WikiDer > PPP5C

PPP5C
PPP5C
Белок PPP5C PDB 1a17.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPPP5C, PP5, PPP5, PPT, каталитическая субъединица протеинфосфатазы 5
Внешние идентификаторыOMIM: 600658 MGI: 102666 ГомолоГен: 4550 Генные карты: PPP5C
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение PPP5C
Геномное расположение PPP5C
Группа19q13.32Начинать46,347,087 бп[1]
Конец46,392,981 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PPP5C 201979 s at fs.png

PBB GE PPP5C 215705 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_006247
NM_001204284

NM_011155

RefSeq (белок)

NP_001191213
NP_006238

NP_035285

Расположение (UCSC)Chr 19: 46.35 - 46.39 МбChr 7: 17 - 17,03 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Серин / треонин-протеинфосфатаза 5 является фермент что у людей кодируется PPP5C ген.[5][6]


Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции PPP5C. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Ppp5ctm1a (EUCOMM) Wtsi[16][17] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[18][19][20]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[14][21] Было проведено двадцать пять испытаний мутант мышей и пять значительных аномалий.[14] Гомозиготный самцы-мутанты имели уменьшенную массу тела, длину тела и респираторный коэффициент. У обоих полов увеличилось Т-клетка числа и ряд скелетных аномалий, идентифицированных рентгенография.[14]

Взаимодействия

PPP5C показал себя взаимодействовать с ASK1,[22] CRY2[23] GNA12.[24] и Rac1,[25]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000011485 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000003099 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Yong WH, Ueki K, Chou D., Reeves SA, von Deimling A, Gusella JF, Mohrenweiser HW, Buckler AJ, Louis DN (сентябрь 1995 г.). «Клонирование высококонсервативного гена серин-треонинфосфатазы человека из кандидатной области глиомы на хромосоме 19q13.3». Геномика. 29 (2): 533–6. Дои:10.1006 / geno.1995.9972. PMID 8666404.
  6. ^ «Ген Entrez: протеинфосфатаза 5 PPP5C, каталитическая субъединица».
  7. ^ «Данные о массе тела для Ppp5c». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  8. ^ «Данные дисморфологии для Ppp5c». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  9. ^ «Данные косвенной калориметрии для Ppp5c». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  10. ^ «Данные DEXA для Ppp5c». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  11. ^ «Данные рентгенографии для Ppp5c». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  12. ^ «Данные лимфоцитов периферической крови для Ppp5c». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  13. ^ "Citrobacter данные о заражении Ppp5c ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  14. ^ а б c d Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
  15. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  16. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  17. ^ "Информатика генома мыши".
  18. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
  19. ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
  20. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
  21. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК 3218837. PMID 21722353.
  22. ^ Морита К., Сайто М., Тобиуме К., Мацуура Х., Эномото С., Нишито Х., Итиджо Х. (ноябрь 2001 г.). «Регулирование отрицательной обратной связи ASK1 протеинфосфатазой 5 (PP5) в ответ на окислительный стресс». Журнал EMBO. 20 (21): 6028–36. Дои:10.1093 / emboj / 20.21.6028. ЧВК 125685. PMID 11689443.
  23. ^ Чжао С., Санкар А. (ноябрь 1997 г.). «Человеческий фоторецептор синего света hCRY2 специфически взаимодействует с протеином серин / треонинфосфатазой 5 и модулирует его активность». Фотохимия и фотобиология. 66 (5): 727–31. Дои:10.1111 / j.1751-1097.1997.tb03214.x. PMID 9383998. S2CID 32804361.
  24. ^ Ямагути Ю., Като Х, Мори К., Негиси М. (август 2002 г.). «Galpha (12) и Galpha (13) взаимодействуют с протеинфосфатазой Ser / Thr типа 5 и стимулируют ее фосфатазную активность». Текущая биология. 12 (15): 1353–8. Дои:10.1016 / S0960-9822 (02) 01034-5. PMID 12176367. S2CID 11485795.
  25. ^ Чаттерджи А., Ван Л., Армстронг Д. Л., Росси С. (февраль 2010 г.). «Активированная ГТФаза Rac1 перемещает протеинфосфатазу 5 на клеточную мембрану и стимулирует активность фосфатазы in vitro». Журнал биологической химии. 285 (6): 3872–82. Дои:10.1074 / jbc.M109.088427. ЧВК 2823530. PMID 19948726.

дальнейшее чтение