по номенклатуре SDR (короткоцепочечная дегидрогеназа / редуктаза и родственные ферменты)». Химико-биологические взаимодействия. 178 (1–3): 94–8. Дои:10.1016 / j.cbi.2008.10.040. ЧВК 2896744. PMID 19027726.
- ^ а б c Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). «Глава 18». Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. С. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7.
- ^ а б Emahazion T, Beskow A, Gyllensten U, Brookes AJ (ноябрь 1998 г.). "Радиационное гибридное картирование на основе интронов 15 комплексных генов I цепи транспорта электронов человека". Цитогенетика и клеточная генетика. 82 (1–2): 115–9. Дои:10.1159/000015082. PMID 9763677. S2CID 46818955.
- ^ а б Leshinsky-Silver E, Lev D, Tzofi-Berman Z, Cohen S, Saada A, Yanoov-Sharav M, Gilad E, Lerman-Sagie T (август 2005 г.). «Фульминантное неврологическое ухудшение у новорожденного с синдромом Ли из-за материнской миссенс-мутации в митохондриальном гене ND3». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 334 (2): 582–7. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.06.134. PMID 16023078.
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК 4076475. PMID 23965338.
- ^ "NDUFA9 - NADH-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа субъединица 9". Атлас кардиоорганических белков (COPaKB).
- ^ "NDUFA9 - NADH дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа субъединица 9, митохондриальная". UniProt.org. Консорциум UniProt.
- ^ Тон С., Хван Д.М., Демпси А.А., Лью С.К. (декабрь 1997 г.). «Идентификация и первичная структура пяти субъединиц НАДН-убихинон оксидоредуктазы». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 241 (2): 589–94. Дои:10.1006 / bbrc.1997.7707. PMID 9425316.
- ^ "135 бинарных взаимодействий найдено для поискового запроса NDUFA9". База данных по молекулярным взаимодействиям IntAct. EMBL-EBI. Получено 2018-08-25.
дальнейшее чтение
- ван ден Бош Б.Дж., Герардс М., Слютер В., Стегманн А.П., Йонген Э.Л., Хеллебрекерс Д.М., Эгема Р., Ламбричс Э.Х., Прокиш Х., Данхаузер К., Шундерворд К., де Ку ИФ, Смитс Х.Д. «Дефектный NDUFA9 как новая причина неонатально смертельной болезни по комплексу I». Журнал медицинской генетики. 49 (1): 10–5. Дои:10.1136 / jmedgenet-2011-100466. PMID 22114105.
- Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.
- Фогель Р.О., Дитерен С.Е., ван ден Хеувел Л.П., Виллемс П.Х., Смейтинк Д.А., Купман В.Дж., Нийтманс Л.Г. (март 2007 г.). «Идентификация промежуточных продуктов сборки митохондриального комплекса I путем отслеживания помеченного NDUFS3 демонстрирует точку входа митохондриальных субъединиц». Журнал биологической химии. 282 (10): 7582–90. Дои:10.1074 / jbc.M609410200. PMID 17209039.
- Ма Дж., Демпси А.А., Стаматиу Д., Маршалл К.В., Лью С.К. (март 2007 г.). «Определение паттернов экспрессии лейкоцитарных генов, связанных с уровнями липидов в плазме у людей». Атеросклероз. 191 (1): 63–72. Дои:10.1016 / j.atherosclerosis.2006.05.032. PMID 16806233.
- Triepels RH, Hanson BJ, van den Heuvel LP, Sundell L, Marusich MF, Smeitink JA, Capaldi RA (март 2001 г.). «Дефекты комплекса I человека могут быть устранены с помощью анализа моноклональных антител на отдельные паттерны сборки субъединиц». Журнал биологической химии. 276 (12): 8892–7. Дои:10.1074 / jbc.M009903200. PMID 11112787.
- Лоффен Дж. Л., Трипельс Р. Х., ван ден Хеувел Л. П., Шуэльке М., Бускенс С. А., Смитс Р. Дж., Трайбелс Дж. М., Смейтинк Дж. А. (декабрь 1998 г.). "кДНК восьми ядерно-кодируемых субъединиц НАДН: убихинон оксидоредуктаза: характеристика кДНК комплекса I человека завершена". Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 253 (2): 415–22. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9786. PMID 9878551.
- Cross SH, Чарльтон JA, Nan X, Bird AP (март 1994). «Очистка CpG-островков с использованием колонки для связывания метилированной ДНК». Природа Генетика. 6 (3): 236–44. Дои:10.1038 / ng0394-236. PMID 8012384. S2CID 12847618.
- Фернли И.М., Финел М., Скехел Дж. М., Уокер Дж. Э. (сентябрь 1991 г.). «НАДН: убихинон оксидоредуктаза из митохондрий сердца крупного рогатого скота. Последовательности кДНК импортируемых предшественников ядерно-кодированных субъединиц 39 кДа и 42 кДа». Биохимический журнал. 278 (Pt 3) (3): 821–9. Дои:10.1042 / bj2780821. ЧВК 1151420. PMID 1832859.
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.