WikiDer > Сайт связывания праймера

Primer binding site
Сайт связывания праймера ВИЧ (PBS)
RF00375.jpg
Идентификаторы
СимволHIV_PBS
РфамRF00375
Прочие данные
РНК типСнг
Домен (ы)Эукариоты; Вирусы
ТАКТАК: 0000233
PDB структурыPDBe

А сайт связывания праймера это область, край из нуклеотид последовательность где РНК или же ДНК одноцепочечный грунтовка связывает начать репликация. Сайт связывания праймера находится на одном из двух дополнительный пряди двухцепочечного нуклеотид полимерв цепи, которая должна быть скопирована, или находится внутри одноцепочечной нуклеотидной полимерной последовательности.[1]

А ПЦР сайт связывания праймера - это сайт, где полимеразной цепной реакции (ПЦР) грунтовка связывается для первичной дупликации комплемента к существующей последовательности ДНК или РНК.

В ВИЧ сайт связывания праймера представляет собой структурированный Элемент РНК в геномах ретровирусы которому тРНК обязывает инициировать обратная транскрипция. В ВИЧ тРНК - это тРНК (3) (Lys).[2] хотя он может использовать другие тРНК.[3] Состоит из 18 нуклеотиды и следует за U5 регион 5'-длинный терминальный повтор (LTR) ретровируса.[4]

Рекомендации

  1. ^ Берг, Джереми М .; Тимочко, Джон Л. и Страйер, Люберт. (ок. 2002). «Репликация ДНК обеих цепей происходит быстро с определенных стартовых сайтов». Биохимия. Нью-Йорк: W.H. Freeman and Co.
  2. ^ Beerens, N; Groot F; Беркхоут Б (2001). «Инициирование обратной транскрипции ВИЧ-1 регулируется сигналом активации праймера». J Biol Chem. 276 (33): 31, 247–31, 256. Дои:10.1074 / jbc.M102441200. PMID 11384976.
  3. ^ Das, AT; Klaver B; Беркхут Б (1995). «Снижение репликации мутантов вируса иммунодефицита человека типа 1, которые используют праймеры обратной транскрипции, отличные от природной тРНК (3) (Lys)». J Virol. 69 (5): 3, 090–3, 097. ЧВК 189010. PMID 7707537.
  4. ^ Дамгаард К.К., Андерсен Э.С., Кнудсен Б., Городкин Дж., Кьемс Дж. (2004). «Взаимодействие РНК в 5'-области генома ВИЧ-1». Дж Мол Биол. 336 (2): 369–379. Дои:10.1016 / j.jmb.2003.12.010. PMID 14757051.

внешняя ссылка