WikiDer > Обскурин

Obscurin
OBSCN
Белок OBSCN PDB 1v1c.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыOBSCN, ARHGEF30, UNC89, обскурин, кальмодулин цитоскелета и взаимодействующий с тайтином RhoGEF
Внешние идентификаторыOMIM: 608616 MGI: 2681862 ГомолоГен: 70869 Генные карты: OBSCN
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение OBSCN
Геномное расположение OBSCN
Группа1q42.13Начните228,208,063 бп[1]
Конец228,378,876 бп[1]
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

84033

380698

Ансамбль

ENSG00000154358

ENSMUSG00000061462

UniProt

Q5VST9

A2AAJ9

RefSeq (мРНК)

NM_001098623
NM_001271223
NM_052843

NM_001171512
NM_199152

RefSeq (белок)

NP_001092093
NP_001258152
NP_443075

NP_001164983
NP_954603

Расположение (UCSC)Chr 1: 228.21 - 228.38 МбChr 11: 58.99 - 59.14 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Обскурин это белок что у людей кодируется OBSCN ген.[5][6][7] Обскурин принадлежит к семейству гигантских саркомерный сигнальные белки, которые включают тайтин и небулин. Обскурин выражается в сердечный и скелетная мышца, и играет роль в организации миофибриллы в течение саркомер сборка. Мутация в OBSCN ген был связан с гипертрофическая кардиомиопатия а измененные свойства белка обскурина были связаны с другими мышечными заболеваниями.

Структура

Человеческий обскурин может существовать в виде нескольких варианты стыковки примерно 720 кДа,[8][9][10][11][12] однако на сегодняшний день описан полнометражный характер только одного.[13] Обскурин экспрессируется в сердечных и скелетных мышцах. Ген обскурина занимает более 150 т.п.н., содержит более 80 экзонов.[14] Кодируемый белок содержит 68 Ig домены, 2 домена фибронектина, 1 кальций / кальмодулин-связывающий домен, 1 Домен RhoGEF с ассоциированным Домен PHи 2 домена серин-треонинкиназы.[13] Доминирующее положение обскурина в зрелых миофибриллы находится на саркомерный M-диапазон.[13][15] Титин, обскурин, обскурин-подобный-1 и миомезин образуют тройной комплекс по саркомеру М-диапазоны это важно для саркомер механика.[16]

Функция

Обскурин принадлежит к семейству гигантских саркомерный сигнальные белки, которые включают тайтин и небулин, и может играть роль в организации миофибриллы во время сборки и может опосредовать взаимодействие между саркоплазматический ретикулум и миофибриллы. Обскурин - главный цитоплазматический лиганд за малый анкирин 1 (sANK1), а саркоплазматический ретикулярный белка, и скаффолдинговая функция обскурина, по-видимому, предотвращает деградацию sANK1.[17] Эти данные указывают на то, что обскурин служит сигнальным звеном между саркомерный и саркоплазматический ретикулярный домены,[18][19] Обскурин играет роль в формировании новых саркомеры в течение миофибрилла сборка.[20] в частности, на саркомерной периферии, где расположены сайты инициации и прогрессирования миофибрилогенеза.[21][22] Обскурин, по-видимому, необходим для правильного включения миозин нити в саркомеры и в сборке А-диапазоны.[15][23] Более того, киназные домены обскурина ферментативно активны и, по-видимому, участвуют в регуляции клеточной адгезии.[24]

Клиническое значение

Было показано, что обскурин демонстрирует связанное с заболеванием переключение изоформ у пациентов с дилатационная кардиомиопатия.[25] Мутация обскурина Arg4344Gln был выявлен у пациентов с гипертрофическая кардиомиопатия, что нарушило связывание обскурина с доменами Z9-Z10 тайтин.[26] Мутации нашли ген, кодирующий тайтин у пациентов с мышечная дистрофия конечностей 2J или миопатия Салиха снижают способность тайтин связывать обскурин, предполагая, что это может быть причиной проявления болезни.[27]

