WikiDer > SFRS4

SFRS4

SRSF4

Идентификаторы

Псевдонимы

SRSF4, SFRS4, SRP75, фактор сплайсинга, богатый серином / аргинином 4, фактор сплайсинга, богатый серином и аргинином 4

Внешние идентификаторы

OMIM: 601940 MGI: 1890577 ГомолоГен: 25624 Генные карты: SRSF4

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 1 (человек)^[1]

Группа	1п35.3	Начните	29,147,743 бп^[1]
Группа	1п35.3	Конец	29,181,900 бп^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Хромосома 4 (мышь)^[2]

Группа	4 \| 4 D2.3	Начните	131,873,617 бп^[2]
Группа	4 \| 4 D2.3	Конец	131,901,706 бп^[2]

Экспрессия РНК шаблон

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• Последовательно-специфическое связывание мРНК • связывание нуклеиновой кислоты • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • связывание нуклеотидов
Сотовый компонент	• ядро клетки • нуклеоплазма • ядерное пятнышко
Биологический процесс	• Сплайсинг РНК посредством реакций переэтерификации • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • прекращение транскрипции РНК-полимеразы II • обработка мРНК • отрицательная регуляция сплайсинга мРНК через сплайсосомы • Обработка 3'-конца мРНК • экспорт мРНК из ядра • Сплайсинг РНК • Экспорт РНК из ядра • ответ на инсулин • регуляция альтернативного сплайсинга мРНК через сплайсосомы • цис-сплайсинг мРНК через сплайсосомы
Источники:Amigo / QuickGO

Ортологи

Виды

Человек

Мышь


6429


57317

Ансамбль


ENSG00000116350


ENSMUSG00000028911


Q08170


Q8VE97

RefSeq (мРНК)


NM_005626


NM_020587

RefSeq (белок)


NP_005617


н / д

Расположение (UCSC)

Chr 1: 29.15 - 29.18 Мб

Chr 4: 131,87 - 131,9 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Фактор сплайсинга, богатый аргинином / серином 4 это белок что у людей кодируется SFRS4 ген.^[5]^[6]

Взаимодействия

SFRS4 было показано взаимодействовать с участием Пинин.^[7]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116350 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000028911 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Захлер AM; Neugebauer KM; Stolk JA; Рот МБ (июль 1993 г.). «Белки SR человека и выделение кДНК, кодирующей SRp75». Mol Cell Biol. 13 (7): 4023–8. Дои:10.1128 / MCB.13.7.4023. ЧВК 359951. PMID 8321209.
^ «Ген Entrez: фактор сплайсинга SFRS4, аргинин / серин-богатый 4».
^ Зимовская, Гражина; Ши Цзя; Мунгуба Густаво; Джексон Мойра R; Алпатов Роман; Симмонс Мэтью Н; Ши Юйцзян; Sugrue Stephen P (ноябрь 2003 г.). «Пинин / DRS / memA взаимодействует с SRp75, SRm300 и SRrp130 в эпителиальных клетках роговицы». Вкладывать деньги. Офтальмол. Vis. Наука. 44 (11): 4715–23. Дои:10.1167 / iovs.03-0240. ISSN 0146-0404. PMID 14578391.

дальнейшее чтение

Захлер AM; Переулок WS; Stolk JA; Рот МБ (1992). «Белки SR: консервативное семейство факторов сплайсинга пре-мРНК». Genes Dev. 6 (5): 837–47. Дои:10.1101 / gad.6.5.837. PMID 1577277.
Ramchatesingh J, Zahler AM, Neugebauer KM, et al. (1995). «Подмножество белков SR активирует сплайсинг альтернативного экзона сердечного тропонина Т путем прямого взаимодействия с экзонным энхансером». Мол. Cell. Биол. 15 (9): 4898–907. Дои:10.1128 / MCB.15.9.4898. ЧВК 230736. PMID 7651409.
Маруяма К; Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Gui JF; Переулок WS; Fu XD (1994). «Серинкиназа регулирует внутриклеточную локализацию факторов сплайсинга в клеточном цикле». Природа. 369 (6482): 678–82. Bibcode:1994Натура.369..678Г. Дои:10.1038 / 369678a0. PMID 8208298.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Чжан WJ; Ву JY (1998). «Sip1, новый белок, содержащий домен RS, необходимый для сплайсинга пре-мРНК». Мол. Cell. Биол. 18 (2): 676–84. Дои:10.1128 / MCB.18.2.676. ЧВК 108778. PMID 9447963.
Blencowe BJ; Issner R; Никерсон JA; Sharp PA (1998). «Коактиватор сплайсинга пре-мРНК». Genes Dev. 12 (7): 996–1009. Дои:10.1101 / gad.12.7.996. ЧВК 316672. PMID 9531537.
Папуцопулу С., Николакаки Э., Чалепакис Г. и др. (1999). «SR протеин-специфическая киназа 1 высоко экспрессируется в семенниках и фосфорилирует протамин 1». Нуклеиновые кислоты Res. 27 (14): 2972–80. Дои:10.1093 / nar / 27.14.2972. ЧВК 148514. PMID 10390541.
Monsalve M, Wu Z, Adelmant G и др. (2000). «Прямое соединение транскрипции и процессинга мРНК через термогенный коактиватор PGC-1». Мол. Ячейка. 6 (2): 307–16. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 00031-9. PMID 10983978.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Мейснер М., Лопато С., Готцманн Дж. И др. (2003). «Протоонкопротеин TLS / FUS связан с ядерным матриксом и образует комплекс с факторами сплайсинга PTB, SRm160 и белками SR». Exp. Cell Res. 283 (2): 184–95. Дои:10.1016 / S0014-4827 (02) 00046-0. PMID 12581738.
Ли Дж., Хокинс И.К., Харви С.Д. и др. (2003). «Регулирование альтернативного сплайсинга с помощью SRrp86 и взаимодействующих с ним белков». Мол. Cell. Биол. 23 (21): 7437–47. Дои:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. ЧВК 207616. PMID 14559993.
Зимовска Г., Ши Дж., Мунгуба Г. и др. (2003). «Пинин / DRS / memA взаимодействует с SRp75, SRm300 и SRrp130 в эпителиальных клетках роговицы». Вкладывать деньги. Офтальмол. Vis. Наука. 44 (11): 4715–23. Дои:10.1167 / iovs.03-0240. PMID 14578391.
де Грааф К., Хекерман П., Спелтен О. и др. (2004). «Характеристика циклина L2, нового циклина с доменом, богатым аргинином / серином: фосфорилирование с помощью DYRK1A и совместная локализация с факторами сплайсинга». J. Biol. Chem. 279 (6): 4612–24. Дои:10.1074 / jbc.M310794200. PMID 14623875.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455.
Барриос-Родилес М., Браун К.Р., Оздамар Б. и др. (2005). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Bibcode:2005Научный ... 307.1621B. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID 15761153.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514.
Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Bibcode:2006Натура.441..315Г. Дои:10.1038 / природа04727. PMID 16710414.

Эта статья о ген на хромосома человека 1 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.