WikiDer > Остреококк - Википедия

Ostreococcus - Wikipedia

Остреококк
Научная классификация е
Тип:Хлорофита
Учебный класс:Mamiellophyceae
Заказ:Mamiellales
Семья:Батикокковые
Род:Остреококк
C. Courties и M.-J. Кретьенно-Дине (1995)
Разновидность

Остреококк это род одноклеточных кокковидный или сферической формы зеленые водоросли принадлежность к классу Mamiellophyceae. В его состав входят видные представители мирового пикопланктон сообщество, играющее центральную роль в океанических цикл углерода.

История

Первый представитель рода, О. таури, был обнаружен в 1994 году при исследовании пикопланктона в Лагуна Тау Courties и Chretiennot-Dinet с использованием проточной цитометрии.[1] Одноклеточные фотосинтезирующие организмы, как правило, можно изучать с помощью проточной цитометрии из-за автофлуоресценция предоставленный хлорофилл и другие флуорофоры используется клетками для сбора и контроля солнечного света, что позволяет изучать такие пигменты без какого-либо окрашивания клеток. Различные присутствующие пигменты можно различать и идентифицировать для каждой клетки с помощью проточной цитометрии, что позволяет исследователям выявлять различные виды, присутствующие в образце, и помогать классифицировать любые новые обнаруженные виды.[2] О. таури сразу был помещен в класс Prasinophyceae на основе характерных пигментов хлорофилла и Chlorophyceae-связанные с каротиноиды[1] а также ультраструктура клетки, и его положение было позже подтверждено анализом его 18S рДНК.[3] Молекулярно-филогенетический анализ на основе последовательности 18SrDNA привел к определению нового класса, Mamiellophyceae, который содержит Остреококк видов и поместил их в Батикокковые семья.[4] Mamiellophyceae представляют собой одну из наиболее экологически успешных групп эукариотических фотосинтетических пикопланктеров в морской и, вероятно, пресноводной среде. [5] и метабаркодирование [6] опросы выявили присутствие других представителей рода Остреококк во многих океанических регионах. На сегодняшний день описано четыре разных вида: О. таури, О. lucimarinus,[7] О. mediterraneus [8] и O spp. RCC809.[9]

Анатомия

Род содержит самых маленьких известных свободноживущих эукариотический виды, средний размер 0,8 мкм.[1] В ультраструктура клеток этого рода до сих пор характеризовались удивительной простотой, так как были кокковидными клетками, лишенными клеточная стенка и содержащий сингл хлоропласт, один митохондрия, и один Тело Гольджи а также его ядро.[1] Доступна последовательность генома трех представителей этого рода: ядерный геном 13 Mb О. таури RCC4221 опубликовано в 2006 г. [10] и обновлено 2014 г .;[11] О. lucimarinus CCMP2514 [7] и штамм RCC809.[9] Проект метаболические сети из этих двух Остреококк виды были реконструированы из КЕГГ база данных, термодинамически ограниченная, элементарно сбалансированная и функционально оцененная в 2012 году.[12]

Рекомендации

  1. ^ а б c d Courties, C. и другие. (1994). «Самый маленький эукариотический организм» Природа 370: 255
  2. ^ Дэйви, Х. и Келл, Д. (1996) "Проточная цитометрия и сортировка клеток гетерогенных микробных популяций: важность анализа отдельных клеток" Микробиологические обзоры 60 (4): 641-696
  3. ^ Courties, К. и другие. (1998). «Филогенетический анализ и размер генома Остреококк Таури (Chlorophyta, Prasinophyceae) " J. Phycol. 34 (5): 844-849.
  4. ^ Марин Б, Мелконян М. (2010). Молекулярная филогения и классификация класса Mamiellophyceae. ноя (Chlorophyta) на основе сравнения последовательностей оперонов рРНК, кодируемых ядром и пластидом. Протист. 161(2): 304-36. DOI: 10.1016 / j.protis.2009.10.002.
  5. ^ Пигано Г., Моро Х. (2007). Скрининг метагенома Саргассова моря на предмет данных для исследования эволюции генома в Остреококк. Ген. 406: 184-90 DOI: 10.1016 / j.gene.2007.09.015
  6. ^ Демир-Хилтон Э и другие. (2011). Глобальные закономерности распределения отдельных клад фотосинтетических пикоэукариот Остреококк. ISME J. 5(7): 1095-107. DOI: 10.1038 / ismej.2010.209.
  7. ^ а б Крошечный эукариот Остреококк дает геномное понимание парадокса видообразования планктона. Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки 104: 7705–7710. DOI: 10.1073 / pnas.0611046104
  8. ^ Субирана Л. и др. (2013). Морфология, пластичность генома и филогения рода ostreococcus позволяют выявить скрытый вид, O. mediterraneus sp. ноя (Mamiellales, Mamiellophyceae). Протист. 164(5): 643-59. DOI: 10.1016 / j.protis.2013.06.002.
  9. ^ а б http://genome.jgi-psf.org/OstRCC809_2/OstRCC809_2.home.html
  10. ^ Дерелль, Э. и другие. (2006). "Анализ генома мельчайшего свободноживущего эукариота Остреококк Таури раскрывает множество уникальных особенностей » Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки 103: 11647-52.
  11. ^ Blanc-Mathieu R, et al. (2014). Улучшенный геном модельной морской водоросли Остреококк Таури разворачивается путем оценки сборок Illumina de novo. BMC Genomics. 15: 1103. DOI: 10.1186 / 1471-2164-15-1103.
  12. ^ Элиас В. Крумхольц,и другие. (2012). "Полногеномная реконструкция метаболической сети пикодорослей Остреококк" Журнал экспериментальной ботаники 63(6): 2353-2362 .