Взаимодействия

Обскурин был показан взаимодействовать с Титин,[5][28] в частности, с Novex-3 из Титин, 6.5 кб экзон расположен выше по течению сердечный-специфический N2B экзон.[29] С-концевой участок Обскурина взаимодействует с цитоплазматическим доменом малый анкирин 1[30][31] и с экзоном 43 'области Анкирин Б.[32] Связывает обскурин Ig3 миомезин в линкере между My4 и My5.[27]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000154358 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061462 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Янг П., Элер Э, Готель М. (июль 2001 г.). «Обскурин, гигантский саркомерный белок фактора обмена нуклеотидов гуанина, участвующий в сборке саркомера». Журнал клеточной биологии. 154 (1): 123–36. Дои:10.1083 / jcb.200102110. ЧВК 2196875. PMID 11448995.
  6. ^ Рассел М.В., Рэкер М.О., Корытковски К.А., Соннеман К.Дж. (январь 2002 г.). «Идентификация, тканевая экспрессия и хромосомная локализация человеческого обскурина-КЛЦМ, члена семейств тайтина и Dbl киназ легкой цепи миозина». Ген. 282 (1–2): 237–46. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00795-8. PMID 11814696.
  7. ^ «Ген Entrez: обскурин OBSCN, кальмодулин цитоскелета и взаимодействующий с тайтином RhoGEF».
  8. ^ «Q5VST9».
  9. ^ "Q5VST9-6".
  10. ^ "Q5VST9-2".
  11. ^ "Q5VST9-3".
  12. ^ «Q5VST9-5».
  13. ^ а б c Young P, Ehler E, Gautel M (июль 2001 г.). «Обскурин, гигантский саркомерный белок фактора обмена гуаниновых нуклеотидов, участвующий в сборке саркомера». Журнал клеточной биологии. 154 (1): 123–36. Дои:10.1083 / jcb.200102110. ЧВК 2196875. PMID 11448995.
  14. ^ Фукудзава А., Идову С., Гаутель М. (2005). «Полная структура человеческого гена обскурина: последствия для генерации изоформ путем дифференциального сплайсинга». Журнал исследований мышц и подвижности клеток. 26 (6–8): 427–34. Дои:10.1007 / s10974-005-9025-6. PMID 16625316.
  15. ^ а б Карлссон Л., Ю. Дж., Торнелл Л. Е. (июль 2008 г.). «Новые аспекты обскурина в поперечно-полосатых мышцах человека». Гистохимия и клеточная биология. 130 (1): 91–103. Дои:10.1007 / s00418-008-0413-z. PMID 18350308.
  16. ^ Перниго С., Фукудзава А., Бертц М., Холт М., Риф М., Штайнер Р.А., Готель М. (февраль 2010 г.). «Структурное понимание сборки и механики М-диапазона из комплекса титин-обскурин-подобный-1». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 107 (7): 2908–13. Дои:10.1073 / pnas.0913736107. ЧВК 2814874. PMID 20133654.
  17. ^ Lange S, Perera S, Teh P, Chen J (июль 2012 г.). «Обскурин и KCTD6 регулируют оборот куллин-зависимого малого белка анкирин-1 (sAnk1.5)». Молекулярная биология клетки. 23 (13): 2490–504. Дои:10.1091 / mbc.E12-01-0052. ЧВК 3386213. PMID 22573887.
  18. ^ Bagnato P, Barone V, Giacomello E, Rossi D, Sorrentino V (январь 2003 г.). «Связывание изоформы анкирина-1 с обскурином предполагает молекулярную связь между саркоплазматическим ретикулумом и миофибриллами в поперечно-полосатых мышцах». Журнал клеточной биологии. 160 (2): 245–53. Дои:10.1083 / jcb.200208109. ЧВК 2172649. PMID 12527750.
  19. ^ Контроджианни-Константопулос А., Джонс Э.М., Ван Россум Д. Б., Блох Р. Дж. (Март 2003 г.). «Обскурин - лиганд малого анкирина 1 в скелетных мышцах». Молекулярная биология клетки. 14 (3): 1138–48. Дои:10.1091 / mbc.E02-07-0411. ЧВК 151585. PMID 12631729.
  20. ^ Борисов А.Б., Контроджианни-Константопулос А., Блох Р.Дж., Вестфол М.В., Рассел М.В. (сентябрь 2004 г.). «Динамика локализации обскурина при дифференцировке и ремоделировании сердечных миоцитов: обскурин как интегратор миофибриллярной структуры». Журнал гистохимии и цитохимии. 52 (9): 1117–27. Дои:10.1369 / jhc.3A6183.2004. PMID 15314079.
