WikiDer > NDUFB6
Субъединица 6 бета-субкомплекса НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1, также известный как комплекс И-Б17, это белок что у людей кодируется NDUFB6 ген.[5][6][7] Субъединица 6 субкомплекса НАДН-дегидрогеназа (убихинон) 1 бета, является дополнительной субъединицей НАДН-дегидрогеназа (убихинон) комплекс, расположенный в митохондриальная внутренняя мембрана. Он также известен как Комплекс I и является крупнейшим из пяти комплексов электронная транспортная цепь.[8]
Ген
Ген NDUFB6 расположен на плече p хромосома 9 в положении 21.1 и имеет длину 19 659 пар оснований.[9][10]
Структура
Белок NDUFB6 весит 15,5 кДа и состоит из 128 аминокислот.[9][10] NDUFB6 - субъединица фермента НАДН-дегидрогеназа (убихинон), самый крупный из респираторных комплексов. Конструкция Г-образная с длинным, гидрофобный трансмембранный домен и гидрофильный домен для периферического плеча, который включает все известные окислительно-восстановительные центры и сайт связывания NADH.[8] Было отмечено, что N-концевой гидрофобный домен может быть свернут в альфа спираль охватывающий внутренний митохондриальная мембрана с C-терминал гидрофильный домен, взаимодействующий с глобулярными субъединицами Комплекса I. консервированный двухдоменная структура предполагает, что эта особенность имеет решающее значение для функции белка и что гидрофобный домен действует как якорь для НАДН-дегидрогеназа (убихинон) комплекс на внутренней митохондриальной мембране.[7]
Функция
Белок, кодируемый этим геном, является дополнительной субъединицей мультисубъединицы НАДН: убихинон оксидоредуктаза (комплекс I), непосредственно не участвующего в катализе.[7] Однако NDUFB6 требуется для активности переноса электронов.[11] Комплекс I млекопитающих состоит из 44 различных субъединиц. Он находится в митохондриальная внутренняя мембрана. Этот белковый комплекс обладает активностью NADH дегидрогеназы и активностью оксидоредуктазы. Он переносит электроны от НАДН к дыхательная цепь. Считается, что непосредственным акцептором электронов фермента является убихинон. Альтернативная сварка происходит в этом локусе, и были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.[7] Первоначально, НАДН связывается с комплексом I и переносит два электрона на изоаллоксазиновое кольцо из флавинмононуклеотид (ФМН) протез руки с образованием ФМНГ2. Электроны передаются через серию железо-серные (Fe-S) кластеры в протезе руки и, наконец, до коэнзима Q10 (CoQ), который восстанавливается до убихинол (CoQH2). Поток электронов изменяет окислительно-восстановительное состояние белка, что приводит к конформационному изменению и pK сдвиг ионизируемой боковой цепи, который выкачивает четыре иона водорода из митохондриального матрикса.[8]
Клиническое значение
Снижение экспрессии генов, участвующих в окислительном фосфорилировании, включая NDUFB6, связано с резистентность к инсулину и диабет 2 типа. А полиморфизм в промоторной области гена NDFUB6, что приводит к аденин к гуанин Было показано, что сдвиг на rs629566 создает сайт метилирования ДНК, который связан со снижением экспрессии NDUFB6 в мышцах стареющих пациентов.[12]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000165264 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000071014 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Emahazion T, Beskow A, Gyllensten U, Brookes AJ (ноябрь 1998 г.). "Радиационное гибридное картирование на основе интронов 15 комплексных генов I цепи транспорта электронов человека". Цитогенетика и клеточная генетика. 82 (1–2): 115–9. Дои:10.1159/000015082. PMID 9763677. S2CID 46818955.
- ^ Смейтинк Дж., Лоффен Дж., Смитс Р., Трипельс Р., Руитенбек В., Трайбельс Ф., ван ден Хеувел Л. (август 1998 г.). «Молекулярная характеристика и мутационный анализ субъединицы B17 человека митохондриального комплекса дыхательной цепи I». Генетика человека. 103 (2): 245–50. Дои:10.1007 / s004390050813. PMID 9760212. S2CID 25046670.
