WikiDer > СНОМЕД КТ

Эта статья включает встроенные цитаты, но они не правильно отформатирован. Пожалуйста улучшать эта статья исправляя их. (Сентябрь 2019) (Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения)

СНОМЕД КТ

Разработчики)	SNOMED International

СНОМЕД КТ^{[примечание 1]} или же Клинические условия SNOMED систематически организованный сборник компьютерных медицинские термины предоставление кодов, терминов, синонимов и определений, используемых в клинической документации и отчетах. SNOMED CT считается самой всеобъемлющей многоязычной терминологией в области клинического здравоохранения в мире.^[2][3] Основная цель SNOMED CT - кодировать значения, которые используются в информации о здоровье, и поддерживать эффективную клиническую запись данных с целью улучшения ухода за пациентами. SNOMED CT предоставляет основную общую терминологию для электронные медицинские карты. Комплексное покрытие SNOMED CT включает в себя: клинические данные, симптомы, диагнозы, процедуры, структуры тела, организмы и другие этиологии, вещества, фармацевтические препараты, устройства и образцы.

SNOMED CT поддерживается и распространяется SNOMED International, международной некоммерческой организацией по разработке стандартов, расположенной в Лондоне, Великобритания. SNOMED International - торговое название Международная организация по разработке стандартов терминологии здравоохранения (IHTSDO), созданная в 2007 году.

SNOMED CT обеспечивает последовательный обмен информацией и является основополагающим для функционально совместимой электронной медицинской карты. Он предоставляет единообразные средства для индексации, хранения, извлечения и агрегирования клинических данных по специальностям и местам оказания помощи. Это также помогает в организации содержания электронных систем медицинских карт за счет уменьшения вариативности способов сбора, кодирования и использования данных для клинического ухода за пациентами и исследований.^[4] SNOMED CT можно использовать для прямой записи клинических данных отдельных лиц в электронные карты пациентов. Он также предоставляет пользователю ряд ссылок на схемы оказания клинической помощи, общие планы лечения и другие ресурсы знаний, чтобы облегчить принятие обоснованных решений и поддержать долгосрочное лечение пациентов. Наличие бесплатных инструментов и сервисов автоматического кодирования, которые могут возвращать ранжированный список дескрипторов SNOMED CT для кодирования любого клинического отчета, может помочь специалистам в области здравоохранения ориентироваться в терминологии.

SNOMED CT - это терминология, которая может перекрестно соответствовать другим международным стандартам и классификациям.^[5] Доступны редакции на определенных языках, которые дополняют международную версию и могут содержать языковые переводы, а также дополнительные национальные термины. Например, SNOMED CT-AU, выпущенный в декабре 2009 года в Австралии, основан на международной версии SNOMED CT, но включает слова и идеи, которые клинически и технически уникальны для Австралии.^[6]

История

СНОМАН была основана в 1965 году как Систематизированная номенклатура патологий (SNOP) и в дальнейшем была развита в логическую терминологию здравоохранения.^[1][7]

SNOMED CT была создана в 1999 году путем слияния, расширения и реструктуризации двух крупномасштабных терминологий: Справочная терминология SNOMED (SNOMED RT), разработанная Колледж американских патологов (КОЛПАЧОК); и Версия 3 клинических условий (CTV3) (ранее известная как Чтение кодов), разработанная Национальный центр здоровья Соединенного Королевства (NHS).^[8] Окончательный продукт был выпущен в январе 2002 года.^[9][10]

Исторической сильной стороной SNOMED был охват медицинских специальностей. SNOMED RT с более чем 120 000 концепций был разработан, чтобы служить в качестве общей справочной терминологии для агрегирования и поиска данных о патологии здравоохранения, зарегистрированных несколькими организациями и отдельными лицами. Сильной стороной CTV3 была его терминология для общей практики. CTV3, содержащий 200 000 взаимосвязанных концепций, использовался для хранения структурированной информации о обращениях за первичной медико-санитарной помощью в индивидуальных записях пациентов.^[11] Выпуск SNOMED CT International Edition за январь 2020 года включал более 350 000 концепций.^[12]

В июле 2003 г. Национальная медицинская библиотека (NLM) от имени Министерства здравоохранения и социальных служб США заключила соглашение с Колледжем американских патологов о бесплатном предоставлении SNOMED CT пользователям США через Национальную медицинскую библиотеку. Единая система медицинского языка Метатезавр UMLS. Команду NLM по переговорам возглавил Бетси Хамфрис,^[13] и контракт предоставил NLM бессрочную лицензию на основной SNOMED CT (на испанском и английском языках) и его текущие обновления.^[9][14][15]

В апреле 2007 года права интеллектуальной собственности SNOMED CT были переданы от CAP к Международная организация по разработке стандартов терминологии здравоохранения (IHTSDO), чтобы способствовать международному принятию и использованию SNOMED CT. В настоящее время эта организация работает под названием SNOMED International и отвечает за «текущее обслуживание, разработку, обеспечение качества и распространение SNOMED CT» на международном уровне.^[1][6][10]и его членство состоит из ряда ведущих стран и территорий в области электронного здравоохранения, в том числе: Аргентина, Австралия, Бельгия, Бруней, Канада, Чешская Республика, Чили, Дания, Эстония, Гонконг, Исландия, Индия, Ирландия, Израиль, Литва, Малайзия, Мальта, Нидерланды, Новая Зеландия, Норвегия, Польша, Португалия, Сингапур, Словацкая Республика, Республика Словения, Испания, Швеция, Швейцария, Великобритания, США и Уругвай.^[16]

SNOMED CT - это многонациональная и многоязычная терминология, которая может работать с разными языками и диалектами. SNOMED CT в настоящее время доступен на американском английском, британском английском, испанском, датском и шведском языках, а другие переводы на французский и голландский языки уже ведутся или почти завершены. SNOMED CT перекрестно отображает другие термины, такие как: МКБ-9-СМ, МКБ-10, МКБ-О-3, МКБ-10-АМ, Лаборатория LOINC и OPCS-4. Он поддерживает ANSI, DICOM, HL7, и ISO стандарты.

Структура

SNOMED CT состоит из четырех основных основных компонентов:

1. Коды концепций - числовые коды, которые идентифицируют клинические термины, примитивные или определенные, организованные в иерархии
2. Описания - текстовые описания концептуальных кодов
3. Отношения - отношения между концептуальными кодами, имеющими родственное значение
4. Справочные наборы - используется для группировки Концепций или Описаний в наборы, включая справочные наборы и перекрестные карты с другими классификациями и стандартами.^[17]

SNOMED CT «Концепции» - это репрезентативные единицы, которые классифицируют все вещи, которые характеризуют процессы здравоохранения и которые должны быть записаны в них. В 2011 году в SNOMED CT было включено более 311 000 концепций, однозначно идентифицируемых по идентификатору концепта, например понятие 22298006 относится к Инфаркт миокарда. Все концепции SNOMED CT организованы в ациклические таксономические (is-a) иерархии; Например, Вирусная пневмония ЭТО Инфекционная пневмония ЭТО Пневмония ЭТО Заболевание легких. У концептов может быть несколько родителей, например Инфекционная пневмония также ребенок из Инфекционное заболевание. Таксономическая структура позволяет записывать данные, а затем получать к ним доступ на разных уровнях агрегирования. Концепции NOMED CT связаны примерно 1 360 000 ссылок, называемых отношения.^[18]

Концепции далее описываются различными клиническими терминами или фразами, называемыми описаниями, которые делятся на Полностью определенные имена (FSN), Предпочтительные условия (ПТ) и Синонимы. У каждой концепции есть ровно один FSN, который уникален для всех SNOMED CT. Кроме того, он имеет ровно один ПК, который группа клиницистов сочла наиболее распространенным способом выражения значения концепции. Может иметь от нуля до многих синонимов. Синонимы - это дополнительные термины и фразы, используемые для обозначения этого понятия. Они не обязательно должны быть уникальными или однозначными.

Формальная модель, лежащая в основе SNOMED CT

Статистика SNOMED CT (по состоянию на ноябрь 2016 г.). SD означает достаточно определенный.

SNOMED CT можно охарактеризовать как многоязычный тезаурус с онтологический фундамент. Тезаурусоподобные признаки представляют собой концептуально-термические отношения, такие как синонимичные описания «Острый ринит», «Острый носовой катар», «Острый ринит», «Простуда» (а также испанские «resfrío común» и «rinitis influencciosa») для концепт 82272006.

Под онтологический тщательного изучения, SNOMED-CT - это иерархия классов (с обширным перекрытием классов в отличие от типичных статистических классификаций, таких как ICD). Это означает, что концепция SNOMED CT 82272006 определяет класс всех отдельных случаев заболевания, которые соответствуют критериям "обычной простуды" (например, у одного пациента может быть " «насморк», отмеченный в их записи, а у другого может быть «острый ринит»; оба могут быть обнаружены как экземпляры «простуды»). Отношение суперкласса (Is-A) связывает классы с точки зрения включения их членов. То есть все индивидуальные «холодовые процессы» также включены во все суперклассы класса «Простуда», такие как вирусная инфекция верхних дыхательных путей (рисунок).

Простуда как примитивная концепция в SNOMED CT

Относительные утверждения SNOMED CT по сути являются триплетами формы Concept₁ - Отношение_Икс - Концепция₂, с отношением_Икс принадлежат к небольшому количеству типов отношений (называемых концепциями связи), например поиск сайта, из-заи т. д. Интерпретация этих троек (неявно) основана на семантике простого Описание логики (DL). Например, тройка Простуда – возбудитель – Вирус, соответствует выражению первого порядка

forall x: instance-of (x, Простуда) -> существует y: instance-of (y, Вирус) и возбудитель (у, х)

или более интуитивное выражение DL

Простуда subClassOf возбудитель немного Вирус

в Простуда Например, описание концепции является «примитивным», что означает, что даны необходимые критерии, которые должны соблюдаться для каждого случая, но не достаточны для классификации расстройства как экземпляра Простуда . Напротив, пример Вирусная инфекция верхних дыхательных путей изображает полностью описанную концепцию, которая представлена ​​в логике описания следующим образом:

Вирусная инфекция верхних дыхательных путей как определенная концепция в SNOMED CT

 Вирусная инфекция верхних дыхательных путей эквивалентИнфекция верхних дыхательных путей и Вирусная респираторная инфекция иВозбудитель немного Вирус иПоиск-сайт немного Строение верхних дыхательных путей иПатологический процесс немного Инфекционный процесс

Это означает, что каждое отдельное заболевание, для которого выполняются все критерии определения, можно классифицировать как случай вирусной инфекции верхних дыхательных путей.

Описание логики

По состоянию на 2011 год контент SNOMED CT ограничивается подмножеством EL ++ формализм, ограничившись следующими операторами:

• Вверху, внизу
• Примитивные роли и концепции с заявленными родителями для каждого
• Определение понятия и соединение, но НЕ дизъюнкция или отрицание
• Иерархия ролей, но не состав ролей
• Ограничения домена и диапазона
• Экзистенциальное, но не универсальное ограничение
• Ограниченная форма аксиомы ролевого включения (xRy ^ ySz => xRz)
• В ближайшем будущем логика будет расширена за счет включения аксиом включения общих понятий.

Для понимания моделирования также важно взглянуть на заявленное представление концепции в сравнении с предполагаемым представлением концепции. При дальнейшем рассмотрении представления о состоянии, SNOMED CT использовал в прошлом подход к моделированию, называемый подходом «ближайшего родителя». После 2015 года был принят более совершенный подход под названием «проксимальный примитивный родитель».

Предварительная координация и посткоординация

SNOMED CT обеспечивает композиционный синтаксис^[19] которые можно использовать для создания выражений, которые представляют клинические идеи, которые явно не представлены концепциями SNOMED CT.

Например, не существует четкого понятия «ожог третьей степени указательного пальца левой руки, вызванный горячей водой». Однако, используя композиционный синтаксис, его можно представить как

284196006 | ожог кожи | : 116676008 | ассоциированная морфология | = 80247002 | ожоговая травма третьей степени | , 272741003 | латеральность | = 7771000 | слева | , 246075003 | возбудитель | = 47448006 | горячая вода | , 363698007 | поиск сайта | = 83738005 | структура указательного пальца

Такие выражения называются «посткоординированными». Посткоординация позволяет избежать необходимости создавать большое количество определенных концепций в SNOMED CT. Однако многие системы допускают только предварительно скоординированные представления. Надежный анализ и сравнение посткоординированных выражений возможны с использованием соответствующего механизма алгоритмов для эффективной обработки выражения с учетом лежащей в основе логики описания.

Крупные электронные системы медицинской документации (EHRS) неоднократно жаловались в IHTSDO и другие организации по стандартизации на «сложность» посткоординированных выражений.

Например, приведенное выше посткоординированное выражение может быть преобразовано с использованием набора стандартных правил в следующее «выражение нормальной формы», которое позволяет проводить сравнение с аналогичными концепциями.

64572001 | болезнь | : 246075003 | возбудитель | = 47448006 | горячая вода | , 363698007 | поиск сайта | = (83738005 | структура указательного пальца |: 272741003 | латеральность | = 7771000 | левый |), {116676008 | ассоциированная морфология | = 80247002 | ожоговая травма третьей степени | , 363698007 | поиск сайта | = 39937001 | структура кожи | }

Ветеринарное содержание

Международное издание SNOMED CT включает только человеческие термины. В 2014 году явно ветеринарные концепции были перенесены в ветеринарное отделение SNOMED CT. Это расширение находится под управлением Лаборатории ветеринарных терминологических служб.^[20] в колледже ветеринарной медицины штата Вирджиния.

Известные недостатки и стратегии их устранения

Эта секция может быть слишком техническим для большинства читателей, чтобы понять. Пожалуйста помогите улучшить это к сделать понятным для неспециалистов, не снимая технических деталей. (Июнь 2019) (Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения)

Ранние версии SNOMED имели фасетную структуру, упорядоченную по семантическим осям, что требовало кодирования более сложных ситуаций путем координации различных кодов. У этого было два основных недостатка. С одной стороны, необходимость пост-координации воспринималась как недружелюбное к пользователю препятствие, что, безусловно, способствовало довольно низкому принятию ранних версий SNOMED. С другой стороны, было трудно получить единообразное кодирование. Например.,Острый аппендицит может быть пост-координирован тремя разными способами^[21] без средств для вычисления семантических эквивалентностей. NOMED RT решил эту проблему, введя формулу логики описания. С добавлением CTV3 большое количество концепций было переопределено с использованием формальных выражений. Однако слияние с CTV3, как исторически сложившейся терминологией со многими близкими к пользовательским описаниям, создало некоторые проблемы, которые все еще влияют на SNOMED CT. В дополнение к запутанной таксономической сети многих иерархических уровней с массивным множественным наследованием (например, существует 36 таксономических предков для Острый аппендицит), многие неоднозначные, контекстно-зависимые концепции нашли свое отражение в SNOMED CT. Предварительная координация иногда доводилась до крайности, поэтому существует, например, 350 различных концепций ожогов на голове.

Еще одно явление, которое характерно для частей SNOMED CT, - это так называемое эпистемическое вторжение.^[22]В принципе, задача терминологии (и даже онтология) должен быть ограничен предоставлением контекстных значений терминов или классов. В идеале контекстуализация этих репрезентативных единиц должна быть задачей информационной модели.^[23]Человеческий язык здесь вводит в заблуждение, поскольку мы используем синтаксически похожие выражения для представления категориально различных сущностей, например Внематочная беременность против. Подозреваемая беременность. Первый относится к настоящей беременности, второй - к кусочку (неуверенно) Информация. В SNOMED CT большинство (но не все) из этих контекстно-зависимых концепций сосредоточены в субиерахии Ситуация с явным контекстом. Основная причина, по которой нельзя обойтись без таких концепций, заключается в том, что SNOMED CT во многих случаях берет на себя функции информационных моделей, поскольку последние не существуют в данной реализации.

С созданием IHTSDO SNOMED CT стал более доступным для более широкой аудитории. Критика состояния терминологии была вызвана многочисленными существенными недостатками, а также отсутствием мер по обеспечению качества.^[24] С самого начала IHTSDO открыто относилось к такой (тоже академической) критике. За последние несколько лет был достигнут значительный прогресс в области обеспечения качества и инструментов.

Потребность в более принципиальном онтологический фундамент был постепенно принят, так же как и лучшее понимание семантики логики описания. Приоритеты реорганизации были сформулированы в отношении наблюдаемых,^[25] расстройства, находки,^[26] вещества, организмы и т. д. Рекомендации по переводу^[27] были разработаны, а также руководящие принципы для запросов на представление контента и стратегия включения предварительно скоординированного контента. Все еще существуют известные недостатки в отношении "онтологическая приверженность"СНОМЕД КТ,^[28] например, разъяснение того, какой тип объекта является экземпляром данной концепции SNOMED CT. Этот же термин можно интерпретировать как расстройство или пациента с расстройством, например Опухоль может обозначать процесс или кусок ткани; Аллергия может обозначать аллергическую реакцию или просто аллергическое предрасположение. Более поздней стратегией является использование строго типизированного верхнего уровня онтологии для устранения неоднозначности содержания SNOMED CT.

Растущее использование SNOMED CT для исследования приложений, которые ежедневно используются во всем мире для поддержки ухода за пациентами, ведет к более широкому вовлечению сообщества. Это привело к увеличению ресурсов, выделяемых на создание терминов SNOMED CT, а также к расширению сотрудничества для превращения SNOMED CT в надежный отраслевой стандарт. Это ведет к увеличению количества программных инструментов и разработке материалов, которые вносят вклад в базу знаний для поддержки внедрения. Также развивается ряд онлайн-сообществ, которые сосредоточены на отдельных аспектах SNOMED CT и его реализации.

Теоретически логические рассуждения описания могут применяться к любому новому кандидату посткоординированных выражений, чтобы оценить, является ли он родительским или предком, дочерним или другим потомком, или семантически эквивалентным любому существующему понятию из существующего предварительно скоординированного концепции. Тем не менее, частично как продолжающиеся последствия слияния с CTV3, SNOMED все еще содержит неоткрытые семантически повторяющиеся примитивы и определенные концепции. Кроме того, многие концепции остаются примитивными, в то время как их семантика также может быть законно определена в терминах других примитивов и ролей, одновременно присутствующих в системе. Из-за этих упущений и фактического или возможного дублирования семантического содержания реальная производительность алгоритмов для вывода о включении или семантической эквивалентности будет непредсказуемо несовершенной.

Проверка SNOMED CT

Использование последовательных правил важно для качества SNOMED CT. С этой целью в 2009 году команда SNOMED CT создала прототип машиночитаемой концептуальной модели (MRCM). В ходе дальнейшей работы эта модель пересматривается, чтобы использовать ограничения выражения SNOMED CT.

СНОМЕД КТ и ИКД

SNOMED CT - это клиническая терминология, предназначенная для сбора и представления данных о пациентах в клинических целях.^[29] В Международная статистическая классификация болезней и проблем, связанных со здоровьем (ICD) используется во всем мире медицинская классификация система; который используется для присвоения диагностических и, в некоторых национальных модификациях, процедурных кодов с целью получения закодированных данных для статистического анализа, эпидемиологии, компенсации и распределения ресурсов.^[30] Обе системы используют стандартизированные определения и образуют общий медицинский язык, используемый в системах электронных медицинских карт (EHR).^[31] SNOMED CT позволяет вводить информацию в систему EHR во время лечения пациентов, в то время как ICD облегчает поиск или вывод информации для вторичных данных.^[31][32]

SNOMED CT и LOINC

LOINC это терминология, содержащая лабораторные тесты. С 2017 года компания SNOMED International начала создавать термины для компонентов LOINC и создала набор выражений SNOMED CT, которые отражают значение многих терминов LOINC.

Использовать

SNOMED CT используется по-разному, некоторые из них:

• Он фиксирует клиническую информацию на уровне детализации, необходимом для оказания медицинской помощи.
• Благодаря обмену данными это может снизить потребность в повторении истории болезни при каждой новой встрече с медицинским работником.
• Информация может быть записана разными людьми в разных местах и ​​объединена в простые информационные представления в истории болезни пациента.
• Использование общей терминологии снижает вероятность различного толкования информации.
• Электронная запись обычным способом снижает количество ошибок и может помочь обеспечить полноту записи всех соответствующих данных.
• Стандартизированная информация упрощает анализ, поддерживая качество и экономичность практики, исследований и будущих клинических руководств.
• Клиническая терминология позволяет поставщику медицинских услуг идентифицировать пациентов на основе определенной закодированной информации и более эффективно управлять скринингом, лечением и последующим наблюдением.