  21. ^ Борисов А.Б., Раекер М.О., Контржианни-Константопулос А., Ян К., Курнит Д.М., Блох Р.Дж., Рассел М.В. (октябрь 2003 г.). «Быстрый ответ сердечного кластера генов обскурина на стеноз аорты: дифференциальная активация Rho-GEF и MLCK и участие в гипертрофическом росте». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 310 (3): 910–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.09.035. PMID 14550291.
  22. ^ Борисов А.Б., Мартынова М.Г., Рассел М.В. (апрель 2008 г.). «Раннее включение обскурина в формирующиеся саркомеры: значение для сборки миофибрилл во время сердечного миогенеза». Гистохимия и клеточная биология. 129 (4): 463–78. Дои:10.1007 / s00418-008-0378-y. ЧВК 2761667. PMID 18219491.
  23. ^ Борисов А.Б., Саттер С.Б., Контроджианни-Константопулос А., Блох Р.Дж., Вестфаль М.В., Рассел М.В. (март 2006 г.). «Существенная роль обскурина в сердечном миофибриллогенезе и гипертрофическом ответе: данные о подавлении гена, опосредованном малыми интерферирующими РНК» (PDF). Гистохимия и клеточная биология. 125 (3): 227–38. Дои:10.1007 / s00418-005-0069-х. PMID 16205939.
  24. ^ Ху Л.Я., Контроджианни-Константопулос А. (май 2013 г.). «Киназные домены обскурина взаимодействуют с белками межклеточной адгезии». Журнал FASEB. 27 (5): 2001–12. Дои:10.1096 / fj.12-221317. ЧВК 3633816. PMID 23392350.
  25. ^ Макаренко I, Opitz CA, Leake MC, Neagoe C, Кульке М, Гватмей Дж. К., дель Монте Ф., Хаджар Р. Дж., Линке В. А. (октябрь 2004 г.). «Изменения пассивной жесткости, вызванные активацией податливых изоформ тайтина в сердце человека с дилатационной кардиомиопатией». Циркуляционные исследования. 95 (7): 708–16. Дои:10.1161 / 01.RES.0000143901.37063.2f. PMID 15345656.
  26. ^ Аримура Т., Мацумото Ю., Окадзаки О, Хаяси Т., Такахаши М., Инагаки Н., Хинохара К., Ашизава Н., Яно К., Кимура А. (октябрь 2007 г.). «Структурный анализ гена обскурина при гипертрофической кардиомиопатии». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 362 (2): 281–7. Дои:10.1016 / j.bbrc.2007.07.183. PMID 17716621.
  27. ^ а б Fukuzawa A, Lange S, Holt M, Vihola A, Carmignac V, Ferreiro A, Udd B, Gautel M (июнь 2008 г.). «Взаимодействие с тайтином и миомезином нацелено на обскурин и подобный обскурину 1 в M-диапазон: последствия для наследственных миопатий». Журнал клеточной науки. 121 (Pt 11): 1841–51. Дои:10.1242 / jcs.028019. PMID 18477606.
  28. ^ Перниго С., Фукудзава А., Пандини А., Холт М., Кляйнджунг Дж., Гаутель М., Штайнер Р.А. (февраль 2015 г.). «Кристаллическая структура человеческого комплекса тайтин: обскурин демонстрирует консервативный, но специфический мышечный модуль молнии M-диапазона». Журнал молекулярной биологии. 427 (4): 718–36. Дои:10.1016 / j.jmb.2014.11.019. PMID 25490259.
  29. ^ Bang ML, Centner T, Fornoff F, Geach AJ, Gotthardt M, McNabb M, Witt CC, Labeit D, Gregorio CC, Granzier H, Labeit S (ноябрь 2001 г.). «Полная последовательность гена тайтина, экспрессия необычной изоформы тайтина массой около 700 кДа и ее взаимодействие с обскурином определяют новую систему связывания Z-линии с I-полосой». Циркуляционные исследования. 89 (11): 1065–72. Дои:10.1161 / ч2301.100981. PMID 11717165.
  30. ^ Контроджианни-Константопулос А., Джонс Э.М., Ван Россум Д. Б., Блох Р. Дж. (Март 2003 г.). «Обскурин - лиганд малого анкирина 1 в скелетных мышцах». Молекулярная биология клетки. 14 (3): 1138–48. Дои:10.1091 / mbc.E02-07-0411. ЧВК 151585. PMID 12631729.
  31. ^ Басби Б., Оаши Т., Уиллис С.Д., Акерманн М.А., Контроджианни-Константопулос А., Маккерелл А.Д., Блох Р.Дж. (апрель 2011 г.). «Электростатические взаимодействия опосредуют связывание обскурина с малым анкирином 1: исследования биохимического и молекулярного моделирования». Журнал молекулярной биологии. 408 (2): 321–34. Дои:10.1016 / j.jmb.2011.01.053. ЧВК 3367564. PMID 21333652.
  32. ^ Cunha SR, Mohler PJ (ноябрь 2008 г.). «Обскурин нацеливает анкирин-B и протеинфосфатазу 2A на сердечную M-линию». Журнал биологической химии. 283 (46): 31968–80. Дои:10.1074 / jbc.M806050200. ЧВК 2581558. PMID 18782775.

дальнейшее чтение