- ^ а б c d «Ген Entrez: NDUFB6 NADH дегидрогеназа (убихинон) 1 бета подкомплекс, 6, 17 кДа».
- ^ а б c Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). «Глава 18». Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. С. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7.
- ^ а б Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК 4076475. PMID 23965338.
- ^ а б «Субъединица 6 подкомплекса НАДН дегидрогеназа [убихинон] 1 бета». Атлас кардиоорганических белков (COPaKB).
- ^ Лублье С., Байот А., Рак М., Эль-Хури Р., Бенит П., Растин П. (октябрь 2011 г.). «Субъединица NDUFB6 митохондриального комплекса дыхательной цепи I требуется для активности переноса электронов: доказательство принципиального исследования стабильной и контролируемой интерференции РНК в линиях клеток человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 414 (2): 367–72. Дои:10.1016 / j.bbrc.2011.09.078. PMID 21964293.
- ^ Ling C, Poulsen P, Simonsson S, Rönn T., Holmkvist J, Almgren P, Hagert P, Nilsson E, Mabey AG, Nilsson P, Vaag A, Groop L (ноябрь 2007 г.). «Генетические и эпигенетические факторы связаны с экспрессией компонента дыхательной цепи NDUFB6 в скелетных мышцах человека». Журнал клинических исследований. 117 (11): 3427–35. Дои:10.1172 / JCI30938. ЧВК 2030455. PMID 17948130.
дальнейшее чтение
- Смейтинк Дж., Ван ден Хеувел Л. (июнь 1999 г.). «Митохондриальный комплекс I человека в здоровье и болезни». Американский журнал генетики человека. 64 (6): 1505–10. Дои:10.1086/302432. ЧВК 1377894. PMID 10330338.
- Эрли Ф. Г., Рэган С. И. (ноябрь 1980 г.). «Идентификация субъединиц митохондриальной НАДН-дегидрогеназы сердца крупного рогатого скота, которые подвергаются действию фосфолипидного бислоя путем фотомечения с 5-йодонафт-1-илазидом». Биохимический журнал. 191 (2): 429–36. Дои:10.1042 / bj1910429. ЧВК 1162233. PMID 7236204.
- Лоффен Дж. Л., Трипельс Р. Х., ван ден Хевел Л. П., Шуэльке М., Бускенс К. А., Смитс Р. Дж., Трайбельс Дж. М., Смейтинк Дж. А. (декабрь 1998 г.). "кДНК восьми ядерно-кодируемых субъединиц НАДН: убихинон оксидоредуктаза: характеристика кДНК комплекса I человека завершена". Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 253 (2): 415–22. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9786. PMID 9878551.
- Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Геномные исследования. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК 310934. PMID 11042152.
- Бенит П., Кретьен Д., Кадхом Н., де Лонле-Дебени П., Кормье-Дайр В., Кабрал А., Педенье С., Растин П., Мюнних А., Ретиг А. (июнь 2001 г.). «Крупномасштабные делеции и точечные мутации ядерных генов NDUFV1 и NDUFS1 при дефиците митохондриального комплекса I». Американский журнал генетики человека. 68 (6): 1344–52. Дои:10.1086/320603. ЧВК 1226121. PMID 11349233.
- Фогель Р.О., Дитерен С.Е., ван ден Хеувел Л.П., Виллемс П.Х., Смейтинк Д.А., Купман В.Дж., Нийтманс Л.Г. (март 2007 г.). «Идентификация промежуточных продуктов сборки митохондриального комплекса I путем отслеживания помеченного NDUFS3 демонстрирует точку входа митохондриальных субъединиц». Журнал биологической химии. 282 (10): 7582–90. Дои:10.1074 / jbc.M609410200. PMID 17209039.
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.