WikiDer > НПХП1

NPHP1
НПХП1
Белок NPHP1 PDB 1s1n.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыНПХП1, JBTS4, NPH1, SLSN1, нефроцистин 1
Внешние идентификаторыOMIM: 607100 MGI: 1858233 ГомолоГен: 229 Генные карты: НПХП1
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение NPHP1
Геномное расположение NPHP1
Группа2к13Начните110,122,311 бп[1]
Конец110,205,066 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NPHP1 206285 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001291012
NM_001291013
NM_016902
NM_001355429
NM_001369236

RefSeq (белок)

NP_001277941
NP_001277942
NP_058598
NP_001342358
NP_001356165

Расположение (UCSC)Chr 2: 110.12 - 110.21 МбChr 2: 127,74 - 127,79 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Нефроцистин-1 это белок что у людей кодируется НПХП1 ген.[5]

Функция

Этот ген кодирует белок с паттернами домена 3 гомологии src (SH3). Мутации в этом гене вызывают семейный ювенильный нефронофтиз.[5]

Взаимодействия

NPHP1 был показан взаимодействовать с участием BCAR1,[6][7] PTK2B,[7] Филамин[8] и INVS.[9]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000144061 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027378 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: NPHP1 nephronophthisis 1 (ювенильный)».
  6. ^ Дональдсон Дж. К., Демпси П. Дж., Редди С., Бутон А. Х., Коффи Р. Дж., Хэнкс СК (апрель 2000 г.). «Crk-связанный субстрат p130 (Cas) взаимодействует с нефроцистином, и оба белка локализуются в межклеточных контактах поляризованных эпителиальных клеток». Экспериментальные исследования клеток. 256 (1): 168–78. Дои:10.1006 / exc.2000.4822. PMID 10739664.
  7. ^ а б Бенцинг Т., Герке П., Хёпкер К., Хильдебрандт Ф., Ким Э., Вальц Г. (август 2001 г.). «Нефроцистин взаимодействует с Pyk2, p130 (Cas) и тензином и запускает фосфорилирование Pyk2». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 98 (17): 9784–9. Дои:10.1073 / pnas.171269898. ЧВК 55530. PMID 11493697.
  8. ^ Donaldson JC, Dise RS, Ричи MD, Хэнкс SK (август 2002 г.). «Нефроцистин-консервативные домены, участвующие в нацеливании на эпителиальные межклеточные соединения, взаимодействии с филаминами и установлении клеточной полярности». Журнал биологической химии. 277 (32): 29028–35. Дои:10.1074 / jbc.M111697200. PMID 12006559.
  9. ^ Отто Е.А., Шермер Б., Обара Т., О'Тул Дж. Ф., Хиллер К. С., Мюллер А. М., Руф Р. Г., Хофеле Дж., Бикманн Ф, Ландау Д., Форман Дж. В., Гудшип Дж. А., Страчан Т., Кисперт А., Вольф М. Т., Гагнаду М. Ф., Nivet H, Antignac C, Walz G, Drummond IA, Benzing T., Hildebrandt F (август 2003 г.). «Мутации в INVS, кодирующие инверсин, вызывают нефронофтоз 2 типа, связывая кистозную болезнь почек с функцией первичных ресничек и детерминацией левой-правой оси». Природа Генетика. 34 (4): 413–20. Дои:10,1038 / ng1217. ЧВК 3732175. PMID 12872123.

дальнейшее чтение