WikiDer > SRGAP2C
SLIT-ROBO Rho GTPase, активирующий белок 2C это белок у людей, который кодируется SRGAP2C ген.[3]
Ген коркового развития Slit-Robo Rho GTPase-активирующий белок 2 (SRGAP2) была высококонсервативной на протяжении эволюции млекопитающих, и человеческая линия является единственной линией, в которой произошли дупликации генов (трижды). Промотор и первые девять экзонов SRGAP2 дублированы из 1q23.1 (SRGAP2A) до 1q21.1 (SRGAP2B) ∼3,4 миллиона лет назад (млн лет назад). Две более крупные дупликации позже скопировали SRGAP2B в хромосому 1p12 (SRGAP2C) и в проксимальную часть 1q21.1 (SRGAP2D) ∼2.4 и ∼1 млн лет соответственно. Наследственная SRGAP2A и производная копия SRGAP2C фиксируются в диплоидной копии номер два. Напротив, SRGAP2B и SRGAP2D являются полиморфными с высоким числом копий, с идентифицированными нормальными людьми, у которых полностью отсутствуют эти паралогоскопии. SRGAP2C является наиболее вероятным дубликатом для кодирования функционального белка и одним из наиболее фиксированных генов-дубликатов, специфичных для человека. Неполная дупликация привела к созданию новой функции гена - противодействию родительской функции SRGAP2 сразу же «при рождении» 2–3 млн лет назад, что соответствует времени перехода от Австралопитек к Гомо и начало неокортекс расширение.[4][5]
SRGAP2C экспрессируется в головном мозге человека и димеризуется с предковым SRGAP2, противодействуя ему. В неокортексе мышей SRGAP2 способствует созреванию позвоночника и ограничивает его плотность. SRGAP2C фенокопирует дефицит SRGAP2 и лежит в основе устойчивой радиальной миграции и приводит к появлению специфических для человека особенностей, включая неотению во время созревания шипов и повышенную плотность более длинных шипов. Похоже, что SRGAP2C в конечном итоге взял на себя антагонистическую функцию дубликата SRGAP2B, что свидетельствует о псевдогенизации у современных людей. Маловероятно, что SRGAP2B и SRGAP2D теперь функционируют, поскольку SRGAP2B имеет значительно сниженную экспрессию в человеческом мозге по сравнению с SRGAP2C, а транскрипты, продуцируемые SRGAP2D, не имеют двух внутренних экзонов, что приводит к преждевременному завершению кодона.[4][6]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000171943 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ген Entrez: SLIT-ROBO Rho GTPase, активирующий белок 2C».
- ^ а б Charrier C, Joshi K, Coutinho-Budd J, Kim JE, Lambert N, de Marchena J, Jin WL, Vanderhaeghen P, Ghosh A, Sassa T, Polleux F (май 2012 г.). «Ингибирование функции SRGAP2 его паралогами, специфичными для человека, вызывает неотению во время созревания позвоночника». Клетка. 149 (4): 923–35. Дои:10.1016 / j.cell.2012.03.034. ЧВК 3357949. PMID 22559944.
- ^ Sporny, M; Guez-Haddad, J; Kreusch, A; Шакарци, С; Незнанский, А; Крест, А; Исупов, М.Н. Qualmann, B; Кессельс, ММ; Опатовский Ю. (1 июня 2017 г.). «Структурная история человеческих белков SRGAP2». Молекулярная биология и эволюция. 34 (6): 1463–1478. Дои:10.1093 / molbev / msx094. ЧВК 5435084. PMID 28333212.
- ^ Dennis MY, Nuttle X, Sudmant PH, Antonacci F, Graves TA, Nefedov M, Rosenfeld JA, Sajjadian S, Malig M, Kotkiewicz H, Curry CJ, Shafer S, Shaffer LG, de Jong PJ, Wilson RK, Eichler EE (май 2012). «Эволюция человеческих специфических нейральных генов SRGAP2 путем неполной сегментарной дупликации». Клетка. 149 (4): 912–22. Дои:10.1016 / j.cell.2012.03.033. ЧВК 3365555. PMID 22559943.