Сценарии использования

Более конкретно, следующие примеры компьютерных приложений используют SNOMED CT:

• Электронные системы медицинской документации
• Компьютеризированный ввод заказа поставщика CPOE например, электронное рецепт или запись в лабораторию
• Каталоги клинических услуг; например, для процедур диагностической визуализации
• Базы знаний, используемые в системы поддержки принятия клинических решений (CDSS)
• Удаленный мониторинг отделения интенсивной терапии
• Лабораторная отчетность
• Схема отделения неотложной помощи
• Отчетность о раке
• Генетические базы данных

Доступ

SNOMED CT поддерживается и распространяется SNOMED International, международной некоммерческой организацией по разработке стандартов, расположенной в Лондоне, Великобритания.

Для использования SNOMED CT в производственных системах требуется лицензия. Есть два типа лицензий:

1. Членство страны / территории в SNOMED International (взимается согласно валовой национальный продукт).
2. Партнерская лицензия (зависит от количества конечных пользователей). НРС (наименее развитые страны) могут использовать SNOMED CT бесплатно.

Для научных исследований в области медицинской информатики, в целях демонстрации или оценки источники SNOMED CT можно бесплатно загрузить и использовать. Исходные источники SNOMED CT в табличной форме доступны зарегистрированным пользователям Единая система медицинского языка (UMLS), подписавшие соглашение. Доступны многочисленные онлайн и офлайн браузеры.

Тем, кто желает получить лицензию на его использование и загрузить SNOMED CT, следует связаться со своим Национальным центром выпуска, ссылки на который приведены на веб-сайте IHTSDO.

Подмножества без лицензии

Чтобы облегчить внедрение SNOMED CT и использование SNOMED CT в других стандартах, существуют не требующие лицензии подмножества. Например, набор из 7 314 кодов и описаний бесплатен для использования пользователями DICOM-совместимое программное обеспечение (без ограничений для стран-членов IHTSDO).^[33]

Подмножество глобального набора пациентов (GPS)

GPS был выпущен в сентябре 2019 года и содержит 21 782 концепции.^[34]

Концепции верхнего уровня

Концепции SNOMED CT обычно относятся к единой иерархии (за исключением комбинированных концепций лекарство-устройство). Некоторые иерархии имеют определенную концептуальную модель (например, клинические данные). Для других доменов (например, Организм, Вещество, Значение квалификатора) концептуальная модель еще не определена.

Мероприятие

По состоянию на 2016 год для иерархии событий не определена концептуальная модель. В 2006 году некоторые концепции из иерархии «Клинические данные» были перемещены в иерархию событий. Эти концепции сохранили некоторые из своих атрибутов. (например, возбудитель)

Наблюдаемые объекты

SNOMED International работает над созданием концептуальной модели для наблюдаемых сущностей.^[35]

Фармацевтический / биологический продукт

Пример фармацевтического продукта

Фармацевтические и биологические продукты моделируются с использованием конструкции, состоящей из активного ингредиента, силы презентации и основы силы. С 2018 года гармонизация содержания препаратов SNOMED CT с IDMP Стандарт - это редакционная цель. Присутствуют следующие типы сущностей:

Лекарственный препарат

Термин более высокого уровня, объединяющий препараты. Например, 398731002 | Продукт, содержащий сульфаметоксазол и триметоприм (лекарственный препарат) |

Клинический препарат

Понятие, которое представляет конкретный лекарственный продукт, используемый в клинической практике. Например, 317335000 | Продукт, содержащий именно эзомепразол 20 мг / 1 таблетка для приема внутрь с обычным высвобождением (клинический препарат) |

Форма дозы

Концепция, представляющая способ доставки продукта. Например, 385219001 | Обычный выпуск раствор для инъекций (лекарственная форма) |,

Смотрите также

• CDISC
• Система классификации клинической помощи
• ДОКЛ
• EN 13606
• MEDCIN
• MedDRA
• Омаха Система

Примечания

Викиданные имеет свойство: Идентификатор SNOMED CT (P5806) (видеть использует)

Рекомендации

внешняя ссылка

• Международный сайт SNOMED
• Онлайн-браузеры SNOMED International для SNOMED CT
• Национальная медицинская библиотека США SNOMED CT ресурсы
• Ресурсы NHS Digital SNOMED CT
• Ветеринарное расширение SNOMED CT