WikiDer > Pseudomonas chlororaphis
| Pseudomonas chlororaphis | |
|---|---|
Научная классификация  | |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Протеобактерии |
| Учебный класс: | Гаммапротеобактерии |
| Заказ: | Pseudomonadales |
| Семья: | Pseudomonadaceae |
| Род: | Псевдомонады |
| Группа видов: | Pseudomonas chlororaphis группа |
| Разновидность: | P. chlororaphis |
| Биномиальное имя | |
| Pseudomonas chlororaphis (Гиньяр и Соважо, 1894 г.) Bergey, и другие. 1930 | |
| Тип штамма | |
| ATCC 9446 CCUG 552 B | |
| Синонимы | |
Bacillus chlororaphis Гиньяр и Соважо 1894 | |
Pseudomonas chlororaphis это бактерия используется как почвенный модификатор в сельское хозяйство и садоводство. Он может действовать как биоконтроль агент против определенных грибковый патогены растений через производство феназинового типа антибиотики.[1] На базе 16S рРНК Анализ, аналогичные виды были помещены в его группу.[2]
Сравнительное геномное и филогеномное исследование в 2020 году проанализировало 494 полных генома из всех Псевдомонады рода, 43 из которых P. chlororaphis напряжения [3]. В этом исследовании P. chlororaphis вид был определен на основании его монофильности и критерия средней нуклеотидной идентичности. Этот вид находится в более широком P. fluorescens видовой комплекс, определяемый [3][4][5]. Количество белка и содержание GC у штаммов этого вида колеблются между 5599–6401 (среднее: 6076) и 61,9–64% (среднее: 62,8%), соответственно. [3]. Кроме того, 43 P. chlororaphis протеомы содержали 3587 ядерных белков (общих для всех штаммов данного вида), причем 11 ядерных белков были специфичными для этой группы и, следовательно, отсутствовали во всех других штаммах этого вида. Псевдомонады род [3]. Два из этих 11 группоспецифичных ядерных белков представляют собой бактериоцин семейства холина и биосинтетический белок, подобный митомицину, и они могут дать конкурентное преимущество перед другими колонизаторами корней. [3].
В Pseudomonas chlororaphis группа
Pseudomonas chlororaphis дает свое имя подгруппе в пределах рода Псевдомонады. Остальные члены P. chlororaphis подгруппа P. aurantiaca, П. aureofaciens, П. фраги, P. lundensis, и P. taetrolens.[2]
Рекомендации
- ^ Chin-A-Woeng TF, et al. (2000). "Колонизация корней бактерией, продуцирующей феназин-1-карбоксамид. Pseudomonas chlororaphis PCL1391 необходим для биоуправления томатной ножкой и корневой гнилью ». Мол Растительный Микроб Взаимодействовать. 13 (12): 1340–5. Дои:10.1094 / MPMI.2000.13.12.1340. PMID 11106026.
- ^ а б Анзай; Kim, H; Парк, JY; Вакабаяси, H; Ояйдзу, H; и другие. (Июль 2000 г.). «Филогенетическая принадлежность псевдомонад на основе последовательности 16S рРНК». Int J Syst Evol Microbiol. 50 (4): 1563–89. Дои:10.1099/00207713-50-4-1563. PMID 10939664.
- ^ а б c d е Николаидис, Мариос; Мосиалос, Димитрис; Оливер, Стивен Дж .; Амуциас, Григориос Д. (24.07.2020). «Сравнительный анализ основных протеомов среди основных эволюционных групп Pseudomonas показывает видоспецифические адаптации для Pseudomonas aeruginosa и Pseudomonas chlororaphis». Разнообразие. 12 (8): 289. Дои:10.3390 / d12080289. ISSN 1424-2818.
- ^ Мулет, Магдалена; Лалукат, Хорхе; Гарсия-Вальдес, Елена (март 2010 г.). «Анализ последовательностей ДНК видов Pseudomonas». Экологическая микробиология. Дои:10.1111 / j.1462-2920.2010.02181.x.
- ^ Весы, Brittan S .; Диксон, Роберт П .; ЛиПума, Джон Дж .; Хаффнагл, Гэри Б. (октябрь 2014 г.). «Микробиология, геномика и клиническое значение комплекса видов Pseudomonas fluorescens, недооцененного колонизатора человека». Обзоры клинической микробиологии. 27 (4): 927–948. Дои:10.1128 / CMR.00044-14. ISSN 0893-8512. ЧВК 4187640. PMID 25278578.
внешняя ссылка
  | Этот Гаммапротеобактерии-связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |