WikiDer > Интересующий регион

Region of interest
Интересующий регион, для которого Неравенство Маркова дает нижнюю оценку.

А регион интереса (часто сокращенно ROI), являются образцами в набор данных определены для конкретной цели.[1] Концепция ROI обычно используется во многих прикладных областях. Например, в медицинская визуализацияграницы опухоли могут быть определены на изображении или в объеме с целью измерения ее размера. Эндокардиальная граница может быть определена на изображении, возможно, во время различных фаз сердечного цикла, например, в конце систолы и в конце диастолы, с целью оценки сердечной функции. В географические информационные системы (ГИС) ROI можно воспринимать буквально как полигональную выборку на 2D-карте. В компьютерное зрение и оптическое распознавание символов, ROI определяет границы рассматриваемого объекта. Во многих приложениях символьные (текстовые) метки добавляются к ROI для компактного описания ее содержимого. В пределах ROI может лежать индивидуальное точки интереса (POI).

Примеры интересующих регионов

  • 1D набор данных: временной или частотный интервал на форме волны
  • 2D набор данных: границы объекта на изображении
  • Набор 3D-данных: контуры или поверхности, очерчивающие объект (иногда называемые Объем интереса (VOI)) в томе
  • Набор данных 4D: контур объекта в определенный промежуток времени или в течение определенного интервала времени в объеме времени.

ROI - это форма Аннотации, часто связанный с категориальной или количественной информацией (например, такими измерениями, как объем или средняя интенсивность), выраженной в виде текста или в структурированной форме.

Есть три принципиально разных способа кодирования ROI:

  • Являясь неотъемлемой частью набора данных выборки, с уникальным или маскирующим значением, которое может выходить или не выходить за пределы нормального диапазона обычно встречающихся значений и которое маркирует отдельные ячейки данных
  • В качестве отдельной, чисто графической информации, такой как векторные или растровые (растровые) элементы чертежа, возможно, с некоторыми сопутствующими простыми (неструктурированный) текст в формате самих данных
  • Как отдельный структурированный семантический информация (например, закодированная типы значений) с набором пространственный и / или временные координаты

Медицинская визуализация

На левом изображении показана исходная маммограмма до обработки MED-SEG. Изображение справа с помеченной областью интереса (белым) показывает маммограмму после обработки MED-SEG.

Стандарты медицинской визуализации, такие как DICOM предоставляют общие и специфические для приложений механизмы для поддержки различных вариантов использования.

Для изображений DICOM (двух или более измерений):

  • Выгорание графики и текста может происходить в нормальном режиме. пиксель диапазон значений (например, как максимальное значение белого цвета) (не рекомендуется)
  • Растровая (растровая) оверлейная графика и текст могут присутствовать в неиспользуемых старших битах данных пикселей или в отдельном атрибуте (не рекомендуется)
  • Векторная графика может быть закодирована в отдельных атрибутах изображения в виде кривых (не рекомендуется)
  • Неструктурированная векторная графика и текст, а также растровая (растровая) оверлейная графика могут быть закодированы в отдельном объекте в качестве состояния представления, которое ссылается на объект изображения, к которому он должен быть применен.
  • Структурированные данные могут быть закодированы в отдельный объект в виде структурированного отчета в форме дерева пар имя-значение закодированных или текстовых концепций, которые могут быть связаны с производной количественной информацией, могут ссылаться на пространственные и / или временные координаты, которые, в свою очередь, ссылаются на объекты изображения. к которым они относятся
  • Контрольные местоположения могут быть закодированы как реперные знаки в форме пространственных координат со связанной закодированной целью, либо в виде пиксельных координат со ссылкой на определенные изображения, либо в виде координат в именованном относительном к пациенту трехмерном декартовом пространстве
  • Пиксели (возможно, несмежные) можно разделить на сегменты закодированы в объекте сегментации как двоичные или вероятностные значения в растре (для которого не требуется такая же пространственная выборка или экстент, что и у изображений, из которых была получена сегментация); на них обычно ссылаются другие объекты, содержащие структурированный контент (структурированные отчеты)

Для лучевой терапии DICOM:

  • Контуры объектов могут быть определены как наборы структур, либо как пиксельные координаты со ссылкой на определенные изображения, либо как координаты в именованном относительном к пациенту трехмерном декартовом пространстве (они также используются для приложений, не связанных с RT)

Для сигналов DICOM на основе времени:

  • Значения могут быть записаны в форме волны (не рекомендуется)
  • Аннотации могут быть закодированы в отдельный атрибут, можно выбрать несколько временных точек или диапазон временных точек, либо по номеру выборки, либо по указанному времени
  • Структурированные данные могут быть закодированы в отдельный объект в виде структурированного отчета в форме дерева пар имя-значение закодированных или текстовых концепций, которые могут быть связаны с производной количественной информацией, могут ссылаться на временные координаты, которые, в свою очередь, ссылаются на объекты формы сигнала, к которым они применяются.

HL7 Архитектура клинических документов также имеет подмножество механизмов, аналогичных (и предназначенных для совместимости с) DICOM для ссылки на пространственные координаты изображения в качестве наблюдений; это позволяет круг, эллипс, ломаная линия или точка должна быть определена как целочисленные координаты относительно пикселей, относящиеся к внешнему объекту мультимедийного изображения, который может иметь формат потребительского, а не медицинского изображения (например, Гифка, PNG или же JPEG).

Системы анализа документов

В Оптическое распознавание символов (OCR) и Анализ макета документа, области интереса (ROI) иерархически охватывают страницы, текстовые или графические блоки, вплоть до отдельных штриховых изображений, блоков изображений слов и символов. Де-факто стандартом для архивов и библиотек является кортеж {image_file, xml_file}, обычно в форме файла * .tif и сопровождающего его файла * .xml.

Другие 2D приложения

Что касается немедицинских стандартов, в дополнение к чисто графическим языкам разметки (таким как PostScript или же PDF) и векторной графики (например, SVG) и 3D (например, VRML) форматы файлов чертежей, которые широко доступны и не содержат определенной семантики ROI, некоторые стандарты, такие как JPEG 2000 в частности, предоставляют механизмы для маркировки и / или сжатия с разной степенью точности, которые они называют интересующими областями.

Рекомендации

  1. ^ Рон Бринкманн (1999). Искусство и наука цифрового композитинга. Морган Кауфманн. стр.184. ISBN 978-0-12-133960-9.